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胸膜肺炎放线杆菌JL03株的全基因组测序与flp操纵子的结构分析

摘要第1-9页
Abstract第9-11页
缩略语表(Abbreviation)第11-12页
第1章 文献综述第12-38页
   ·猪传染性胸膜肺炎的概述第12-21页
     ·病原学第12-14页
     ·流行病学第14页
     ·猪传染性胸膜肺炎的诊断第14-20页
     ·猪传染性胸膜肺炎的防制第20-21页
   ·胸膜肺炎放线杆菌毒力因子的研究进展第21-27页
     ·外毒素第21-23页
     ·荚膜第23-24页
     ·脂多糖第24页
     ·外膜蛋白第24-25页
     ·转铁结合蛋白第25页
     ·脲酶第25-26页
     ·蛋白酶第26页
     ·黏附因子第26-27页
   ·病原菌基因功能研究方法进展第27-38页
     ·自然突变第27页
     ·化学诱变技术第27-28页
     ·转座子突变第28-29页
     ·同源重组第29-30页
     ·STM第30-31页
     ·SCOTS第31-32页
     ·DFI第32-33页
     ·IVET第33-34页
     ·IVIAT第34-38页
第2章 胸膜肺炎放线杆菌血清3型JL03株全基因组测序与初步拼接第38-46页
   ·研究目的及意义第38-39页
   ·实验材料第39-41页
     ·菌株第39-40页
     ·寡核甘酸引物第40页
     ·培养基第40页
     ·主要试剂第40-41页
   ·实验方法第41-42页
     ·细菌的增殖第41页
     ·琼脂糖扩散实验第41页
     ·细菌基因组提取及测序文库构建第41-42页
     ·文库测序第42页
     ·序列初步拼接第42页
   ·结果与分析第42-44页
     ·测序用基因组鉴定第42-43页
     ·文库构建、质量评估及大规模测序第43-44页
     ·序列初步拼接第44页
   ·讨论第44-45页
   ·结论第45-46页
第3章 胸膜肺炎放线杆菌flp操纵子的结构分析第46-57页
   ·研究目的及意义第46页
   ·实验材料第46-48页
     ·菌株第46-47页
     ·寡核甘酸引物第47页
     ·培养基第47页
     ·主要试剂第47-48页
   ·实验方法第48-50页
     ·细菌的增殖第48页
     ·细菌PCR模板制备第48页
     ·PCR扩增第48-49页
     ·flp操纵子结构分析第49页
     ·细菌RNA提取第49-50页
     ·反转录PCR第50页
     ·透射电镜实验第50页
   ·结果与分析第50-55页
     ·flp操纵子结构分析及序列比较第50-53页
     ·flp操纵子完整性的验证(DNA和RNA水平)第53-55页
     ·胸膜肺炎放线杆菌Flp菌毛检测第55页
   ·讨论第55-56页
   ·结论第56-57页
第4章 胸膜肺炎放线杆菌血清1型4074株tadA缺失突变体构建第57-72页
   ·研究目的及意义第57页
   ·实验材料第57-60页
     ·菌株和质粒第57-58页
     ·寡核甘酸引物第58页
     ·培养基第58-59页
     ·主要试剂第59-60页
   ·实验方法第60-63页
     ·细菌的增殖第60页
     ·细菌PCR模板制备第60页
     ·PCR扩增第60-61页
     ·限制性酶切第61页
     ·从凝胶中回收目的片段第61页
     ·DNA片断的连接第61页
     ·感受态的制备及转化第61-62页
     ·碱裂解法小量制备质粒DNA第62页
     ·胸膜肺炎放线杆菌电转感受态细胞的制备及转化第62-63页
     ·接合转移与胸膜肺炎放线杆菌缺失株的构建第63页
   ·结果与分析第63-70页
     ·重组自杀质粒pBIISK(+)LRscm构建第63-66页
     ·重组自杀质粒pBIISK(+)LRscm电转化APP及缺失菌株筛选第66-67页
     ·重组自杀质粒pEMOC2LR构建第67-68页
     ·重组自杀质粒pEMOC2LR电转化APP及缺失菌株筛选第68-69页
     ·结合转移转化pEMOC2LR进入APP及缺失菌株筛选第69-70页
   ·讨论第70-71页
   ·结论第71-72页
参考文献第72-86页
致谢第86-87页
附录第87页

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