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刺参Serpin基因的克隆、原核表达及其在自溶过程中的变化研究

摘要第4-5页
Abstract第5-6页
第一章 绪论第10-17页
    1.1 海参第10页
    1.2 海参自溶与内源蛋白酶第10-11页
    1.3 丝氨酸蛋白酶(SEP)概述第11-12页
        1.3.1 SEP的结构第11页
        1.3.2 SEP的研究进展第11-12页
    1.4 丝氨酸蛋白酶抑制剂(SPI)概述第12-15页
        1.4.1 SPI分类第12-13页
        1.4.2 SPI的结构及抑制机理第13-14页
        1.4.3 SPI的研究进展第14-15页
        1.4.4 SPI和SEP的相互作用关系第15页
    1.5 研究意义和内容第15-17页
第二章 SPI基因的克隆、原核表达及其在自溶中的变化规律第17-37页
    2.1 实验材料第17-21页
        2.1.1 实验原料第17页
        2.1.2 实验仪器第17-18页
        2.1.3 实验试剂第18-19页
        2.1.4 实验试剂配方第19-21页
    2.2 实验方法第21-37页
        2.2.1 刺参Total RNA的提取第21页
        2.2.2 刺参SPI基因的获取第21-27页
            2.2.2.1 引物设计与合成第21-22页
            2.2.2.2 cDNA的合成及SPI的特异性序列获取第22-23页
            2.2.2.3 3’-RACE扩增第23-25页
            2.2.2.4 目的基因ORF验证及测序第25-27页
        2.2.3 刺参SPI基因全长序列的生物信息学分析第27-28页
            2.2.3.1 等电点和分子量的预测第27页
            2.2.3.2 信号肽预测第27页
            2.2.3.3 氨基酸疏水性预测第27页
            2.2.3.4 蛋白质跨膜区预测第27页
            2.2.3.5 蛋白质结构域及活性位点预测第27-28页
            2.2.3.6 蛋白质二级结构预测第28页
            2.2.3.7 SPI氨基酸序列的同源性比对第28页
        2.2.4 刺参SPI、SEP基因表达模式分析第28-31页
            2.2.4.1 刺参不同部位的样品采集及自溶实验第28页
            2.2.4.2 刺参Total RNA的提取及纯化第28-29页
            2.2.4.3 RNA的纯度及反转录第29页
            2.2.4.4 引物设计与合成第29页
            2.2.4.5 荧光Real-Time PCR第29-30页
            2.2.4.6 建立标准曲线第30-31页
            2.2.4.7 样品检测及数据处理第31页
        2.2.5 刺参SPI的蛋白重组表达第31-37页
            2.2.5.1 引物设计与合成第31页
            2.2.5.2 SPI基因ORF区的扩增及纯化第31-33页
            2.2.5.3 重组表达质粒pET-21b-SPI的构建第33页
            2.2.5.4 重组质粒的转化及测序第33-34页
            2.2.5.5 重组菌的制备第34-35页
            2.2.5.6 重组菌的培养及诱导第35-36页
            2.2.5.7 重组蛋白SPI-His的复性及纯化第36-37页
第三章 结果与讨论第37-60页
    3.1 总RNA提取第37页
    3.2 刺参SPI基因序列的克隆第37-39页
        3.2.1 SPI同源序列的扩增第37-38页
        3.2.2 3’-RACE PCR扩增第38-39页
        3.2.3 ORF验证第39页
    3.3 刺参SPI全长序列的生物信息学分析第39-45页
        3.3.1 分子量和等电点的预测第40页
        3.3.2 信号肽预测第40-41页
        3.3.3 氨基酸疏水性分析第41-42页
        3.3.4 蛋白质跨膜区域预测第42页
        3.3.5 SPI蛋白质结构域及活性位点预测第42页
        3.3.6 SPI蛋白质二级结构分析第42-43页
        3.3.7 氨基酸序列的同源性比对第43-45页
    3.4 刺参SPI和SEP基因表达模式分析第45-56页
        3.4.1 RNA提取结果第45页
        3.4.2 实时荧光定量PCR检测方法的建立第45-49页
            3.4.2.1 Cytb基因标准曲线的建立第45-47页
            3.4.2.2 SPI基因标准曲线的建立第47-48页
            3.4.2.3 SEP基因标准曲线的建立第48-49页
        3.4.3 实时荧光定量PCR结果第49-56页
            3.4.3.1 SPI和SEP的组织分布第49-51页
            3.4.3.2 时序表达定量结果第51-56页
    3.5 刺参SPI蛋白重组表达第56-60页
        3.5.1 SPI基因ORF区扩增第56-57页
        3.5.2 重组质粒的构建及鉴定第57-58页
        3.5.3 重组菌的培养及诱导表达第58-60页
第四章 结论第60-61页
参考文献第61-67页
致谢第67页

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