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全基因组表达分析不同耐旱性水稻根系对不同强度干旱胁迫反应研究

摘要第1-11页
Abstract第11-14页
第一章 前言第14-23页
   ·文献综述第14-21页
     ·伤害机理第14页
     ·干旱逆境对植物根系影响第14页
     ·干旱逆境对植物根系形态指标影响的研究第14-15页
     ·干旱逆境对植物根系生理指标影响的研究第15-16页
     ·干旱胁迫下根系QTL研究进展第16页
     ·植物转抗旱相关基因的研究第16-18页
     ·抗逆相关的转录因子及双组分系统基因第18-21页
       ·转录因子的分类和生物学功能第19-20页
       ·应用转录因子提高植物抗旱性第20-21页
     ·基因芯片在干旱胁迫研究中的应用第21页
   ·研究目的和意义第21-23页
第二章 不同强度干旱胁迫时不同品种水稻根系耐旱性分析第23-42页
   ·材料和方法第23-27页
     ·供试材料第23页
     ·材料培养第23页
     ·干旱模拟处理第23页
     ·形态指标测定第23页
     ·生理指标测定第23-27页
       ·SOD测定方法第23-24页
       ·POD测定方法第24-25页
       ·MDA测定方法第25页
       ·质膜相对透性测定方法第25-26页
       ·Pro测定方法第26-27页
   ·结果分析第27-39页
     ·不同强度干旱胁迫下不同品种根系形态指标比较第27-33页
       ·不同强度干旱2品种根系形态指标多重比较第27-29页
       ·不同强度干旱逆境对2品种幼苗根体积的影响第29-30页
       ·不同强度干旱逆境对2品种幼苗根粗的影响第30-31页
       ·不同强度干旱逆境对2品种幼苗最长根长的影响第31页
       ·不同强度干旱逆境对2品种幼苗根总长度的影响第31-32页
       ·不同强度干旱逆境对2品种幼苗侧根长度的影响第32-33页
       ·不同强度干旱逆境对2品种幼苗根系数量的影响第33页
       ·小结第33页
     ·不同干旱胁迫对不同品种根系生理的影响第33-39页
       ·不同强度干旱胁迫下不同品种根系生理指标多重比较第33-34页
       ·不同强度干旱逆境对2品种幼苗根系 SOD的影响第34-35页
       ·不同强度干旱逆境对2品种幼苗根系活力的影响第35-36页
       ·不同强度干旱逆境对2品种幼苗根系 MDA的影响第36页
       ·不同强度干旱逆境对2品种幼苗根系 Pro的影响第36-37页
       ·不同强度干旱逆境对2品种幼苗根质膜相对透性的影响第37-38页
       ·不同强度干旱逆境对2品种幼苗根系 POD的影响第38页
       ·不同强度干旱逆境对2品种幼苗根系 CAT的影响第38-39页
       ·小结第39页
   ·讨论第39-42页
第三章 不同干旱强度胁迫水稻根系基因芯片结果第42-54页
   ·材料与方法第42-47页
     ·根系培养与处理第42页
     ·根系RNA的提取第42页
     ·根系RNA的提取方法第42页
     ·RNA电泳检测第42-44页
     ·cDNA的合成和纯化第44-46页
       ·1stcDNA的合成第44页
       ·2ndcDNA的合成第44-45页
       ·IVT合成cRNA第45页
       ·纯化cRNA第45页
       ·cRNA的定量和检测第45-46页
     ·cDNA片段化、配制杂交液第46-47页
       ·片段化cRNA第46页
       ·配制杂交液第46-47页
     ·芯片杂交第47页
       ·预杂交芯片第47页
       ·杂交液的准备第47页
       ·杂交芯片第47页
     ·洗脱芯片第47页
     ·扫描芯片第47页
     ·数据分析第47页
   ·结果分析第47-54页
     ·根系 RNA提取质量第47-48页
     ·cDNA的合成质量第48页
     ·水稻芯片检测的质量判断第48-51页
       ·基因芯片系统重演性分析第48-49页
       ·水稻芯片检测的质量判断第49-51页
     ·芯片检测结果第51-54页
第四章 基因芯片数据分析第54-114页
   ·不同强度干旱胁迫基因2种水稻表达模式第54-58页
     ·不同干旱处理2品种差异基因选择阈值第54-55页
     ·差异基因的倍数变化第55-58页
