基于网络层面考察自然选择作用
| 致谢 | 第1-6页 |
| 摘要 | 第6-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 专业词汇中英文对照表 | 第8-9页 |
| 目录 | 第9-11页 |
| 第一章 引言 | 第11-19页 |
| ·群体遗传学 | 第12-13页 |
| ·人类的近期适应性进化 | 第13-14页 |
| ·分子生物学网络 | 第14-15页 |
| ·蛋白质网络 | 第15-19页 |
| ·蛋白质网络 | 第15-17页 |
| ·蛋白质网络的进化 | 第17-19页 |
| 第二章 应用的知识点和工具 | 第19-33页 |
| ·群体遗传学基本知识点 | 第19-21页 |
| ·自然选择的类型 | 第19页 |
| ·遗传效应 | 第19页 |
| ·检验方法 | 第19-21页 |
| ·蛋白质网络基本知识点 | 第21-25页 |
| ·蛋白质网络数据的获得和网络构建 | 第21-22页 |
| ·蛋白质网络度量的基本方法 | 第22-25页 |
| ·蛋白质交互作用数据库 | 第25-26页 |
| ·应用的公共数据 | 第26-28页 |
| ·HapMap Project | 第26-27页 |
| ·1000 Genomes Project | 第27-28页 |
| ·应用的各种工具 | 第28-30页 |
| ·Cytoscape | 第28-29页 |
| ·Annovar | 第29页 |
| ·TreeFam | 第29页 |
| ·Pfam | 第29页 |
| ·miRBase,Targetscan | 第29-30页 |
| ·UniProtKB | 第30页 |
| ·DAVID | 第30页 |
| ·其他 | 第30-33页 |
| 第三章 构建蛋白质网络 | 第33-39页 |
| ·收集数据 | 第33-36页 |
| ·人类受选择基因数据的收集 | 第33-34页 |
| ·蛋白质互作数据的收集 | 第34-36页 |
| ·构建并可视化蛋白质网络 | 第36-37页 |
| ·网络基本特性查看 | 第37-39页 |
| 第四章 人类受选择基因在网络中的特性研究 | 第39-57页 |
| ·受选择基因在网络中的定位问题 | 第40-48页 |
| ·受选择基因在网络中的度分布 | 第41-45页 |
| ·千人基因组数据进行结果验证 | 第45-46页 |
| ·结果的再次验证 | 第46-48页 |
| ·近期受选择基因和远期受选择基因 | 第48-52页 |
| ·近期受选择基因和远期受选择基因间的围绕关系 | 第48-49页 |
| ·基因家族 | 第49-51页 |
| ·基因表达情况 | 第51-52页 |
| ·受选择基因在网络分布中的疏密程度 | 第52-57页 |
| 第五章 结论 | 第57-61页 |
| ·结果 | 第57-58页 |
| ·受选择基因集总体倾向于落入网络中央 | 第57页 |
| ·远期受选择基因和近期受选择基因间的关系 | 第57-58页 |
| ·受选择基因间互相聚集 | 第58页 |
| ·讨论 | 第58-61页 |
| 参考文献 | 第61-67页 |
| 附录 | 第67-75页 |
| 作者简介及在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第75页 |
