| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7页 |
| 英文缩略表 | 第12-13页 |
| 第一章 引言 | 第13-17页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第13-14页 |
| 1.1.1 研究背景 | 第13-14页 |
| 1.1.2 研究意义 | 第14页 |
| 1.2 生物信息学研究现状概述 | 第14-16页 |
| 1.3 论文结构 | 第16-17页 |
| 第二章 生物信息学基础知识 | 第17-25页 |
| 2.1 生物科学基础知识 | 第17-20页 |
| 2.1.1 生命的基石 | 第17-18页 |
| 2.1.2 中心法则 | 第18-19页 |
| 2.1.3 变异与进化 | 第19-20页 |
| 2.2 序列比对问题概述 | 第20-25页 |
| 2.2.1 序列比对基础 | 第20页 |
| 2.2.2 空位罚分 | 第20-21页 |
| 2.2.3 替换矩阵 | 第21-23页 |
| 2.2.4 目标函数 | 第23-25页 |
| 第三章 序列比对算法研究 | 第25-31页 |
| 3.1 双序列比对 | 第25-28页 |
| 3.1.1 Needleman-Wunsch算法 | 第25-26页 |
| 3.1.2 Smith-Waterman算法 | 第26-27页 |
| 3.1.3 点阵图法(DotMatrix Method） | 第27-28页 |
| 3.2 多序列比对 | 第28-31页 |
| 3.2.1 精确比对算法 | 第28-29页 |
| 3.2.2 渐进比对算法 | 第29-30页 |
| 3.2.3 迭代算法 | 第30-31页 |
| 第四章 基于改进遗传算法的多序列比对问题研究 | 第31-42页 |
| 4.1 遗传算法的概述 | 第31-34页 |
| 4.1.1 遗传算法的概念及特点 | 第31页 |
| 4.1.2 遗传算法的元组及基本流程 | 第31-34页 |
| 4.2 改进的遗传算法在多序列比对中的应用 | 第34-38页 |
| 4.2.1 编码设计 | 第34页 |
| 4.2.2 初始化种群 | 第34页 |
| 4.2.3 适应度函数 | 第34-35页 |
| 4.2.4 遗传算子 | 第35-36页 |
| 4.2.5 选择算子 | 第36页 |
| 4.2.6 迁移算子 | 第36-37页 |
| 4.2.7 算法描述 | 第37-38页 |
| 4.3 算法评估 | 第38-42页 |
| 4.3.1 软硬件环境 | 第38页 |
| 4.3.2 参数设置 | 第38-39页 |
| 4.3.3 实验数据 | 第39页 |
| 4.3.4 实验设计 | 第39页 |
| 4.3.5 实验结果与分析 | 第39-42页 |
| 第五章 总结与展望 | 第42-44页 |
| 5.1 总结 | 第42页 |
| 5.2 展望 | 第42-44页 |
| 参考文献 | 第44-48页 |
| 致谢 | 第48-49页 |
| 作者简历 | 第49页 |