| 摘要 | 第7-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 缩略语表 | 第10-11页 |
| 1 前言 | 第11-27页 |
| 1.1 植物花药开裂研究进展 | 第11-18页 |
| 1.1.1 花药与花粉发育 | 第11-13页 |
| 1.1.2 花药开裂过程 | 第13页 |
| 1.1.3 裂口结构 | 第13-15页 |
| 1.1.4 药室内壁次生壁增厚调节 | 第15页 |
| 1.1.5 花药中细胞的退化 | 第15-16页 |
| 1.1.6 植物激素参与花药开裂的调节 | 第16-18页 |
| 1.2 DNA甲基化在植物中的研究进展 | 第18-21页 |
| 1.2.1 维持DNA甲基化模式 | 第18-19页 |
| 1.2.2 RdDM路径作用机制 | 第19-20页 |
| 1.2.3 生殖细胞中的DNA甲基化 | 第20-21页 |
| 1.3 植物小RNA的研究进展 | 第21-25页 |
| 1.3.1 小RNA在植物中的产生 | 第21-22页 |
| 1.3.2 microRNA的产生和进化 | 第22-23页 |
| 1.3.3 减数分裂和配子中的小RNA | 第23-25页 |
| 1.3.4 miRNAs调控花器官的形成 | 第25页 |
| 1.4 研究背景 | 第25-26页 |
| 1.5 研究目的和意义 | 第26-27页 |
| 2 材料与方法 | 第27-34页 |
| 2.1 实验材料 | 第27页 |
| 2.2 实验方法 | 第27-34页 |
| 2.2.0 DNA的提取 | 第27页 |
| 2.2.1 拟南芥总RNA的抽提 | 第27-28页 |
| 2.2.2 全基因组甲基化测序 | 第28-29页 |
| 2.2.3 小RNA测序结果生物学分析方法 | 第29-30页 |
| 2.2.4 差异表达miRNA分析 | 第30-31页 |
| 2.2.5 Stem-loop qRT- PCR | 第31-32页 |
| 2.2.6 反转录 | 第32-33页 |
| 2.2.7 RT-PCR | 第33-34页 |
| 3 结果与分析 | 第34-48页 |
| 3.1 全基因组甲基化测序结果分析 | 第34-40页 |
| 3.1.1 全基因组甲基化测序质量检测结果 | 第34页 |
| 3.1.2 全基因组甲基化水平分析 | 第34-35页 |
| 3.1.3 甲基化在染色体上的分布 | 第35-36页 |
| 3.1.4 基因区甲基水平的分析 | 第36-37页 |
| 3.1.5 差异甲基化分析 | 第37-40页 |
| 3.2 sRNA测序分析结果 | 第40-45页 |
| 3.2.1 sRNA测序数据质量分析及长度分布 | 第41页 |
| 3.2.2 sRNA比对结果分析 | 第41-42页 |
| 3.2.3 sRNA注释结果 | 第42-43页 |
| 3.2.4 差异miRNA分析 | 第43-44页 |
| 3.2.5 差异甲基化基因与sRNAs分析 | 第44-45页 |
| 3.3 定量检测分析 | 第45-48页 |
| 3.3.1 差异甲基化候选基因表达量分析 | 第46-47页 |
| 3.3.2 差异已知miRNA的表达量分析 | 第47页 |
| 3.3.3 差异已知miRNA预测靶基因的表达量分析 | 第47-48页 |
| 4 讨论 | 第48-50页 |
| 4.1 关于甲基化的讨论 | 第48-49页 |
| 4.1.1 全基因组甲基化水平 | 第48页 |
| 4.1.2 差异甲基化结果 | 第48-49页 |
| 4.1.3 差异甲基化基因定量分析 | 第49页 |
| 4.2 DMR与s RNA相关性 | 第49页 |
| 4.3 拟南芥花药不开裂利用 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-62页 |
| 附录 | 第62-76页 |
| 附录1 CHH甲基化水平升高差异表达基因 | 第62-72页 |
| 附录2 本文有所用引物 | 第72-74页 |
| 附录3 已知差异miRNA的预测靶基因注释 | 第74-76页 |
| 致谢 | 第76页 |