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木薯低温和干旱胁迫响应miRNA-novel4的克隆、表达和启动子研究

摘要第4-5页
Abstract第5-6页
1 前言第11-21页
    1.1 木薯简介第11-12页
    1.2 植物的抗旱机理第12-13页
        1.2.1 干旱胁迫信号的感知及传导第12页
        1.2.2 渗透调节物质第12页
        1.2.3 植物抗旱相关基因第12-13页
        1.2.4 干旱的生理指标第13页
    1.3 植物的抗寒机理第13-14页
        1.3.1 细胞膜系与植物抗寒性第13页
        1.3.2 植物抗寒性与酶系统多态性第13-14页
        1.3.3 抗寒基因的表达和调控第14页
    1.4 miRNA概述第14-17页
        1.4.1 miRNA的结构特征第14-15页
        1.4.2 miRNA的发生及其生理功能第15-16页
        1.4.3 miRNA与靶mRNA的作用机制第16页
        1.4.4 植物逆境相关的miRNA第16-17页
    1.5 靶基因的研究策略第17-18页
        1.5.1 靶基因的获得第17-18页
        1.5.2 靶基因的验证第18页
    1.6 启动子的作用机理第18-21页
        1.6.1 高等植物启动子的结构第18-19页
        1.6.2 真核启动子的类型第19-21页
2 材料与方法第21-40页
    2.1 实验材料第21-23页
        2.1.1 干旱处理过程及采样第21-22页
        2.1.2 低温处理及采样第22-23页
    2.2 实验流程第23-24页
    2.3 干旱相关的miRNA的筛选第24-25页
    2.4 miRNA的表达分析第25-29页
        2.4.1 植物样品中RNA的提取第25页
        2.4.2 本实验中miRNA的获得第25页
        2.4.3 Multiplexed RT-PCR法第25-26页
        2.4.4 miRNA反转引物和定量引物的设计第26-27页
        2.4.5 miRNA的反转录、第一链cDNA的检测及定量分析第27-28页
        2.4.6 miRNA与靶基因的数据处理和转换分析方法第28-29页
    2.5 靶基因的表达检测第29-31页
        2.5.1 靶基因的预测第29页
        2.5.2 RNA的提取第29页
        2.5.3 靶基因的的反转录、第一链cDNA的检测第29-31页
        2.5.4 靶基因的定量检测第31页
    2.6 5'-RACE法验证miRNA和靶基因的关系第31-36页
        2.6.1 mRNA的分离第31-32页
        2.6.2 mRNA与Oligo连接(GeneRacer~(TM) RNA Oligo)第32-33页
        2.6.3 mRNA反转录成cDNA(SuperScript~(TM)Ⅲ)第33页
        2.6.4 cDNA第一链PCR反应第33-34页
        2.6.5 第二轮巢式PCR扩增第34页
        2.6.6 PCR特异片段的回收及纯化第34-35页
        2.6.7 PCR产物克隆测序第35-36页
        2.6.8 序列分析第36页
    2.7 novel4启动子的克隆和分析第36-39页
        2.7.1 研究基础第36-37页
        2.7.2 序列比对第37页
        2.7.3 序列的克隆第37-38页
        2.7.4 序列分析第38-39页
    2.8 生理指标的测定第39-40页
        2.8.1 无机渗透调节物质第39页
        2.8.2 有机渗透调节物质ABA测定方法第39页
        2.8.3 数据处理及统计方法第39-40页
3 结果与分析第40-71页
    3.1 苗期干旱和寒害胁迫鉴定第40-44页
        3.1.1 干旱材料的表型变化及采样等级标准第40-42页
        3.1.2 低温材料的表型变化及采样等级标准第42-44页
    3.2 miRNA的筛选结果第44页
    3.3 novel4与其靶基因的表达分析第44-52页
        3.3.1 novel4与其靶基因的荧光定量的条件摸索第44-46页
        3.3.2 novel4与靶基因在干旱胁迫下的表达调控模式分析第46-47页
        3.3.3 novel4与靶基因在低温胁迫下的表达调控模式分析第47-48页
        3.3.4 novel4在功能叶、根、离区的表达分析第48页
        3.3.5 novel4在干旱胁迫下各组织的表达量分析第48-50页
        3.3.6 novel4在低温胁迫下各组织的表达量分析第50-52页
    3.4 novel4与靶基因切割位点的分析第52-53页
    3.5 novel4 5'调控区的顺式作用元件的生物信息学分析第53-67页
        3.5.1 生物信息学获取序列novel4 5'端调控区第53页
        3.5.2 novel4 5'调控区的克隆条件摸索第53-54页
        3.5.3 SC124 5'调控区序列分析第54-56页
        3.5.4 KU50 5'调控区克隆序列第56-57页
        3.5.5 生物信息学分析SC124 5'调控区第57-61页
        3.5.6 生物信息学分析KU50 5'调控区第61-66页
        3.5.7 两个品种novel4 5'调控区序列比对第66-67页
    3.6 生理指标的结果分析第67-71页
        3.6.1 干旱胁迫对植物叶片钾含量的影响第67-68页
        3.6.2 干旱胁迫对钙离子含量的影响第68-69页
        3.6.3 内源激素ABA响应干旱胁迫第69-70页
        3.6.4 钾离子、钙离子和ABA含量相关性分析第70-71页
4 讨论第71-74页
    4.1 本研究和前人研究的创新点第71页
    4.2 miRAN及靶mRNA的筛选第71页
    4.3 novel4在低温、干旱胁迫下表达的异同第71-72页
    4.4 novel4基因5'调控区的分析讨论第72页
    4.5 生理指标第72-74页
5 结论第74-75页
6 下一步试验计划第75-76页
参考文献第76-80页
致谢第80页

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