| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 英文缩略词表 | 第10-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-19页 |
| 1.1 前言 | 第11页 |
| 1.2 奶牛乳腺炎抗性选择研究进展 | 第11-13页 |
| 1.2.1 奶牛乳腺炎致病因素 | 第11-12页 |
| 1.2.2 奶牛乳腺免疫及防御机制 | 第12-13页 |
| 1.2.3 奶牛乳腺炎抗性性状的挑选 | 第13页 |
| 1.3 金黄色葡萄球菌型奶牛乳腺炎研究进展 | 第13-14页 |
| 1.4 基因芯片技术在奶牛上应用研究进展 | 第14-16页 |
| 1.4.1 基因芯片技术简介 | 第14页 |
| 1.4.2 基因芯片技术研究现状 | 第14-15页 |
| 1.4.3 基因芯片技术在奶牛上的应用 | 第15页 |
| 1.4.4 基因芯片技术研究前景 | 第15-16页 |
| 1.5 荧光定量PCR技术在奶牛上的研究进展 | 第16-18页 |
| 1.5.1 荧光定量PCR技术简介 | 第16页 |
| 1.5.2 荧光定量PCR的分类及方法 | 第16-17页 |
| 1.5.3 荧光定量PCR技术在奶牛乳腺炎中的应用 | 第17-18页 |
| 1.6 研究目的与意义 | 第18-19页 |
| 第二章 材料与方法 | 第19-30页 |
| 2.1 材料 | 第19页 |
| 2.1.1 实验动物 | 第19页 |
| 2.1.2 菌种 | 第19页 |
| 2.1.3 奶样 | 第19页 |
| 2.1.4 组织样 | 第19页 |
| 2.2 主要试剂及仪器设备 | 第19-22页 |
| 2.2.1 主要试剂及配制方法 | 第19-21页 |
| 2.2.2 主要仪器设备 | 第21-22页 |
| 2.3 差异表达基因的生物信息学分析 | 第22页 |
| 2.3.1 主要生物学数据库 | 第22页 |
| 2.3.2 主要分析软件 | 第22页 |
| 2.4 方法与步骤 | 第22-30页 |
| 2.4.1 RNA提取(mirVana RNA Isolation Kit提取Total RNA) | 第22-23页 |
| 2.4.2 金黄色葡萄球菌复苏、培养、鉴定及保存 | 第23页 |
| 2.4.3 奶牛金黄色葡萄球菌型乳腺炎人工诱导 | 第23-24页 |
| 2.4.4 奶牛人工诱导金葡菌型乳腺炎全基因组表达谱分析 | 第24-27页 |
| 2.4.5 芯片结果数据分析与处理 | 第27页 |
| 2.4.6 差异表达基因的Q-PCR验证分析 | 第27-30页 |
| 第三章 结果与分析 | 第30-53页 |
| 3.1 总RNA提取及检测 | 第30页 |
| 3.2 金黄色葡萄球菌复苏、培养及鉴定 | 第30-31页 |
| 3.3 奶牛金黄色葡萄球菌型乳腺炎人工诱导试验 | 第31-33页 |
| 3.3.1 攻毒后奶牛临床表现变化 | 第31页 |
| 3.3.2 攻毒后奶牛BMT检测情况 | 第31页 |
| 3.3.3 攻毒后奶牛乳中SCC变化情况 | 第31-32页 |
| 3.3.4 攻毒后奶牛乳腺组织切片观察 | 第32-33页 |
| 3.4 奶牛金黄色葡萄球菌人工诱导型乳腺炎全基因组表达谱分析 | 第33-49页 |
| 3.4.1 总RNA提取质量控制 | 第33-34页 |
| 3.4.2 基因芯片杂交及数据标准化 | 第34-36页 |
| 3.4.3 表达谱芯片差异表达基因的筛选 | 第36-49页 |
| 3.5 差异表达基因的Q-PCR验证 | 第49-53页 |
| 3.5.1 目的基因与内参基因的溶解曲线 | 第49-50页 |
| 3.5.2 进行Q-PCR验证基因的扩增曲线 | 第50-51页 |
| 3.5.3 进行Q-PCR验证基因的表达水平相对定量分析 | 第51-53页 |
| 第四章 讨论与结论 | 第53-57页 |
| 4.1 人工诱导奶牛金黄色葡萄球菌型乳腺炎试验 | 第53-54页 |
| 4.1.1 奶牛乳腺炎疾病模型的建立与应用 | 第53页 |
| 4.1.2 病原菌及供试奶牛的选择 | 第53页 |
| 4.1.3 人工诱导奶牛乳腺炎症状及变化 | 第53-54页 |
| 4.2 奶牛金黄色葡萄球菌人工诱导型乳腺炎全基因组表达谱分析 | 第54-55页 |
| 4.2.1 差异表达基因的筛选 | 第54页 |
| 4.2.2 差异表达基因的GO分析 | 第54-55页 |
| 4.2.3 差异表达基因的Pathway分析 | 第55页 |
| 4.3 奶牛金黄色葡萄球菌人工诱导型乳腺炎Q-PCR验证分析 | 第55-56页 |
| 4.4 关于相关基因作为奶牛乳腺炎候选基因的讨论 | 第56-57页 |
| 结论 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-65页 |
| 附录 | 第65-73页 |
| 致谢 | 第73-74页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第74-75页 |
