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基于iTRAQ技术对不同毛色绵羊皮肤相关蛋白组学分析和功能研究

摘要第11-13页
第一章 文献综述第13-35页
    1 哺乳动物毛色的形成机制第13-21页
        1.1 哺乳动物色素形成的机制第13-16页
            1.1.1 黑色素的形成机制第13-14页
                1.1.1.1 黑色素的分类第13页
                1.1.1.2 黑色素的功能第13页
                1.1.1.3 黑色素的合成第13-14页
            1.1.2 黑色素细胞的生物学功能第14-16页
                1.1.2.1 黑色素细胞的起源及生物学特性第14-15页
                1.1.2.2 黑色素细胞的功能第15-16页
        1.2 动物色素合成的信号通路第16-21页
            1.2.1 MC1R/(Gs-AC)/PKA信号通路第16-18页
            1.2.2 Wnt/β-catenin信号通路第18-19页
            1.2.3 MAPK信号通路第19-20页
            1.2.4 G蛋白偶联信号通路第20-21页
    2 动物毛囊与毛色的形成第21-25页
        2.1 哺乳动物毛囊的产生第21-22页
        2.2 哺乳动物毛囊的基本结构第22-25页
            2.2.1 哺乳动物毛囊的结构特征第22-23页
            2.2.2 毛囊的特点第23页
            2.2.3 毛囊具有周期性第23-24页
                2.2.3.1 毛囊具有周期性的相关理论第23-24页
                2.2.3.2 毛囊周期性变化的分子调控第24页
            2.2.4 毛囊和毛色形成的关系第24-25页
    3 iTRAQ技术的发展简介第25-28页
        3.1 iTRAQ技术的概述第25-27页
            3.1.1 iTRAQ技术的提出第25-26页
            3.1.2 iTRAQ技术的原理第26-27页
                3.1.2.1 技术简介第26页
                3.1.2.2 iTRAQ技术的操作流程第26-27页
                3.1.2.3 技术优势第27页
        3.2 iTRAQ技术在生命科学中的应用第27-28页
    4 研究目的、意义与内容第28-30页
    参考文献第30-35页
第二章 Gnαs和Gnα11基因在不同毛色绵羊皮肤组织中的表达分析第35-57页
    1 试验材料与方法第35-47页
        1.1 试验动物及样品采集第35页
        1.2 试验试剂、耗材及仪器第35-39页
            1.2.1 试验试剂及耗材第35-37页
                1.2.1.1 组织RNA提取及实时荧光定量所用的试剂及耗材第35-36页
                1.2.1.2 蛋白免疫印迹所用的试剂及耗材第36-37页
                1.2.1.3 免疫组织化学和免疫荧光所用的试剂及耗材第37页
            1.2.2 试验仪器第37-39页
                1.2.2.1 组织RNA提取及实时荧光定量所用的仪器第37-38页
                1.2.2.2 蛋白免疫印迹所用的仪器第38-39页
                1.2.2.3 免疫组织化学和免疫荧光所用仪器第39页
        1.3 试验方法第39-47页
            1.3.1 不同毛色绵羊皮肤总RNA的提取及鉴定第39-40页
                1.3.1.1 不同毛色绵羊皮肤组织总RNA的提取第39页
                1.3.1.2 反转录合成cDNA第39-40页
            1.3.2 Gnαs和Gnα11 mRNA在不同毛色绵羊皮肤中的相对表达量第40-42页
                1.3.2.1 普通PCR的扩增第40-41页
                1.3.2.2 实时荧光定量第41-42页
            1.3.3 Gnαs和Gnα11蛋白在不同毛色绵羊皮肤中的相对表达量第42-44页
            1.3.4 Gnαs和Gnα11蛋白在不同毛色绵羊皮肤中的定位分析第44-47页
                1.3.4.1 不同毛色绵羊皮肤组织的包埋及切片制作第44-45页
                1.3.4.2 不同毛色绵羊皮肤组织的免疫组织化学方法第45-46页
                1.3.4.3 不同毛色绵羊皮肤组织的免疫荧光方法第46-47页
