| 摘要 | 第1-13页 |
| ABSTRACT | 第13-17页 |
| 第一章 文献综述 | 第17-27页 |
| ·植物反转录转座子研究概述 | 第17-22页 |
| ·反转录转座子类型和结构 | 第17-19页 |
| ·反转录转座子转座机制及活性 | 第19-20页 |
| ·植物反转录转座子特性 | 第20-21页 |
| ·反转录转座子与果树芽变 | 第21-22页 |
| ·植物反转录转座子应用 | 第22-26页 |
| ·基于反转录转座子的分子标记及其应用 | 第22-25页 |
| ·植物反转录转座子在功能基因组学中的应用 | 第25-26页 |
| ·本研究的目的意义 | 第26-27页 |
| 第二章 苹果TY1-COPIA反转录转座子LTR序列分离方法 | 第27-53页 |
| ·材料与方法 | 第27-42页 |
| ·植物材料 | 第27页 |
| ·总DNA的提取及检测 | 第27-28页 |
| ·反转录转座子RT序列的分离 | 第28页 |
| ·基于改进SiteFinding-PCR染色体步移分离Tyl-copia反转录转座子LTR序列 | 第28-32页 |
| ·基于加接头巢式PCR染色体步移分离Tyl-copia反转录转座子LTR序列 | 第32-36页 |
| ·加接头半巢式简并PCR分离Tyl-copia反转录转座子LTR序列 | 第36-39页 |
| ·特异PCR分离Tyl-copia反转录转座子LTR序列 | 第39-40页 |
| ·PCR产物检测、回收和克隆 | 第40-42页 |
| ·序列测定和分析 | 第42页 |
| ·结果与分析 | 第42-50页 |
| ·苹果基因组总DNA提取和质量检测 | 第42-43页 |
| ·Tyl-copia组反转录转座子RT基因克隆 | 第43页 |
| ·改进SiteFinding-PCR分离Tyl-copia反转录转座子LTR序列 | 第43-45页 |
| ·加接头巢式PCR分离Tyl-copia反转录转座子LTR序列 | 第45-49页 |
| ·加接头半巢式简并PCR分离Tyl-copia反转录转座子LTR序列 | 第49页 |
| ·特异PCR分离Tyl-copia反转录转座子LTR序列 | 第49-50页 |
| ·讨论 | 第50-52页 |
| ·苹果Tyl-copia组反转录转座子LTR序列克隆方法 | 第50-51页 |
| ·加接头巢式PCR关键技术 | 第51-52页 |
| ·小结 | 第52-53页 |
| 第三章 苹果基因组TY1-COPIA反转录转座子全长分离及序列分析 | 第53-75页 |
| ·材料与方法 | 第53-56页 |
| ·植物材料 | 第53页 |
| ·序列分离及分析 | 第53-56页 |
| ·结果与分析 | 第56-72页 |
| ·苹果Tyl-copia反转录转座子全长分离 | 第56-59页 |
| ·苹果Tyl-copia反转录转座子同源性与基因结构 | 第59-61页 |
| ·苹果Tyl-copia反转录转座子特征序列 | 第61-63页 |
| ·苹果Tyl-copia反转录转座子不同区域同源性比对及亲缘关系 | 第63-67页 |
| ·苹果Tyl-copia反转录转座子调控元件 | 第67-72页 |
| ·讨论 | 第72-74页 |
| ·从苹果基因组中获得Tyl-copia组反转录转座子全长序列 | 第72页 |
| ·苹果Tyl-copia组反转录转座子5'端LTR区域调控元件 | 第72-73页 |
| ·分离的LTR反转录转座子亚组归属 | 第73页 |
| ·关于反转录转座子LTR区域的精确定位 | 第73-74页 |
| ·小结 | 第74-75页 |
| 第四章 苹果S-SAP分子标记体系建立及其应用 | 第75-103页 |
| ·材料与方法 | 第75-81页 |
| ·植物材料 | 第75-77页 |
| ·接头及引物 | 第77-78页 |
| ·总DNA提取及浓度调节 | 第78页 |
| ·DNA的酶切与连接 | 第78-79页 |
| ·PCR扩增 | 第79页 |
| ·变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离差异片段 | 第79-81页 |
| ·谱带统计及数据分析 | 第81页 |
| ·结果与分析 | 第81-99页 |
| ·苹果S-SAP分析技术体系建立 | 第81-85页 |
| ·苹果S-SAP分析引物筛选 | 第85-92页 |
| ·苹果芽变无性系S-SAP分子标记分析 | 第92-99页 |
| ·讨论 | 第99-101页 |
| ·苹果S-SAP技术体系的建立及优化策略 | 第99-101页 |
| ·苹果芽变无性系S-SAP分析多态性机制 | 第101页 |
| ·小结 | 第101-103页 |
| 第五章 结论及创新点 | 第103-105页 |
| ·结论 | 第103页 |
| ·创新点 | 第103-104页 |
| ·下一步研究思路 | 第104-105页 |
| 参考文献 | 第105-115页 |
| 附录 | 第115-121页 |
| 致谢 | 第121-122页 |
| 攻读学位论文期间发表文章 | 第122页 |
