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肿瘤抑制蛋白p53DNA结合结构域与靶基因相互作用的研究

摘要第1-5页
Abstract第5-8页
目录第8-13页
缩略语表第13-14页
第一章 绪论第14-34页
 第一节 研究背景第14-31页
   ·肿瘤抑制因子p53第14页
   ·p53蛋白的结构第14-20页
     ·p53的N端区第15-16页
     ·p53的核心区第16-19页
     ·p53的羧端区第19-20页
   ·p53的功能第20-24页
     ·细胞周期控制第20-22页
     ·细胞凋亡第22-23页
     ·抑制血管生成第23页
     ·DNA修复第23-24页
   ·p53的靶基因第24-26页
     ·p53的表达第24-25页
     ·p53的选择性转录调节第25-26页
   ·p53的突变第26-27页
     ·p53突变的类型第26-27页
     ·突变型p53的"功能缺失"(Loss of function)与"功能获得"(Gain of function)第27页
     ·突变型p53的半衰期第27页
   ·p53基因家族第27-30页
   ·p53基因与肿瘤基因治疗第30-31页
 第二节 研究目的、意义和内容第31-33页
   ·研究目的、意义第31-32页
   ·主要研究内容第32-33页
 第三节 本论文的结构安排第33-34页
第二章 p53DBD基因克隆、蛋白表达与纯化第34-69页
 第一节 p53DBD基因克隆与表达载体构建第35-54页
   ·材料与方法第35-47页
     ·菌株与质粒第35页
     ·酶和生化试剂第35页
     ·主要仪器第35-36页
     ·基本试剂配置第36-38页
     ·PCR引物第38页
     ·实验方法第38-47页
   ·结果与讨论第47-54页
     ·人外周血淋巴细胞总RNA的提取第47-48页
     ·总RNA的RT-PCR第48-49页
     ·p53DNA结合结构域(p53DBD)的克隆第49-50页
     ·克隆与序列测定第50-52页
     ·修改开放阅读框第52-53页
     ·讨论第53-54页
 第二节 p53DBD蛋白的表达与纯化第54-67页
   ·材料与方法第54-61页
     ·菌株与质粒第54页
     ·酶和生化试剂第54页
     ·主要仪器第54页
     ·基本试剂配置第54-57页
     ·实验方法第57-61页
   ·结果与讨论第61-67页
     ·蛋白表达条件的优化第61-65页
     ·蛋白纯化第65-67页
     ·讨论第67页
 第三节 本章小结第67-69页
第三章 荧光光谱法研究金属离子与p53DBD的相互作用第69-82页
 第一节 引言第69-72页
   ·荧光光谱法第69-71页
   ·研究意义第71-72页
 第二节 材料与方法第72-74页
   ·主要化学试剂第72-73页
   ·主要仪器第73页
   ·p53DBD蛋白的制备第73页
   ·实验方法第73-74页
     ·荧光滴定第73页
     ·圆二色谱研究第73页
     ·ANS结合研究第73-74页
 第三节 结果与讨论第74-80页
   ·p53DBD蛋白的内源荧光性质第74-75页
   ·金属离子与肿瘤抑制蛋白p53DBD的结合第75-79页
   ·p53DBD二级结构的变化第79页
   ·p53DBD蛋白表面疏水性研究第79-80页
 第四节 本章小结第80-82页
第四章 镁离子对p53DBD蛋白与靶基因结合的影响第82-95页
 第一节 引言第82-84页
   ·研究方法第82-83页
   ·研究意义第83-84页
 第二节 材料和方法第84-87页
   ·主要试剂第84页
   ·主要仪器第84-85页
   ·p53DBD靶基因第85页
     ·p53DBD靶基因序列第85页
     ·退火第85页
   ·p53DBD蛋白的制备第85页
   ·实验方法第85-87页
     ·荧光滴定第86页
     ·圆二色谱研究第86页
     ·电泳迁移分析第86-87页
     ·Zeta电势(Zeta Potential)测量第87页
 第三节 结果与讨论第87-94页
   ·离子竞争性结合分析第87-88页
   ·圆二色谱分析第88-89页
   ·镁离子对p53DBD蛋白与靶基因结合的影响第89-93页
   ·探讨镁离子作用机制第93-94页
 第四节 本章小结第94-95页
第五章 金属离子对p53DBD蛋白结构稳定性的影响第95-105页
 第一节 引言第95-96页
   ·研究方法第95页
   ·研究意义第95-96页
 第二节 材料和方法第96-98页
   ·主要试剂第96页
   ·主要仪器第96页
   ·p53DBD蛋白的制备第96页
   ·实验方法第96-98页
     ·解折叠平衡实验第96-97页
     ·差示扫描热量(DSC)测量第97页
     ·ANS结合测量第97页
     ·丙烯酰胺滴定分析第97-98页
 第三节 结果与讨论第98-104页
   ·GdmHCl诱导的p53DBD蛋白解折叠平衡第98-100页
   ·金属离子对p53DBD蛋白变性温度Tm的影响第100页
   ·尿素诱导p53DBD变性过程中蛋白疏水性变化第100-101页
   ·尿素诱导变性过程中金属离子结合引起p53DBD蛋白的结构变化第101-103页
   ·讨论第103-104页
 第四节 本章小结第104-105页
第六章 p53DBD与其靶基因相互作用的FRET研究第105-117页
 第一节 引言第105-111页
   ·FRET相关原理及计算方法第105-110页
     ·荧光共振能量转移(fluorescence resonance energy transfer,FRET)第105-106页
     ·FRET常用供受体对第106-107页
     ·FRET实验仪器第107-108页
     ·FRET的计算第108-109页
     ·静态荧光技术和时间分辨荧光技术第109-110页
   ·研究意义第110-111页
 第二节 材料和方法第111-112页
   ·p53DBD蛋白的制备第111页
   ·荧光标记的靶基因的合成第111-112页
     ·合成单链荧光标记靶DNA第111页
     ·退火第111-112页
   ·时间分辨的荧光寿命测量第112页
     ·主要仪器装置第112页
     ·测试样品制备第112页
     ·测量参数设置第112页
 第三节 结果与讨论第112-116页
   ·荧光寿命衰减曲线及其拟合第112-114页
   ·数据处理第114-115页
     ·靶基因DNA末端之间距离第114页
     ·靶基因DNA弯曲角度第114-115页
   ·讨论第115-116页
 第四节 本章小结第116-117页
第七章 结论与展望第117-122页
 第一节 主要结论第117-118页
 第二节 展望第118-122页
   ·金属离子对p53DBD作用的晶体研究第119-120页
   ·p53DBD与靶基因相互作用的单分子力学研究第120-122页
参考文献第122-131页
致谢第131-132页
个人简历第132-133页
在学期间发表的学术论文与研究成果第133页

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