| 摘要 | 第1-13页 |
| Abstract | 第13-19页 |
| 缩略词表 | 第19-21页 |
| 第一章 研究背景与立题依据 | 第21-37页 |
| ·研究背景 | 第21-35页 |
| ·海洋微生物资源 | 第21-24页 |
| ·海洋环境 | 第21-22页 |
| ·海洋微生物 | 第22页 |
| ·海洋微生物多样性 | 第22-24页 |
| ·细菌分类学 | 第24-33页 |
| ·细菌分类学中的基本概念 | 第24-26页 |
| ·细菌的分类地位 | 第26-27页 |
| ·细菌分类学研究进展 | 第27-28页 |
| ·细菌多相分类学研究方法 | 第28-33页 |
| ·微生物基因组学 | 第33-35页 |
| ·微生物基因组学概念 | 第33-34页 |
| ·微生物基因组学研究进展及意义 | 第34-35页 |
| ·立题依据与研究内容 | 第35-37页 |
| 第二章 中国南海深海沉积物来源菌株CF12-14的多相分类学研究 | 第37-61页 |
| ·引言 | 第37-38页 |
| ·材料和方法 | 第38-52页 |
| ·实验材料与设备 | 第38-42页 |
| ·菌株样品及对照菌株 | 第38页 |
| ·培养基 | 第38-39页 |
| ·主要试剂和试剂盒 | 第39-41页 |
| ·主要仪器 | 第41-42页 |
| ·数据库及分析软件 | 第42页 |
| ·实验方法 | 第42-52页 |
| ·样品采集及其环境 | 第42-43页 |
| ·菌株的分离和保存 | 第43页 |
| ·形态学特征 | 第43-44页 |
| ·生理生化特征 | 第44-46页 |
| ·化学分类特征 | 第46-49页 |
| ·基因型特征 | 第49-52页 |
| ·结果与分析 | 第52-55页 |
| ·形态学特征 | 第52页 |
| ·生理生化特征 | 第52-53页 |
| ·化学分类特征 | 第53-54页 |
| ·基因型特征 | 第54-55页 |
| ·讨论 | 第55-61页 |
| 第三章 南冲绳海槽深海沉积物来源菌株D25的多相分类学研究 | 第61-71页 |
| ·引言 | 第61页 |
| ·材料和方法 | 第61-65页 |
| ·实验材料 | 第61-62页 |
| ·菌株样品及对照菌株 | 第61-62页 |
| ·培养基 | 第62页 |
| ·主要试剂和试剂盒 | 第62页 |
| ·主要仪器 | 第62页 |
| ·数据库及分析软件 | 第62页 |
| ·实验方法 | 第62-65页 |
| ·样品采集 | 第62页 |
| ·菌株的分离和保存 | 第62-63页 |
| ·形态学特征 | 第63页 |
| ·生理生化特征 | 第63-64页 |
| ·化学分类特征 | 第64-65页 |
| ·基因型特征 | 第65页 |
| ·结果与分析 | 第65-67页 |
| ·形态学特征 | 第65-66页 |
| ·生理生化特征 | 第66页 |
| ·化学分类特征 | 第66页 |
| ·基因型特征 | 第66-67页 |
| ·讨论 | 第67-71页 |
| 第四章 北极深海沉积物来源菌株BSs20135的多相分类学研究 | 第71-85页 |
| ·引言 | 第71页 |
| ·材料和方法 | 第71-76页 |
| ·实验材料 | 第71-72页 |
| ·菌株样品及对照菌株 | 第71页 |
| ·培养基 | 第71-72页 |
| ·主要试剂和试剂盒 | 第72页 |
| ·主要仪器 | 第72页 |
| ·数据库及分析软件 | 第72页 |
| ·实验方法 | 第72-76页 |
| ·样品采集 | 第72页 |
| ·菌株的分离和保存 | 第72页 |
| ·形态学特征 | 第72-73页 |
| ·生理生化特征 | 第73页 |
| ·化学分类特征 | 第73页 |
| ·基因型特征 | 第73-76页 |
| ·结果与分析 | 第76-79页 |
| ·形态学特征 | 第76页 |
| ·生理生化特征 | 第76-77页 |
| ·化学分类特征 | 第77-78页 |
| ·基因型特征 | 第78-79页 |
| ·讨论 | 第79-85页 |
| 第五章 南极海洋沉积物来源菌株S3-22的多相分类学研究 | 第85-95页 |
| ·引言 | 第85页 |
| ·材料和方法 | 第85-89页 |
| ·实验材料 | 第85-86页 |
| ·菌株样品及对照菌株 | 第85-86页 |
| ·培养基 | 第86页 |
| ·主要试剂和试剂盒 | 第86页 |
| ·主要仪器 | 第86页 |
| ·数据库及分析软件 | 第86页 |
| ·实验方法 | 第86-89页 |
| ·样品采集 | 第86页 |
| ·菌株的分离和保存 | 第86-87页 |
| ·形态学特征 | 第87页 |
| ·生理生化特征 | 第87-88页 |
| ·化学分类特征 | 第88页 |
| ·基因型特征 | 第88-89页 |
| ·结果与分析 | 第89-91页 |
| ·形态学特征 | 第89页 |
| ·生理生化特征 | 第89-90页 |
| ·化学分类特征 | 第90页 |
| ·基因型特征 | 第90-91页 |
| ·讨论 | 第91-95页 |
| 第六章 中国南海深海细菌E407-8的多相分类学研究和基因组学分析 | 第95-115页 |
| ·引言 | 第95页 |
| ·材料和方法 | 第95-101页 |
| ·实验材料 | 第95-96页 |
| ·菌株样品及对照菌株 | 第95页 |
| ·培养基 | 第95-96页 |
| ·主要试剂和试剂盒 | 第96页 |
| ·主要仪器 | 第96页 |
| ·数据库及分析软件 | 第96页 |
| ·实验方法 | 第96-101页 |
| ·样品采集及其环境 | 第96页 |
| ·菌株的分离和保存 | 第96-97页 |
| ·形态学特征 | 第97页 |
| ·生理生化特征 | 第97页 |
| ·化学分类特征 | 第97-98页 |
| ·基因型特征 | 第98页 |
| ·菌体培养及基因组DNA提取 | 第98页 |
| ·基因组DNA的文库构建及测序 | 第98-99页 |
| ·测序数据处理 | 第99-100页 |
| ·测序序列拼接 | 第100页 |
| ·基因预测及分析 | 第100-101页 |
| ·结果与分析 | 第101-107页 |
| ·多项分类学分析 | 第101-103页 |
| ·形态学特征 | 第101-102页 |
| ·生理生化特征 | 第102页 |
| ·化学分类特征 | 第102-103页 |
| ·基因型特征 | 第103页 |
| ·基因组分析 | 第103-107页 |
| ·基因组概况 | 第104页 |
| ·代谢途径分析 | 第104-105页 |
| ·胞外酶谱分析 | 第105-107页 |
| ·鞭毛和运动性 | 第107页 |
| ·CRISPR | 第107页 |
| ·讨论 | 第107-115页 |
| ·多相分类学 | 第107-112页 |
| ·基因组学 | 第112-115页 |
| 全文总结与展望 | 第115-117页 |
| 参考文献 | 第117-129页 |
| 在读期间发表的论文 | 第129-131页 |
| 致谢 | 第131-132页 |
| 附件 | 第132-175页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第175页 |