     ·差异基因表达模式及数量第58页
   ·差异基因的功能分析第58-66页
     ·差异基因的 BLAST分析第58-59页
     ·差异基因的功能分析第59-66页
   ·不同干旱胁迫下爱华5号根系响应第66-82页
     ·不同干旱胁迫下爱华5号根系响应的基因数量第66-68页
     ·不同干旱处理下爱华5号根系基因表达方式和不同处理的特异响应基因第68页
     ·不同干旱处理下爱华5号根系基因差异 GO分析第68-73页
     ·不同干旱处理下爱华5号根系响应的重叠基因第73-77页
     ·不同干旱处理下爱华5号根系响应的重叠基因的功能分析第77-79页
     ·不同干旱处理下爱华5号根系响应基因染色体定位第79-82页
   ·不同干旱胁迫下湘丰早119根系响应第82-103页
     ·不同干旱胁迫下湘丰早119根系响应的基因数量第82-83页
     ·不同干旱处理湘丰早119根系基因表达方式和不同处理的特异响应基因第83-91页
     ·不同干旱处理湘丰早119根系基因差异的 GO分析第91-97页
     ·不同干旱处理湘丰早119根系响应的重叠基因第97-101页
     ·不同干旱处理湘丰早119根系响应基因染色体定位第101-103页
   ·PEG处理可能的毒害作用第103-104页
   ·讨论第104-114页
     ·干旱胁迫诱导的基因表达数目第104页
     ·不同干旱强度处理之间相近程度比较第104-105页
     ·爱华5号可能的干旱响应途径第105-109页
       ·爱华5号 T1、T2干旱处理下的可能的响应途径第105-107页
       ·爱华5号 T3干旱处理下的可能的响应途径第107-109页
     ·湘丰早119可能的干旱响应途径第109-111页
       ·湘丰早119T1、T2干旱处理下的可能的响应途径第109-110页
       ·湘丰早119T3干旱处理下的可能的响应途径第110-111页
     ·湘丰早119与爱华5号在不同强度干旱胁迫下的可能的响应途径的差异第111-112页
     ·PEG渗透胁迫可能产生的毒害作用第112-114页
第五章 干旱胁迫下的转录因子分析第114-129页
   ·干旱胁迫时爱华5号转录因子变化第115-117页
   ·干旱胁迫时湘丰早119转录因子变化第117-120页
   ·不同干旱胁迫时湘丰早119和爱华5号转录因子比较分析第120-126页
     ·不同品种水稻对干旱胁迫响应的品种特异转录因子第120-122页
     ·干旱胁迫逆境下2品种重叠的转录因子及家族第122-123页
     ·2品种干旱胁迫响应转录因子基因在染色体上的分布第123-125页
     ·2品种在所有干旱处理下的重叠转录因子第125-126页
   ·讨论第126-129页
第六章 利用 Realtime-PCR验证基因芯片数据第129-134页
   ·材料和方法第129-130页
     ·根系培养与处理第129页
     ·根系RNA的提取第129页
     ·Realtime-PCR第129-130页
     ·基因表达差异的分析方法第130页
   ·结果分析第130-133页
     ·Realtime-PCR的可靠性分析第130页
     ·湘丰早119 Realtime-PCR分析结果第130-132页
     ·爱华5号 Realtime-PCR分析结果第132-133页
   ·讨论第133-134页
第七章 利用 Realtime-PCR分析13个基因不同处理时间变化第134-146页
   ·实时 PCR的准确性和重演性分析第135-136页
   ·13个基因干旱胁迫时的表达变化第136-144页
     ·爱华5号和湘丰早119根系基因干旱胁迫时的表达变化第136-138页
     ·酸性内切几丁质酶基因的表达变化第138-139页
     ·核内小 RNA Z274基因的表达变化第139-140页
     ·抗坏血酸过氧化物酶4基因的表达变化第140-141页
     ·甲酸四氢叶酸连接酶基因的表达变化第141-143页
     ·木聚糖酶抑制子蛋白1前体基因的表达变化第143-144页
   ·讨论第144-146页
第八章 关于论文实验的一些思考第146-147页
   ·PEG模拟干旱与田间干旱的拟合度第146页
   ·芯片结果的进一步解读第146页
   ·处理时间范围进一步扩大第146-147页
第九章 结论第147-149页
参考文献第149-161页
致谢第161页

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