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探索核小体排布对基因表达过程不同阶段的影响

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-7页
第1章 引言第12-22页
    1.1 染色质与核小体第12-13页
    1.2 核小体的定位第13-14页
    1.3 组蛋白及组蛋白修饰第14-15页
    1.4 组蛋白变构体影响核小体功能第15-16页
    1.5 调节染色质状态的主要机制第16页
    1.6 核小体排布的测定及预测第16-17页
        1.6.1 核小体排布的测定方法第16-17页
        1.6.2 核小体排布的预测第17页
    1.7 核小体在基因上排布的典型特征及作用第17-18页
    1.8 本课题研究的依据及意义第18-22页
第2章 材料与方法第22-52页
    2.1 实验材料第22-30页
        2.1.1 质粒第22-23页
        2.1.2 菌种第23页
        2.1.3 酶及化学试剂第23-24页
        2.1.4 主要仪器设备第24-25页
        2.1.5 培养基的配制第25-27页
        2.1.6 试剂的配制第27-30页
        2.1.7 抗体第30页
    2.2 实验方法第30-52页
        2.2.1 生物学软件分析第30页
        2.2.2 引物序列第30-35页
        2.2.3 酵母基因组DNA的抽提第35-36页
        2.2.4 在不额外引入酶切位点的前提下在LacZ基因不同位置插入内含子的方法第36-37页
        2.2.5 利用同源重组把目的片段插入BY4741酵母菌种中的实验策略第37-38页
        2.2.6 Touchdown PCR反应体系第38页
        2.2.7 PCR产物的检测第38-39页
        2.2.8 PCR产物纯化回收第39页
        2.2.9 酶切体系(NEB)第39-40页
        2.2.10 酶切产物纯化回收第40页
        2.2.11 目的片段酶切产物与载体的酶连体系(TaKaRa)第40页
        2.2.12 大肠杆菌DH5α感受态细胞的制备和转化第40-41页
        2.2.13 菌落PCR验证转化结果第41-42页
        2.2.14 大肠杆菌质粒抽提及酶切验证第42-43页
        2.2.15 酵母电转化第43-44页
        2.2.16 LacZ(β-半乳糖苷酶)活性检测第44-45页
        2.2.17 酵母总RNA抽提第45-46页
        2.2.18 RNA变性电泳第46页
        2.2.19 RT-PCR第46-47页
        2.2.20 Northern blot第47-48页
        2.2.21 Western blot第48-52页
第3章 结果与分析第52-79页
    3.1 分析改变翻译起始位点附近核小体的排布对基因表达的影响第52-62页
        3.1.1 ADH1 promoter+LacZ/EGFP+ADH1 terminator in pRS413载体的克隆第52-54页
        3.1.2 ADH1 promoter+part of Cox4 intron+part of Ape2 intron+part ofLucifrase+LacZ/EGFP+3'terminator in pRS413载体的克隆第54-57页
        3.1.3 ADH1 promoter+part of Cox4 intron+part of Ape2 intron+LacZ/EGFP+3'terminator in pRS413载体的克隆第57-58页
        3.1.4 关于改变LacZ报告基因翻译起始位点附近核小体排布的克隆LacZ基因表达的检测结果第58-61页
        3.1.5 关于改变EGFP报告基因翻译起始位点核小体排布的克隆的荧光检测结果第61-62页
    3.2 通过在LacZ基因不同位置插入不同GC含量的内含子来研究剪切位点附近核小体排布的改变对内含子剪接及基因表达的影响第62-70页
        3.2.1 关于在LacZ报告基因不同位置插入酵母内含子的克隆结果第62-65页
        3.2.2 在LacZ报告基因不同位置插入酵母内含子克隆的LacZ表达情况分析第65-69页
        3.2.3 在LacZ报告基因不同位置插入酵母内含子克隆的内含子剪接情况分析第69-70页
    3.3 Gall promoter+LacZ+3'terminator in pRS413载体及其他相关载体的克隆第70-73页
    3.4 将部分LacZ报告基因插入酵母基因Met15中第73-79页
        3.4.1 METl5上游同源臂+kan marker+ADH1 promoter+LacZ+3'termi-nator+MET15下游同源臂in SK(-)载体的克隆第73-77页
        3.4.2 将LacZ报告基因插入酵母基因Met15中的酵母菌落PCR验证结果第77-79页
第4章 讨论与展望第79-82页
致谢第82-83页
参考文献第83-87页
附录第87-89页

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