| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 第1章 绪论 | 第10-21页 |
| ·课题研究背景、目的和意义 | 第10-13页 |
| ·蛋白质功能性运动研究的背景及意义 | 第11-12页 |
| ·蛋白质去折叠研究的背景及意义 | 第12-13页 |
| ·蛋白质功能性运动研究的计算机模拟方法及研究进展 | 第13-15页 |
| ·分子动力学模拟在蛋白质功能性运动研究中的应用 | 第13页 |
| ·正则模分析及其简化方法在蛋白质功能性运动研究中的应用 | 第13-15页 |
| ·蛋白质折叠/去折叠的计算机模拟方法及研究进展 | 第15-19页 |
| ·蛋白质折叠机理 | 第15-17页 |
| ·分子动力学模拟在蛋白质折叠研究中的应用 | 第17-18页 |
| ·粗粒化模型方法在蛋白质折叠研究中的应用 | 第18-19页 |
| ·论文的研究内容和整体安排 | 第19-21页 |
| 第2章 弹性网络模型的基本理论 | 第21-26页 |
| ·高斯网络模型 | 第21-23页 |
| ·各向异性网络模型 | 第23-25页 |
| ·本章小结 | 第25-26页 |
| 第3章 基于弹性网络模型的维生素B12转运蛋白功能性运动研究 | 第26-40页 |
| ·引言 | 第26-27页 |
| ·维生素B12转运蛋白的结构 | 第27-29页 |
| ·基本原理与方法 | 第29-31页 |
| ·基于弹性网络模型的正则模分析方法的改进 | 第29-31页 |
| ·蛋白质功能残基识别的微扰方法 | 第31页 |
| ·计算结果与讨论 | 第31-38页 |
| ·慢运动模式的分析 | 第31-35页 |
| ·功能性运动的分析 | 第35-36页 |
| ·与功能相关的关键残基的预测 | 第36-38页 |
| ·本章小结 | 第38-40页 |
| 第4章 MCPC603抗体FAB片段结构固有力学特征分析及去折叠路径研究 | 第40-50页 |
| ·引言 | 第40页 |
| ·MCPC603抗体结构 | 第40-41页 |
| ·基本原理与方法 | 第41-43页 |
| ·迭代的高斯网络模型 | 第42-43页 |
| ·结果与讨论 | 第43-48页 |
| ·温度因子(B-factor)理论计算与实验结果的比较 | 第43页 |
| ·McPC603抗体Fab片段结构固有动力学特征分析 | 第43-44页 |
| ·McPC603抗体Fab片段结构的柔性分析 | 第44-46页 |
| ·McPC603抗体Fab片段结构的去折叠过程分析 | 第46-48页 |
| ·本章小结 | 第48-50页 |
| 结论 | 第50-52页 |
| 参考文献 | 第52-63页 |
| 攻读硕士学位期间承担的科研任务与主要成果 | 第63-64页 |
| 致谢 | 第64页 |
