| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 简写对照 | 第11-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-22页 |
| 1 目标性状综述 | 第12-15页 |
| 1.1 猪的行为学及饲料利用效率在养猪生产中的重要地位 | 第12-13页 |
| 1.2 发情行为及研究进展简述 | 第13页 |
| 1.3 采食行为及研究进展简述 | 第13-14页 |
| 1.4 饲料利用率及研究进展简述 | 第14-15页 |
| 2 表型测定 | 第15-16页 |
| 2.1 发情行为的测定 | 第15页 |
| 2.2 猪采食行为与饲料利用率的测定 | 第15-16页 |
| 3 分析方法简述 | 第16-20页 |
| 3.1 行为学研究方法 | 第16页 |
| 3.2 全基因组关联分析的研究与应用 | 第16-19页 |
| 3.2.1 基因组测序技术简述 | 第16-17页 |
| 3.2.2 基于60K芯片的全基因组关联分析简述 | 第17-18页 |
| 3.2.3 基于Imputation技术的全基因组关联分析 | 第18-19页 |
| 3.3 分子育种技术简述 | 第19-20页 |
| 3.3.1 标记辅助选择技术的发展与应用 | 第19页 |
| 3.3.2 全基因组选择技术的发展与应用 | 第19-20页 |
| 4 本研究的目的与意义 | 第20-22页 |
| 第二章 家猪繁殖障碍基因组全序列关联分析研究 | 第22-33页 |
| 1 引言 | 第22-23页 |
| 2 材料与方法 | 第23-26页 |
| 2.1 研究群体构建和表型测定 | 第23页 |
| 2.2 DNA提取 | 第23-24页 |
| 2.3 基因型检测与数据质控 | 第24-25页 |
| 2.3.1 基因型检测 | 第24页 |
| 2.3.2 基因型数据质控 | 第24-25页 |
| 2.4 Imputation分析及准确性评估 | 第25页 |
| 2.5 全基因组序列关联分析 | 第25-26页 |
| 2.6 连锁不平衡分析和候选基因搜寻 | 第26页 |
| 3 结果与讨论 | 第26-32页 |
| 3.1 研究群体和表型描述 | 第26页 |
| 3.2 Imputation及准确性评估 | 第26-28页 |
| 3.3 全基因组序列关联分析 | 第28-29页 |
| 3.4 连锁不平衡分析和候选基因搜寻 | 第29页 |
| 3.5 讨论 | 第29-32页 |
| 4 小结 | 第32-33页 |
| 第三章 使用电子自动饲喂系统进行多品种猪采食的行为学研究 | 第33-45页 |
| 1 引言 | 第33页 |
| 2 材料与方法 | 第33-35页 |
| 2.1 研究群体与饲养条件 | 第34页 |
| 2.2 方法与模型 | 第34-35页 |
| 2.2.1 数据的质控 | 第34-35页 |
| 2.2.2 分析模型 | 第35页 |
| 3 结果与讨论 | 第35-44页 |
| 3.1 采食数据及表型统计 | 第35-36页 |
| 3.2 生长性能分析 | 第36-37页 |
| 3.3 采食行为的时间节律 | 第37-41页 |
| 3.4 不同品种的有效采食时间 | 第41-42页 |
| 3.5 季节对采食行为的影响 | 第42-43页 |
| 3.6 讨论 | 第43-44页 |
| 4 小结 | 第44-45页 |
| 第四章 饲料转化效率全基因组关联分析和全基因组选择技术研究 | 第45-61页 |
| 1 引言 | 第45-46页 |
| 2 材料与方法 | 第46-51页 |
| 2.1 研究群体与表型 | 第46页 |
| 2.2 基因型检测与质控 | 第46-47页 |
| 2.3 参考群体的构建和Imputation分析 | 第47-48页 |
| 2.4 遗传标记间的连锁不平衡分析及标记密度分析 | 第48页 |
| 2.5 主成分分析和IBS分析 | 第48页 |
| 2.6 基于基因型的遗传参数估计 | 第48-49页 |
| 2.7 饲料转化效率的全基因组关联分析 | 第49页 |
| 2.8 饲料转化效率的全基因组选择研究 | 第49-50页 |
| 2.9 全基因组预测的准确性评估 | 第50-51页 |
| 3 结果与讨论 | 第51-60页 |
| 3.1 结果 | 第51-58页 |
| 3.1.1 表型 | 第51-52页 |
| 3.1.2 基因型 | 第52页 |
| 3.1.3 全基因组范围内的连锁不平衡分析 | 第52-54页 |
| 3.1.4 群体结构分析与遗传参数估计 | 第54页 |
| 3.1.5 饲料转化效率的全基因组关联分析结果 | 第54-55页 |
| 3.1.6 饲料转化效率的全基因组选择的研究结果 | 第55-58页 |
| 3.2 讨论 | 第58-60页 |
| 4 小结 | 第60-61页 |
| 第五章 全文总结与展望 | 第61-63页 |
| 参考文献 | 第63-73页 |
| 附录 | 第73-122页 |
| 博士期间论文发表情况 | 第122-123页 |
| 致谢 | 第123页 |
