| 摘要 | 第5-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 符号对照表 | 第10-11页 |
| 缩略语对照表 | 第11-14页 |
| 第一章 绪论 | 第14-24页 |
| 1.1 miRNA简介 | 第14-15页 |
| 1.2 miRNA对疾病的调控作用 | 第15-16页 |
| 1.3 miRNA与靶基因mRNA的相互作用及研究现状 | 第16-20页 |
| 1.3.1 miRNA与靶基因mRNA的相互作用 | 第16-17页 |
| 1.3.2 miRNA与靶基因mRNA的鉴定方法 | 第17-18页 |
| 1.3.3 miRNA靶基因mRNA的预测方法 | 第18-19页 |
| 1.3.4 miRNA与mRNA之间的调控模块 | 第19-20页 |
| 1.4 基因表达数据来源-TCGA数据库 | 第20-22页 |
| 1.4.1 TCGA数据库简介 | 第20-21页 |
| 1.4.2 TCGA的主要工作 | 第21-22页 |
| 1.5 本文的主要工作 | 第22-23页 |
| 1.6 本文的结构安排 | 第23-24页 |
| 第二章 miRNA与mRNA的相关性分析 | 第24-34页 |
| 2.1 相关性分析的原因 | 第24-25页 |
| 2.2 相关性分析数据说明 | 第25页 |
| 2.3 miRNA与mRNA之间的Pearson相关性分析 | 第25-27页 |
| 2.4 miRNA与mRNA相关性分析结果说明 | 第27-32页 |
| 2.5 本章小结 | 第32-34页 |
| 第三章 SVM在miRNA调控关系研究中的应用 | 第34-50页 |
| 3.1 SVM分类原理 | 第34-40页 |
| 3.1.1 线性分类的标准logistic回归 | 第35-37页 |
| 3.1.2 SVM线性可分问题 | 第37-39页 |
| 3.1.3 利用LIBSVM开源工具包 | 第39-40页 |
| 3.2 利用SVM方法预测参与调控肾细胞癌的miRNA | 第40-44页 |
| 3.2.1 miRNA与肾细胞癌调控关系的分类 | 第41页 |
| 3.2.2 特征空间的选择 | 第41-42页 |
| 3.2.3 分类模型的建立 | 第42-43页 |
| 3.2.4 SVM预测miRNA与肾细胞癌调控关系的结果分析 | 第43-44页 |
| 3.3 利用SVM方法预测miRNA的靶基因mRNA | 第44-49页 |
| 3.3.1 TargetScan预测miRNA靶基因的原理与不足 | 第44-45页 |
| 3.3.2 miRNA与mRNA靶向关系的分类 | 第45-46页 |
| 3.3.3 特征空间的选择 | 第46-47页 |
| 3.3.4 分类模型的建立 | 第47页 |
| 3.3.5 SVM预测miRNA靶基因的结果分析 | 第47-49页 |
| 3.4 本章小结 | 第49-50页 |
| 第四章 总结与展望 | 第50-52页 |
| 4.1 总结 | 第50页 |
| 4.2 展望 | 第50-52页 |
| 参考文献 | 第52-56页 |
| 致谢 | 第56-58页 |
| 作者简介 | 第58-59页 |
