| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-25页 |
| 第一节 非编码RNA基因在遗传信息表达和调控中具有重要作用 | 第10-12页 |
| 第二节 长非编码RNA具有多种重要的生物功能 | 第12-17页 |
| 1.2.1 lncRNA能在多种层次上调节基因的表达 | 第12-14页 |
| 1.2.2 lncRNA在疾病的发生发展过程中起重要作用 | 第14-16页 |
| 1.2.3 lncRNA在基因组上的分布模式多样 | 第16-17页 |
| 第三节 非编码MicroRNA基因是重要的基因调节因子 | 第17-20页 |
| 1.3.1 miRNA基因的特点 | 第17-18页 |
| 1.3.2 miRNA基因的起源及进化 | 第18-20页 |
| 1.3.3 miRNA基因在人类基因组上的分布模式 | 第20页 |
| 第四节 ncRNA基因的进化与生物复杂性密切相关 | 第20-25页 |
| 1.4.1 lncRNA基因的进化与生物复杂性 | 第22-23页 |
| 1.4.2 miRNA基因的进化与生物复杂性 | 第23-25页 |
| 第二章 lncRNA基因基因组分布模式研究及其在癌症分型中的作用 | 第25-71页 |
| 第一节 与编码基因重叠的lncRNA基因的进化和表达 | 第25-62页 |
| 2.1.1 研究背景及目的 | 第25-27页 |
| 2.1.2 材料与方法 | 第27-30页 |
| 2.1.3 结果展示 | 第30-58页 |
| 2.1.3.1 lncRNA-coding gene pair有益于基因在进化中被保留 | 第30-35页 |
| 2.1.3.2 lncRNA-coding gene pair重叠构象的偏好性 | 第35-39页 |
| 2.1.3.3 lncRNA-coding gene pair对选择性剪接的影响 | 第39-42页 |
| 2.1.3.4 lncRNA-coding gene pair的表达特征 | 第42-48页 |
| 2.1.3.5 lncRNA-coding gene pair的表达相关性及其与癌症发生发展的关联性 | 第48-58页 |
| 2.1.4 讨论 | 第58-62页 |
| 第二节 基于lncRNA和 mRNA基因的表达谱对食管鳞癌进行分型 | 第62-69页 |
| 2.2.1 研究背景 | 第62-64页 |
| 2.2.2 研究策略与结果展示 | 第64-68页 |
| 2.2.2.1 利用差异表达的lncRNA和 mRNA基因对食管鳞癌进行分型 | 第64-65页 |
| 2.2.2.2 食管鳞癌亚型的特点 | 第65-67页 |
| 2.2.2.3 食管鳞癌亚型中差异表达的基因具有不同的功能偏好 | 第67-68页 |
| 2.2.3 讨论 | 第68-69页 |
| 第三节 小结 | 第69-71页 |
| 第三章 人类多拷贝miRNA基因的演化分析 | 第71-107页 |
| 3.1 研究背景及目的 | 第71-72页 |
| 3.2 研究策略及方法 | 第72-77页 |
| 3.3 结果展示 | 第77-103页 |
| 3.3.1 根据多拷贝形成机制对miRNA进行分组 | 第77-81页 |
| 3.3.2 不同形成类型的多拷贝miRNA基因经历不同的进化历程 | 第81-90页 |
| 3.3.3 多拷贝miRNA对的组织表达特征 | 第90-103页 |
| 3.4 讨论 | 第103-105页 |
| 3.5 小结 | 第105-107页 |
| 第四章 结论与展望 | 第107-109页 |
| 参考文献 | 第109-120页 |
| 附录 | 第120-122页 |
| 致谢 | 第122-123页 |
| 学术论文和科研成果目录 | 第123-125页 |
