| 本论文创新点 | 第1-9页 |
| 摘要 | 第9-11页 |
| ABSTRACT | 第11-14页 |
| 第一章 绪论 | 第14-47页 |
| ·表观遗传学现象—DNA修饰 | 第14-28页 |
| ·DNA胞嘧啶甲基化修饰 | 第14-16页 |
| ·DNA胞嘧啶去甲基化机制的研究历史 | 第16-19页 |
| ·DNA胞嘧啶羟甲基化修饰 | 第19-21页 |
| ·DNA胞嘧啶醛基化修饰和羧基化修饰 | 第21-22页 |
| ·5-mC氧化衍生物在DNA去甲基化过程中扮演的功能角色 | 第22-25页 |
| ·5-hmC、5-foC和5-caC潜在的生物学功能 | 第25-28页 |
| ·检测5-mC及其氧化衍生物含量的方法 | 第28-43页 |
| ·薄层色谱法 | 第29-30页 |
| ·基于抗体的检测方法 | 第30-32页 |
| ·基于限制性内切酶的检测方法 | 第32页 |
| ·液相色谱法 | 第32-33页 |
| ·毛细管电泳法 | 第33-35页 |
| ·气相色谱-质谱联用法 | 第35-36页 |
| ·液相色谱-质谱联用法 | 第36-38页 |
| ·基于化学衍生化的检测方法 | 第38-43页 |
| ·论文的选题依据、研究意义和研究内容 | 第43-47页 |
| 第二章 气相色谱-质谱联用法检测DNA胞嘧啶修饰：酵母基因组DNA中普遍存在着胞嘧啶甲基化修饰 | 第47-64页 |
| ·前言 | 第47-49页 |
| ·实验部分 | 第49-52页 |
| ·化学试剂 | 第49页 |
| ·酵母菌培养和药物处理 | 第49-50页 |
| ·酵母DNA提取 | 第50-51页 |
| ·衍生化 | 第51页 |
| ·用GC/MS分析酵母基因组DNA的甲基化 | 第51-52页 |
| ·酵母基因组DNA甲基化的百分比的计算 | 第52页 |
| ·统计学分析 | 第52页 |
| ·结果与讨论 | 第52-62页 |
| ·GC/MS法建立的过程 | 第52-55页 |
| ·衍生化条件优化 | 第55-56页 |
| ·方法学验证 | 第56-58页 |
| ·定量分析16种酵母基因组DNA中的甲基化水平 | 第58-59页 |
| ·不同生长时期的酵母基因组DNA中的甲基化水平 | 第59-61页 |
| ·5-氮杂胞苷对酵母基因组DNA甲基化水平的影响 | 第61-62页 |
| ·结论 | 第62-64页 |
| 第三章 酶标记法选择性地富集5-羟甲基胞嘧啶及其在液相色谱-质谱联用检测中的应用 | 第64-83页 |
| ·前言 | 第64-66页 |
| ·实验部分 | 第66-71页 |
| ·化学试剂 | 第66-67页 |
| ·细胞培养 | 第67页 |
| ·DNA提取 | 第67-68页 |
| ·样品制备和固相萃取(Solid-Phase Extraction,SPE) | 第68-69页 |
| ·制备5-gmdC标准品 | 第69-70页 |
| ·分析哺乳动物和酵母细胞基因组DNA中的5-hmC | 第70-71页 |
| ·结果与讨论 | 第71-82页 |
| ·核苷混合物对5-hmdC质谱响应的影响 | 第71-73页 |
| ·SPE-LC-MS/MS法分析5-hmdC | 第73-77页 |
| ·方法学验证 | 第77-79页 |
| ·定量分析人类细胞系和酵母菌基因组DNA中的5-hmC | 第79-82页 |
| ·结论 | 第82-83页 |
| 第四章 化学衍生化结合液相色谱-质谱联用技术检测植物DNA中的5-甲基胞嘧啶的氧化衍生物 | 第83-106页 |
| ·前言 | 第83-86页 |
| ·实验部分 | 第86-90页 |
| ·化学试剂 | 第86页 |
| ·植物样品和环境胁迫处理 | 第86-87页 |
| ·基因组DNA的提取和酶消解 | 第87-88页 |
| ·化学衍生化 | 第88-89页 |
| ·分析植物基因组DNA样品中的5-fodC和5-cadC | 第89-90页 |
| ·结果与讨论 | 第90-105页 |
| ·化学衍生化 | 第90-94页 |
| ·化学衍生化条件优化 | 第94-98页 |
| ·衍生化对5-fodC和5-cadC检测灵敏度的增强 | 第98-100页 |
| ·方法学验证 | 第100-101页 |
| ·检测植物组织基因组DNA中的5-fodC和5-cadC | 第101-103页 |
| ·环境胁迫对植物基因组DNA中的5-fodC和5-cadC的影响 | 第103-105页 |
| ·结论 | 第105-106页 |
| 第五章 化学衍生化结合液相色谱-质谱联用技术对结直肠癌组织DNA主动去甲基途径中的5-甲基胞嘧啶及其氧化衍生物的全分析 | 第106-127页 |
| ·前言 | 第106-109页 |
| ·实验部分 | 第109-112页 |
| ·化学试剂 | 第109-110页 |
| ·结直肠癌病人组织样本 | 第110页 |
| ·DNA提取和酶解 | 第110-111页 |
| ·化学衍生化优化 | 第111-112页 |
| ·统计学分析 | 第112页 |
| ·结果与讨论 | 第112-126页 |
| ·化学衍生化 | 第112-114页 |
| ·化学衍生化条件优化 | 第114-118页 |
| ·衍生化对分离度和灵敏度的改善 | 第118-121页 |
| ·方法学验证 | 第121-122页 |
| ·结直肠癌样本DNA中四种修饰核苷的检测 | 第122-126页 |
| ·结论 | 第126-127页 |
| 第六章 总结与展望 | 第127-132页 |
| ·总结 | 第127-129页 |
| ·展望 | 第129-132页 |
| 参考文献 | 第132-148页 |
| 攻博期间发表和待发表的科研成果 | 第148-149页 |
| 后记/致谢 | 第149-150页 |