    2 结果与分析第47-53页
        2.1 不同毛色绵羊皮肤总RNA的提取及鉴定第47-49页
            2.1.1 总RNA的检测结果第47页
            2.1.2 普通PCR扩增产物电泳结果第47-48页
            2.1.3 PCR扩增产物的测序结果第48-49页
            2.1.4 实时荧光定量PCR第49页
                2.1.4.1 Gnαs和Gnα11在mRNA水平的表达扩增曲线结果第49页
                2.1.4.2 Gnαs和Gnα11在mRNA水平的表达熔解曲线结果第49页
        2.2 Gnαs和Gnα11 mRNA在不同毛色绵羊皮肤中的相对表达量第49-50页
        2.3 Gnαs和Gnα11蛋白在不同毛色绵羊皮肤中的相对表达量第50-51页
            2.3.1 不同毛色绵羊皮肤总蛋白的提取及考马斯亮蓝的鉴定第50-51页
            2.3.2 Western blot检测不同毛色绵羊皮肤中Gnαs和Gnα11蛋白的表达量第51页
        2.4 Gnαs和Gnα11蛋白在不同毛色绵羊皮肤中的定位分析第51-53页
            2.4.1 免疫组织化学检测Gnαs和Gnα11蛋白在不同毛色绵羊皮肤中的表达定位第51-53页
            2.4.2 免疫荧光检测Gnαs和Gnα11蛋白在不同毛色绵羊皮肤中的表达定位第53页
    3 讨论第53-55页
    4 小结第55-56页
    参考文献第56-57页
第三章 基于iTRAQ技术在不同毛色绵羊皮肤中差异蛋白的筛选第57-69页
    1 试验材料与方法第57-62页
        1.1 试验动物及样品采集第57页
        1.2 试验试剂、耗材及仪器第57-59页
            1.2.1 试验试剂第57-59页
            1.2.2 试验耗材第59页
            1.2.3 试验仪器第59页
        1.3 试验方法第59-62页
            1.3.1 iTRAQ技术路线第59-60页
            1.3.2 绵羊皮肤组织总蛋白的提取及质量鉴定第60页
                1.3.2.1 绵羊皮肤组织总蛋白的提取第60页
                1.3.2.2 绵羊皮肤组织总蛋白的SDS-PAGE电泳第60页
            1.3.3 酶解和肽段定量第60-61页
            1.3.4 肽段标记第61页
            1.3.5 SCX分级第61页
            1.3.6 质谱分析第61页
                1.3.6.1 毛细管高效液相色谱第61页
                1.3.6.2 质谱鉴定第61页
            1.3.7 数据分析第61-62页
                1.3.7.1 数据库第61-62页
                1.3.7.2 Mascot搜索第62页
                1.3.7.3 定量分析第62页
    2 结果与分析第62-66页
        2.1 不同毛色绵羊皮肤组织中总蛋白的提取第62-63页
            2.1.1 蛋白样品浓度的检测结果第62页
            2.1.2 SDS-PAGE电泳检测结果第62-63页
        2.2 iTRAQ(LC-MS/MS)检测分析结果第63-66页
            2.2.1 酶解肽段定量结果第63页
            2.2.2 肽段SCX检测分级结果第63-64页
            2.2.3 LC MS/MS检测结果第64-66页
                2.2.3.1 定量统计第64页
                2.2.3.2 显著性差异蛋白质第64页
                2.2.3.3 定量比值直方分布分析第64-65页
                2.2.3.4 重复标记相关性分析第65-66页
    3 讨论第66-67页
    4 小结第67-68页
    参考文献第68-69页
第四章 不同毛色绵羊皮肤组织蛋白组数据的生物信息学分析第69-81页
    1 材料和方法第69-71页
        1.1 原始数据的获取和处理第69-70页
        1.2 Gene Ontology(GO)功能注释第70-71页
            1.2.1 序列比对(BLAST)第70页
            1.2.2 GO功能条目提取(Mapping)第70页
            1.2.3 功能注释(Annotation)第70页
            1.2.4 补充注释(Annotation augmentation)第70页
            1.2.5 GO功能注释统计第70页
            1.2.6 GOSlim注释与统计第70-71页
