| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 第1章 绪论 | 第9-20页 |
| ·生物信息学的研究背景和问题 | 第9-10页 |
| ·生物序列图形表示的研究概况 | 第10-18页 |
| ·DNA 序列的图形表示 | 第11-12页 |
| ·蛋白质序列的图形表示 | 第12-18页 |
| ·本文的主要工作 | 第18-20页 |
| 第2章 蛋白质序列的图形表示 | 第20-38页 |
| ·蛋白质序列的2 维图形表示 | 第21-30页 |
| ·基于氨基酸理化性质分类的2维图形表示 | 第21-29页 |
| ·基于PAM250 矩阵的循环排序 | 第29-30页 |
| ·蛋白质序列的3 维空间表示 | 第30-37页 |
| ·基于氨基酸的字典序得到的3维空间表示 | 第30-32页 |
| ·基于 6 阶反射 Gray 编码得到的 3 维空间表示 | 第32-37页 |
| ·小结 | 第37-38页 |
| 第3章 蛋白质序列的数值特征及其相似性分析 | 第38-49页 |
| ·数值刻画方法 | 第38-39页 |
| ·数值刻画方法以及相似性分析 | 第39-47页 |
| ·矩阵特征值集 | 第39-41页 |
| ·一阶类中心矩 | 第41-43页 |
| ·矩阵最大特征值 | 第43-45页 |
| ·图形比对 | 第45-47页 |
| ·小结 | 第47-49页 |
| 第4章 进化树的构建 | 第49-73页 |
| ·构建进化树的步骤 | 第49-50页 |
| ·构建进化树工具 | 第50页 |
| ·构建进化树 | 第50-73页 |
| ·9个物种的线粒体 NADH 脱氢酶的进化树 | 第51-53页 |
| ·34种冠状病毒 spike 蛋白的进化分析 | 第53-64页 |
| ·45种流感病毒 RNA 聚合酶 PB1 的进化分析 | 第64-72页 |
| ·小结 | 第72-73页 |
| 参考文献 | 第73-78页 |
| 致谢 | 第78-79页 |
| 攻读硕士学位期间的研究成果 | 第79页 |