| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 英文缩略词表 | 第13-14页 |
| 第一章 文献综述：miRNA与肉牛脂肪调控 | 第14-28页 |
| 1 肉牛业发展动态 | 第14-19页 |
| 1.1 牛肉消费趋势 | 第14-15页 |
| 1.2 肉牛生产动态 | 第15-18页 |
| 1.3 肉牛育种动态 | 第18-19页 |
| 2 miRNA与动物脂肪沉积 | 第19-28页 |
| 2.1 miRNA的发现 | 第19-20页 |
| 2.2 miRNA的生成过程 | 第20-22页 |
| 2.3 miRNA的作用机制 | 第22-24页 |
| 2.4 miRNA的识别 | 第24-25页 |
| 2.5 miRNA与脂肪沉积 | 第25-28页 |
| 第二章 安格斯牛、西门塔尔牛和日本和牛脂肪组织miRNA文库构建和Solexa测序 | 第28-52页 |
| 引言 | 第28页 |
| 1 材料与方法 | 第28-31页 |
| 1.1 试验动物 | 第28页 |
| 1.2 主要仪器和试剂 | 第28-29页 |
| 1.2.1 主要仪器设备 | 第28-29页 |
| 1.2.2 主要试验药品与试剂 | 第29页 |
| 1.3 总RNA提取 | 第29页 |
| 1.4 总RNA质量检测 | 第29-30页 |
| 1.5 RNA混合池建立 | 第30页 |
| 1.6 miRNA 测序文库的构建和高通量测序 | 第30页 |
| 1.7 测序数据初步处理 | 第30-31页 |
| 1.8 测序数据的初步分析 | 第31页 |
| 1.8.1 小 RNA的特征分析 | 第31页 |
| 1.8.2 小RNA文库的分类注释 | 第31页 |
| 2 结果与分析 | 第31-48页 |
| 2.1 总RNA质量检测 | 第31-33页 |
| 2.2 序列文库质量处理 | 第33-34页 |
| 2.3 小RNA文库片段长度分布 | 第34-35页 |
| 2.4 小RNA的特征分析 | 第35-44页 |
| 2.5 小RNA文库的分类注释 | 第44-48页 |
| 3 讨论 | 第48-49页 |
| 3.1 试验样品的选择 | 第48页 |
| 3.2 高通量测序的质量 | 第48-49页 |
| 4 小结 | 第49-52页 |
| 第三章 牛品种差异脂肪沉积相关miRNA鉴定和特征 | 第52-71页 |
| 引言 | 第52页 |
| 1 材料与方法 | 第52-55页 |
| 1.1 试验材料 | 第52页 |
| 1.2 试验方法 | 第52-55页 |
| 2 结果与分析 | 第55-68页 |
| 2.1 公共及特有序列分析 | 第55-56页 |
| 2.2 已知miRNA对比 | 第56-58页 |
| 2.3 新miRNA预测 | 第58-59页 |
| 2.4 已知miRNA的差异分析 | 第59-62页 |
| 2.5 聚类分析 | 第62-64页 |
| 2.6 GO分析 | 第64-66页 |
| 2.7 KEGG分析 | 第66-67页 |
| 2.8 定量PCR验证 | 第67-68页 |
| 3 讨论 | 第68-69页 |
| 4 小结 | 第69-71页 |
| 第四章 日本和牛×皖南牛杂交一代公、母牛脂肪沉积的miRNA基因芯片分析 | 第71-81页 |
| 引言 | 第71页 |
| 1. 材料与方法 | 第71-75页 |
| 1.1. 试验动物 | 第71页 |
| 1.2 主要仪器设备与试剂 | 第71-72页 |
| 1.3 总RNA提取 | 第72页 |
| 1.4 总RNA质量检测 | 第72页 |
| 1.5 miRNA芯片选择 | 第72-73页 |
| 1.6 样品RNA标记 | 第73页 |
| 1.7 杂交、洗涤与染色 | 第73-74页 |
| 1.8 芯片扫描 | 第74页 |
| 1.9 数据提取与分析 | 第74-75页 |
| 1.10 芯片结果的实施定量验证 | 第75页 |
| 2 结果与分析 | 第75-80页 |
| 2.1 肌间脂肪总RNA的提取质量 | 第75-77页 |
| 2.2 芯片试验的质量控制 | 第77页 |
| 2.3 杂一代公、母牛脂肪沉积差异表达的miRNA | 第77-78页 |
| 2.4 差异表达miRNA的定量验证 | 第78-79页 |
| 2.5 mi R-148b的靶基因预测 | 第79-80页 |
| 3 讨论 | 第80页 |
| 4 小结 | 第80-81页 |
| 第五章 结论与展望 | 第81-83页 |
| 1 主要结论 | 第81页 |
| 2 创新点 | 第81-82页 |
| 3 研究展望 | 第82-83页 |
| 参考文献 | 第83-90页 |
| 附件 | 第90-110页 |
| 致谢 | 第110-112页 |
| 个人简历 | 第112-113页 |