        1.3 KEGG通路注释第71页
        1.4 蛋白互作网络分析第71页
    2 结果与分析第71-77页
        2.1 不同毛色绵羊皮肤组织蛋白定量结果分析第71页
        2.2 Gene Ontology(GO)功能注释分析第71-75页
            2.2.1 序列比对(BLAST)统计分析第71-72页
            2.2.2 GO功能条目提取(Mapping)第72页
            2.2.3 功能注释(Annotation)第72-73页
            2.2.4 补充注释(Annotation augmentation)第73页
            2.2.5 GO功能注释统计第73-75页
        2.3 KEGG通路注释结果第75-76页
        2.4 蛋白质互作网络图第76-77页
    3 讨论第77-79页
    4 小结第79-80页
    参考文献第80-81页
第五章 血管紧张素Ⅱ在不同毛色绵羊皮肤中的表达差异第81-91页
    1 试验材料与方法第81-82页
        1.1 试验试剂、耗材及仪器第81页
        1.2 试验方法第81-82页
            1.2.1 Ang Ⅱ蛋白在不同毛色绵羊皮肤中的LC-MS/MS鉴定第81页
            1.2.2 Western blot检测Ang Ⅱ蛋白在不同毛色绵羊皮肤中的相对表达量第81页
            1.2.3 Ang Ⅱ蛋白在不同毛色绵羊皮肤中的定位分析第81页
            1.2.4 Ang ⅡmRNA在不同毛色绵羊皮肤中的相对表达量第81-82页
    2 结果与分析第82-87页
        2.1 Ang Ⅱ蛋白的LC-MS/MS鉴定结果第82页
        2.2 Western blot检测不同毛色绵羊皮肤中Ang Ⅱ蛋白的表达量第82-83页
        2.3 Ang Ⅱ蛋白在不同毛色绵羊皮肤中的定位分析第83-85页
        2.4 Ang ⅡmRNA在不同毛色绵羊皮肤中的相对表达量第85-87页
            2.4.1 不同毛色绵羊皮肤总RNA的提取及鉴定结果第85页
            2.4.2 普通PCR扩增产物电泳结果第85-86页
            2.4.3 实时荧光定量PCR第86-87页
                2.4.3.1 Ang ⅡmRNA水平的表达扩增曲线和熔解曲线结果第86页
                2.4.3.2 Ang ⅡmRNA在不同毛色绵羊皮肤中的相对表达量第86-87页
    3 讨论第87-88页
    4 小结第88-90页
    参考文献第90-91页
第六章 对ACTB和FGA差异蛋白在不同毛色绵羊皮肤中的验证分析第91-104页
    1 试验材料与方法第91-93页
        1.1 试验动物及样品采集第91页
        1.2 试验试剂、耗材及仪器第91页
        1.3 试验方法第91-93页
            1.3.1 ACTB和FGA蛋白在不同毛色绵羊皮肤中的LC-MS/MS鉴定第91-92页
            1.3.2 Western blot检测ACTB和FGA蛋白在不同毛色绵羊皮肤中的相对表达量第92页
            1.3.3 激光共聚焦检测ACTB和FGA蛋白在不同毛色绵羊皮肤中的表达定位分析第92-93页
            1.3.4 ACTB和FGA mRNA在不同毛色绵羊皮肤中的相对表达量第93页
    2 结果与分析第93-99页
        2.1 ACTB和FGA蛋白在不同毛色绵羊皮肤中LC-MS/MS的鉴定结果第93-94页
        2.2 Western blot检测ACTB和FGA蛋白在不同毛色绵羊皮肤中的相对表达量第94-95页
        2.3 激光共聚焦检测ACTB和FGA蛋白在不同毛色绵羊皮肤中的表达定位第95-98页
        2.4 QRT-PCT检测ACTB和FGA mRNA在不同毛色绵羊皮肤中的相对表达量第98-99页
            2.4.1 RT-PCR扩增产物电泳结果第98页
            2.4.2 QRT-PCR检测ACTB和FGA mRNA的相对表达量第98-99页
    3 讨论第99-101页
    4 小结第101-102页
    参考文献第102-104页
全文总结第104-105页
研究创新与展望第105-107页
Abstract第107-109页
附件1 蛋白质鉴定定量表第111-146页
附件2 酪氨酸代谢通路图第146-147页
附件3 氧化磷酸化通路图第147-148页
附件4 血小板代谢通路图第148-149页
中英文对照及缩写表第149-151页
在读期间的主要科研成绩第151-153页
致谢第153-154页

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