| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-27页 |
| ·DNA芯片技术 | 第10-18页 |
| ·DNA芯片的产生及原理 | 第10-12页 |
| ·DNA芯片的发展过程 | 第12-14页 |
| ·DNA芯片制造方法 | 第14-16页 |
| ·DNA芯片的分类 | 第16-18页 |
| ·芯片探针设计国内外研究现状 | 第18-24页 |
| ·探针对芯片杂交的影响 | 第18-20页 |
| ·RNA二级结构及其预测 | 第20-24页 |
| ·RNA二级结构对芯片探针设计的影响 | 第24页 |
| ·核糖开关(Riboswitch) | 第24-25页 |
| ·论文的主要内容 | 第25-27页 |
| 第二章 EGFP覆瓦式芯片实验探针设计及数据分析 | 第27-38页 |
| ·实验试剂材料 | 第27页 |
| ·材料 | 第27页 |
| ·试剂与仪器 | 第27页 |
| ·实验方法 | 第27-28页 |
| ·芯片探针设计及芯片合成 | 第27页 |
| ·靶序列制备及芯片杂交 | 第27-28页 |
| ·靶序列(EGFP)二级结构预测及其探针参数计算 | 第28页 |
| ·芯片数据结果分析 | 第28-38页 |
| ·探针(DNA)/靶序列(EGFP RNA)杂交双链ΔG及其Tm值分析 | 第28-30页 |
| ·探针PT-sc参数对杂交信号值的影响 | 第30-34页 |
| ·探针5’末端碱基组成对芯片杂交信号值的影响 | 第34-35页 |
| ·探针影响因素的交叉分析 | 第35-38页 |
| 第三章 Riboswitch覆瓦式芯片实验及数据分析 | 第38-44页 |
| ·实验部分 | 第38页 |
| ·材料 | 第38页 |
| ·试剂与仪器 | 第38页 |
| ·实验方法 | 第38页 |
| ·ArrayDesigner探针设计软件 | 第38-39页 |
| ·RSW最优探针设计 | 第39-42页 |
| ·Mfold Probe(MF Probe)探针设计 | 第39页 |
| ·ArrayDesigner Probe(AD Probe)探针设计 | 第39-42页 |
| ·RSW芯片数据分析 | 第42-44页 |
| 第四章 结论与讨论 | 第44-45页 |
| 参考文献 | 第45-50页 |
| 致谢 | 第50-51页 |
| 附录1 预测的34个EGFP二级结构 | 第51-55页 |
| 附录2 701条EGFP覆瓦式探针相关参数及芯片实验结果 | 第55-70页 |
