| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 第1章 绪论 | 第9-13页 |
| ·课题背景及研究意义 | 第9-10页 |
| ·国内外研究现状 | 第10-11页 |
| ·论文研究内容 | 第11-12页 |
| ·论文的组织结构 | 第12-13页 |
| 第2章 RNA二级结构的表示及比对 | 第13-23页 |
| ·RNA二级结构和假结 | 第13-15页 |
| ·RNA二级结构的表示 | 第15-19页 |
| ·RNA二级结构间相似性比对的算法 | 第19-22页 |
| ·RNA二级结构间的BP距离 | 第19页 |
| ·RNA二级结构间的Hausdorff距离 | 第19-21页 |
| ·RNA二级结构间的树编辑距离 | 第21-22页 |
| ·本章小结 | 第22-23页 |
| 第3章 基于FL-HD算法比对RNA二级结构相似性 | 第23-31页 |
| ·双向Hausdorff距离 | 第23页 |
| ·RNA二级结构的平面坐标系表示 | 第23-25页 |
| ·基于Hausdorff距离的折线算法FL-HD | 第25-30页 |
| ·FL-HD算法的思想 | 第25-26页 |
| ·FL-HD算法的算法描述 | 第26-28页 |
| ·FL-HD折线距离与Hausdorff距离的比较 | 第28-30页 |
| ·FL-HD算法的时间复杂度分析 | 第30页 |
| ·本章小结 | 第30-31页 |
| 第4章 基于Cos-RNACompare算法比对RNA二级结构相似性 | 第31-37页 |
| ·假结问题的描述 | 第31页 |
| ·基于向量空间的余弦相似性算法Cos-RNACompare | 第31-36页 |
| ·余弦相似性与向量空间模型 | 第31-33页 |
| ·Cos-RNACompare算法的思想 | 第33-34页 |
| ·Cos-RNACompare算法的算法描述 | 第34-35页 |
| ·算法的时间复杂度分析 | 第35-36页 |
| ·本章小结 | 第36-37页 |
| 第5章 RNA二级结构相似性比对的实验结果及分析 | 第37-53页 |
| ·实验环境配置 | 第37页 |
| ·RNA二级结构数据集 | 第37-45页 |
| ·RNA二级结构数据来源及预测 | 第37-38页 |
| ·RNA二级结构预测软件参数设置 | 第38-42页 |
| ·RNA二级结构的数据预处理 | 第42-44页 |
| ·算法数据集的批处理 | 第44-45页 |
| ·RNA二级结构相似性比对的实验结果与分析 | 第45-52页 |
| ·FL-HD折线距离算法的实验结果与分析 | 第45-48页 |
| ·Cos-RNACompare余弦相似性算法的实验结果与分析 | 第48-51页 |
| ·Cos-RNACompare算法的全局性分析 | 第51-52页 |
| ·本章小结 | 第52-53页 |
| 结论 | 第53-55页 |
| 参考文献 | 第55-59页 |
| 致谢 | 第59页 |
