| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-9页 |
| 第1章 前言 | 第9-21页 |
| ·课题研究背景 | 第10-11页 |
| ·甲型流感病毒的国内外研究现状 | 第11-15页 |
| ·甲型流感病毒的复制和跨宿主传播 | 第11-12页 |
| ·甲型流感病毒在人群中的流行史 | 第12-13页 |
| ·甲型流感病毒的变异 | 第13-15页 |
| ·甲型流感病毒进化的国内外研究现状 | 第15-18页 |
| ·抗原图谱和聚集跳跃 | 第15-17页 |
| ·甲型流感病毒的进化速率 | 第17-18页 |
| ·甲型流感病毒H1N1进化的研究现状 | 第18-19页 |
| ·人群中流行的两种H1N1流感病毒 | 第19页 |
| ·课题研究的目的与意义 | 第19-21页 |
| 第2章 实验材料与方法 | 第21-25页 |
| ·甲型流感病毒抗原性进化的国内外研究进展 | 第21页 |
| ·HA蛋白序列的收集 | 第21-22页 |
| ·收集宿主为人的H1N1HA蛋白序列数据集 | 第21-22页 |
| ·收集2009墨西哥H1N1四个流行周期的血凝素蛋白HA序列数据 | 第22页 |
| ·收集由猪传染到人的H1N1以及人类季节性H1N1HA蛋白数据集 | 第22页 |
| ·实验分析流程图 | 第22-23页 |
| ·两类不同进化途径的H1N1对比分析 | 第23-24页 |
| ·序列比对及处理 | 第23页 |
| ·HA蛋白三维结构模建 | 第23-24页 |
| ·HA蛋白抗原表位氨基酸保守性计算与分析 | 第24页 |
| ·2009年墨西哥H1N1四个时期的进化分析与研究 | 第24-25页 |
| ·序列比对及处理 | 第24页 |
| ·Blast相似性比对 | 第24页 |
| ·氨基酸序列水平的差异分析 | 第24-25页 |
| 第3章 甲型流感病毒H1N1HA蛋白抗原表位预测模型的构建 | 第25-31页 |
| ·H1N1 HA蛋白抗原表位预测模型构建流程 | 第25-26页 |
| ·HA序列的比对处理 | 第26页 |
| ·构建系统进化树 | 第26页 |
| ·计算碱基突变概率矩阵 | 第26-27页 |
| ·计算氨基酸突变概率矩阵 | 第27-28页 |
| ·对给定的表位序列进行模拟预测 | 第28-29页 |
| ·本章小结 | 第29-31页 |
| 第4章 宿主为人的H1N1流感病毒HA蛋白潜在抗原表位的预测 | 第31-44页 |
| ·甲型H1N1流感病毒HA蛋白抗原性变化 | 第32-34页 |
| ·H1N1流感病毒的突变倾向性 | 第34-35页 |
| ·同一流行周期H1N1抗原表位的突变预测 | 第35-39页 |
| ·跨流行周期的预测结果 | 第39-40页 |
| ·预测2009墨西哥H1N1抗原表位可能会发生的突变 | 第40-42页 |
| ·本章小结 | 第42-44页 |
| 第5章 宿主为人的两类甲型H1N1流感病毒HA蛋白抗原表位及受体结合位点突变特性对比研究 | 第44-56页 |
| ·两类病毒的进化分析 | 第44-45页 |
| ·H1N1亚型HA蛋白抗原性位点差异分析 | 第45-50页 |
| ·两类H1N1病毒HA蛋白功能性位点的差异分析 | 第50-52页 |
| ·本章小结 | 第52-56页 |
| 第6章 2009墨西哥H1N1流感四个流行周期氨基酸突变分析 | 第56-57页 |
| 第7章 结论与展望 | 第57-60页 |
| ·全文总结 | 第57-58页 |
| ·研究展望 | 第58-60页 |
| 参考文献 | 第60-68页 |
| 附录 | 第68-78页 |
| 附录1 构建碱基突变概率矩阵程序 | 第68-72页 |
| 附录2 突变表位生成的程序 | 第72-76页 |
| 附录3 预测表位与对应时间收集真实表位的比较程序 | 第76-78页 |
| 致谢 | 第78-79页 |
| 攻读硕士学位期间已发表或录用的论文 | 第79页 |
