| 致谢 | 第1-6页 |
| 摘要 | 第6-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 专业词汇中英文对照表 | 第8-9页 |
| 目录 | 第9-11页 |
| 引言 | 第11-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-20页 |
| ·高通量测序技术介绍 | 第12-14页 |
| ·454测序技术 | 第12-13页 |
| ·SOLEXA测序技术 | 第13页 |
| ·SOLID测序技术 | 第13页 |
| ·高通量测序技术的应用 | 第13-14页 |
| ·基因芯片技术介绍及其应用 | 第14页 |
| ·基因表达谱数据分析方法概述 | 第14-19页 |
| ·数据预处理 | 第14-15页 |
| ·差异表达基因分析 | 第15-16页 |
| ·聚类分析 | 第16-17页 |
| ·判别分析 | 第17页 |
| ·主成份分析(Principal Component Analysis) | 第17-18页 |
| ·基因调控网络的分析 | 第18页 |
| ·基因表达数据网络资源 | 第18-19页 |
| ·基因表达谱数据分析软件 | 第19页 |
| ·本章小结 | 第19-20页 |
| 第二章 基因分析工厂(FOGA)系统的设计 | 第20-28页 |
| ·基因分析工厂的需求分析 | 第20-23页 |
| ·基因分析工厂的概要设计 | 第23-25页 |
| ·基因分析工厂构架的组成 | 第23页 |
| ·基因分析工厂任务执行数据流程 | 第23-24页 |
| ·基因分析工厂的任务状态 | 第24-25页 |
| ·基因分析工厂的关系数据库设计 | 第25-26页 |
| ·基因分析工厂数据库表 | 第25页 |
| ·基因分析工厂数据库表之间的关系 | 第25-26页 |
| ·本章小结 | 第26-28页 |
| 第三章 材料与方法 | 第28-30页 |
| ·开发环境 | 第28页 |
| ·开发技术 | 第28页 |
| ·基因表达谱分析方法 | 第28-29页 |
| ·测试数据 | 第29页 |
| ·本章小结 | 第29-30页 |
| 第四章 结果与讨论 | 第30-48页 |
| ·登录系统 | 第30-31页 |
| ·基本的分析Pipeline | 第31-39页 |
| ·基因重要性排序 | 第39-42页 |
| ·构建基因调控网络 | 第42-47页 |
| ·本章小结 | 第47-48页 |
| 第五章 总结与展望 | 第48-50页 |
| 参考文献 | 第50-56页 |
| 作者简介及在学期间发表的学术论文与科研成果 | 第56页 |