| 摘要 | 第3-6页 |
| Abstract | 第6-9页 |
| 引言 | 第14-15页 |
| 研究背景 | 第15-24页 |
| 0.1 阳春砂 | 第15页 |
| 0.2 萜类化合物 | 第15-17页 |
| 0.3 挥发性萜类化合物及其合成途径 | 第17-18页 |
| 0.3.1 单萜及其下游合成途径 | 第17-18页 |
| 0.3.2 倍半萜及其下游合成途径 | 第18页 |
| 0.4 植物激素及其信号转导途径 | 第18-20页 |
| 0.4.1 茉莉酸信号转导途径 | 第19-20页 |
| 0.5 转录因子的概述 | 第20-22页 |
| 0.5.1 转录因子的结构区域 | 第20-21页 |
| 0.5.2 转录因子参与初生及次生代谢物的调控 | 第21-22页 |
| 0.6 RNA-Seq及其在转录因子研究中的应用 | 第22-23页 |
| 0.7 小结 | 第23-24页 |
| 第一章 MeJA诱导差异表达的WRKY及相关萜类合酶基因的分析 | 第24-39页 |
| 1.1 植物材料、主要仪器、试剂 | 第24-25页 |
| 1.1.1 植物材料 | 第24页 |
| 1.1.2 主要仪器和试剂 | 第24-25页 |
| 1.2 方法 | 第25-26页 |
| 1.2.1 差异表达转录因子的筛选 | 第25页 |
| 1.2.2 转录因子保守结构的分析 | 第25页 |
| 1.2.3 总RNA的提取和RT-qPCR实验 | 第25-26页 |
| 1.2.4 统计方法 | 第26页 |
| 1.3 结果与分析 | 第26-37页 |
| 1.3.1 基于RNA-Seq的阳春砂差异表达的转录因子基因 | 第26-28页 |
| 1.3.2 阳春砂中响应MeJA的WRKY转录因子的初步筛选 | 第28-29页 |
| 1.3.3 阳春砂中萜类合酶基因的初步筛选 | 第29-30页 |
| 1.3.4 阳春砂中WRKY转录因子和萜类合酶基因的共表达网络分析 | 第30-31页 |
| 1.3.5 综合分析阳春砂中的挥发性萜类含量与相关基因的关系 | 第31-34页 |
| 1.3.6 候选基因的相对表达水平及预测模型 | 第34-37页 |
| 1.4 讨论 | 第37-39页 |
| 第二章 MeJA诱导差异表达的MYC及相关萜类合酶基因的分析 | 第39-48页 |
| 2.1 材料、主要仪器和试剂 | 第39页 |
| 2.2 方法 | 第39页 |
| 2.3 结果与分析 | 第39-45页 |
| 2.3.1 阳春砂中响应MeJA诱导的MYC转录因子的初步筛选 | 第39-40页 |
| 2.3.2 与MYC转录因子相关的萜类合酶基因的筛选 | 第40-41页 |
| 2.3.3 候选MYC与TPS基因与挥发性萜类的相关分析 | 第41-43页 |
| 2.3.4 候选基因的相对表达量分析及表达模式预测 | 第43-45页 |
| 2.4 讨论 | 第45-48页 |
| 2.4.1 MYC基因序列之间高度同源 | 第45-46页 |
| 2.4.2 MYC基因调控TPS的表达 | 第46-48页 |
| 第三章 MeJA诱导对阳春砂内源JA及其信号转导基因的影响 | 第48-57页 |
| 3.1 材料、主要仪器和试剂 | 第48页 |
| 3.1.1 植物材料 | 第48页 |
| 3.1.2 仪器与试剂 | 第48页 |
| 3.2 方法 | 第48-49页 |
| 3.2.1 JA的提取方法 | 第48-49页 |
| 3.2.2 JA含量的检测 | 第49页 |
| 3.2.3 总RNA的提取和qRT-PCR实验 | 第49页 |
| 3.2.4 基因聚类分析 | 第49页 |
| 3.2.5 统计方法 | 第49页 |
| 3.3 结果与分析 | 第49-55页 |
| 3.3.1 MeJA诱导的阳春砂果实JA含量的变化 | 第49-50页 |
| 3.3.2 MeJA诱导的阳春砂表达谱中JA信号转导途径分析 | 第50-52页 |
| 3.3.3 基于RNA-Seq的JA信号转导关键基因的系统聚类分析 | 第52-53页 |
| 3.3.4 RT-qPCR验证JA信号转导关键基因的相对表达量 | 第53-54页 |
| 3.3.5 JA信号转导关键基因的调控模式 | 第54-55页 |
| 3.4 讨论 | 第55-57页 |
| 第四章 高浓度MeJA诱导阳春砂候选基因的表达变化 | 第57-63页 |
| 4.1 植物材料、主要仪器、试剂 | 第57页 |
| 4.1.1 植物材料 | 第57页 |
| 4.1.2 主要仪器和试剂 | 第57页 |
| 4.2 方法 | 第57-58页 |
| 4.2.1 JA的提取和测定 | 第57页 |
| 4.2.2 总RNA的提取和qRT-PCR实验 | 第57页 |
| 4.2.3 统计方法 | 第57-58页 |
| 4.3 结果与分析 | 第58-61页 |
| 4.3.1 高浓度MeJA诱导后阳春砂果实JA含量的变化 | 第58页 |
| 4.3.2 候选基因的相对表达量分析 | 第58-61页 |
| 4.4 讨论 | 第61-63页 |
| 第五章 萜类合成相关基因调控网络初步构建及关键转录因子的生物信息学分析 | 第63-71页 |
| 5.1 方法 | 第63-64页 |
| 5.1.1 RT-qPCR实验 | 第63页 |
| 5.1.2 转录因子亚细胞定位的分析 | 第63页 |
| 5.1.3 转录因子相互作用蛋白的预测 | 第63-64页 |
| 5.1.4 转录因子及靶基因的顺式作用元件的分析 | 第64页 |
| 5.1.5 转录因子开放阅读框预测 | 第64页 |
| 5.2 结果与分析 | 第64-69页 |
| 5.2.1 萜类骨架中关键萜类合酶基因的相对表达情况 | 第64-65页 |
| 5.2.2 转录因子、萜类合酶及JA信号转导基因的调控网络 | 第65-67页 |
| 5.2.3 关键转录因子的亚细胞定位 | 第67-68页 |
| 5.2.4 关键转录因子的互作蛋白预测 | 第68页 |
| 5.2.5 关键基因的结合位点分析 | 第68-69页 |
| 5.2.6 关键转录因子开放阅读框的预测 | 第69页 |
| 5.3 讨论 | 第69-71页 |
| 第六章 总结与展望 | 第71-73页 |
| 6.1 MeJA诱导差异表达的WRKY及相关萜类合酶基因的分析 | 第71页 |
| 6.2 MeJA诱导差异表达的MYC及相关萜类合酶基因的分析 | 第71页 |
| 6.3 MeJA诱导对阳春砂内源JA及其信号途径基因的影响 | 第71页 |
| 6.4 高浓度MeJA诱导阳春砂候选基因的表达变化 | 第71-72页 |
| 6.5 萜类合成相关基因调控网络构建及关键基因生物信息学分析 | 第72页 |
| 6.6 展望 | 第72-73页 |
| 参考文献 | 第73-78页 |
| 附录 | 第78-83页 |
| 发表论文及参与课题情况 | 第83-84页 |
| 致谢 | 第84页 |
