| 摘要 | 第1-14页 |
| Abstract | 第14-17页 |
| 缩略词 | 第17-19页 |
| 第一章 文献综述 | 第19-34页 |
| ·植物DNA甲基化的建立和去甲基化 | 第19-22页 |
| ·植物中5-甲基胞嘧啶的分布 | 第19-20页 |
| ·植物中5-甲基胞嘧啶的含量 | 第20页 |
| ·植物DNA甲基化作用方式 | 第20-21页 |
| ·DNA去甲基化现象 | 第21-22页 |
| ·植物DNA甲基化的功能 | 第22-25页 |
| ·维持植物正常的生长发育 | 第22页 |
| ·调节基因表达 | 第22-23页 |
| ·维持基因组稳定性 | 第23-24页 |
| ·DNA甲基化与植物春化作用 | 第24页 |
| ·DNA甲基化与杂种优势 | 第24-25页 |
| ·DNA甲基化与体细胞无性系变异 | 第25页 |
| ·DNA甲基化的研究方法 | 第25-27页 |
| ·MSAP | 第26页 |
| ·高效液相色谱法 | 第26页 |
| ·亚硫酸盐测序 | 第26-27页 |
| ·甲基化敏感的限制性内切酶结合Southern杂交分析法 | 第27页 |
| ·植物DNA甲基转移酶及与甲基化有关的蛋白 | 第27-32页 |
| ·MET1家族 | 第28-29页 |
| ·CMT家族 | 第29-30页 |
| ·DRM家族 | 第30-31页 |
| ·DDM1 | 第31-32页 |
| ·本研究的目的意义 | 第32-34页 |
| 第二章 草莓和苹果DNA甲基转移酶基因片段的分离 | 第34-45页 |
| ·材料与方法 | 第34-38页 |
| ·植物材料 | 第34页 |
| ·草莓和苹果基因组DNA的提取及检测 | 第34-35页 |
| ·引物设计 | 第35页 |
| ·PCR反应 | 第35-36页 |
| ·PCR特异DNA片段的回收 | 第36页 |
| ·PCR产物克隆、测序 | 第36-38页 |
| ·序列比对与分析 | 第38页 |
| ·结果与分析 | 第38-43页 |
| ·草莓和苹果基因组DNA的质量和完整性检测 | 第38-39页 |
| ·草莓和苹果DNA甲基转移酶基因片段分离 | 第39页 |
| ·MET1基因和DRM基因特异片段序列分析 | 第39-43页 |
| ·讨论 | 第43-44页 |
| ·克隆DNA片段的检测 | 第43-44页 |
| ·DNA甲基转移酶基因的进化 | 第44页 |
| ·小结 | 第44-45页 |
| 第三章 草莓DNA甲基转移酶基因全序列的分离 | 第45-75页 |
| ·材料与方法 | 第45-62页 |
| ·植物材料 | 第45页 |
| ·草莓基因组DNA和RNA的制备 | 第45-46页 |
| ·引物设计 | 第46页 |
| ·基因全长的获得 | 第46-50页 |
| ·完整cDNA的获得 | 第50-58页 |
| ·PCR特异DNA片段的回收 | 第58页 |
| ·PCR产物克隆测序 | 第58页 |
| ·序列比对与分析 | 第58页 |
| ·Southern blot | 第58-62页 |
| ·结果与分析 | 第62-71页 |
| ·草莓 DNA甲基转移酶基因全序列的获得 | 第62-64页 |
| ·草莓 DNA甲基转移酶基因cDNA全序列的获得 | 第64-66页 |
| ·草莓 DNA甲基转移酶基因拷贝数 | 第66-67页 |
| ·DNA甲基转移酶基因序列分析 | 第67-70页 |
| ·草莓 DNA甲基转移酶基因的内含子及选择性剪接 | 第70-71页 |
| ·讨论 | 第71-74页 |
| ·DNA甲基转移酶基因的分离方法 | 第71-72页 |
| ·DNA甲基转移酶基因序列特性 | 第72-74页 |
| ·小结 | 第74-75页 |
| 第四章 草莓 DNA甲基转移酶基因表达分析 | 第75-85页 |
| ·材料与方法 | 第75-79页 |
| ·植物材料 | 第75-76页 |
| ·总核酸和总 RNA提取 | 第76页 |
| ·病毒检测 | 第76-77页 |
| ·实时定量 PCR | 第77-79页 |
| ·结果与分析 | 第79-82页 |
| ·病毒对草莓DNA甲基转移酶基因表达的影响 | 第79-81页 |
| ·微繁殖对草莓DNA甲基转移酶基因表达的影响 | 第81-82页 |
| ·讨论 | 第82-84页 |
| ·实时定量PCR偏差的克服方法 | 第82-83页 |
| ·组培诱导的表观遗传变异及与DNA甲基化的关系 | 第83页 |
| ·病毒对DNA甲基转移酶基因表达的影响 | 第83-84页 |
| ·简化的草莓病毒检测体系的优点 | 第84页 |
| ·小结 | 第84-85页 |
| 第五章 DNA甲基转移酶基因在二倍体与四倍体苹果中表达分析 | 第85-93页 |
| ·材料与方法 | 第85-86页 |
| ·植物材料 | 第85页 |
| ·基因组RNA提取和质量、纯度检测 | 第85页 |
| ·半定量RT-PCR | 第85-86页 |
| ·结果与分析 | 第86-91页 |
| ·半定量RT-PCR体系建立 | 第86-88页 |
| ·DNA甲基转移酶基因在‘寒富’苹果二倍体与四倍体中的表达差异 | 第88-91页 |
| ·讨论 | 第91-92页 |
| ·苹果DNA甲基转移酶基因及其表达差异 | 第91页 |
| ·半定量RT-PCR技术要点 | 第91-92页 |
| ·小结 | 第92-93页 |
| 第六章 草莓FaMET1和FaDRM启动子的分离鉴定 | 第93-102页 |
| ·材料与方法 | 第93-97页 |
| ·植物材料 | 第93页 |
| ·基因组DNA提取和质量、纯度检测 | 第93页 |
| ·启动子特异片段扩增 | 第93-94页 |
| ·PCR特异DNA片段的回收 | 第94页 |
| ·PCR产物克隆测序 | 第94页 |
| ·序列分析 | 第94页 |
| ·启动子表达载体的构建 | 第94-96页 |
| ·农杆菌感受态细胞的制备、转化、阳性克隆的筛选 | 第96-97页 |
| ·农杆菌侵染草莓果实及GUS活性检测 | 第97页 |
| ·结果与分析 | 第97-100页 |
| ·草莓DNA甲基转移酶基因启动子特异片段克隆和序列分析 | 第97-98页 |
| ·GUS融合基因的构建 | 第98-99页 |
| ·草莓DNA甲基转移酶基因启动子活性分析 | 第99-100页 |
| ·讨论 | 第100-101页 |
| ·GUS报告基因的优缺点 | 第100-101页 |
| ·草莓DNA甲基转移酶基因转录活性 | 第101页 |
| ·小结 | 第101-102页 |
| 第七章 结论与创新点 | 第102-104页 |
| ·结论 | 第102页 |
| ·创新点 | 第102-103页 |
| ·下一步研究设想 | 第103-104页 |
| 参考文献 | 第104-117页 |
| 附录 | 第117-123页 |
| 致谢 | 第123-124页 |
| 攻读博士期间发表论文 | 第124页 |
