| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-10页 |
| 第1章 绪论 | 第10-16页 |
| ·研究目的和意义 | 第10-11页 |
| ·RNA二级结构比对研究的国内外现状 | 第11-13页 |
| ·论文的主要研究内容 | 第13-15页 |
| ·论文的组织结构 | 第15-16页 |
| 第2章 RNA二级结构比对的相关知识 | 第16-25页 |
| ·RNA二级结构的基本概念 | 第16-18页 |
| ·RNA | 第16页 |
| ·RNA二级结构 | 第16-18页 |
| ·RNA二级结构的表示 | 第18-21页 |
| ·序列相似性研究 | 第21-22页 |
| ·时间序列相似性研究 | 第22-24页 |
| ·本章小结 | 第24-25页 |
| 第3章 基于动态时间规整比对RNA二级结构 | 第25-36页 |
| ·引言 | 第25页 |
| ·RNA二级结构的数字特征时间序列表示 | 第25-30页 |
| ·基于DTW的RNA二级结构比对算法 | 第30-34页 |
| ·动态时间规整算法原理 | 第30-31页 |
| ·基于动态时间规整的RNA二级结构比对算法 | 第31-34页 |
| ·本章小结 | 第34-36页 |
| 第4章 带约束的加权动态时间规整比对RNA二级结构 | 第36-46页 |
| ·引言 | 第36页 |
| ·带约束的加权DTW算法比对RNA二级结构 | 第36-44页 |
| ·动态时间规整算法的优化方法 | 第36-37页 |
| ·带约束的DTW-RSC算法 | 第37-41页 |
| ·加权DTW-RSC算法 | 第41-43页 |
| ·带约束的加权DTW算法比对RNA二级结构 | 第43-44页 |
| ·本章小结 | 第44-46页 |
| 第5章 实验与结果 | 第46-56页 |
| ·实验环境 | 第46页 |
| ·DTW-RSC算法实验 | 第46-51页 |
| ·CWDTW-RSC算法实验 | 第51-55页 |
| ·带约束的动态时间规整算法实验 | 第52-53页 |
| ·加入权重调整机制的动态时间规整算法实验 | 第53-54页 |
| ·带约束的加权动态时间规整算法实验 | 第54-55页 |
| ·本章小结 | 第55-56页 |
| 结论 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-61页 |
| 致谢 | 第61页 |