| 致谢 | 第1-6页 |
| 前言 | 第6-7页 |
| 摘要 | 第7-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 插图和附表清单 | 第9-10页 |
| 缩略词和术语表 | 第10-11页 |
| 目次 | 第11-14页 |
| 1 绪论 | 第14-29页 |
| ·分子系统进化分析 | 第14-19页 |
| ·系统进化研究历史 | 第14页 |
| ·氨基酸及核苷酸序列的比对 | 第14-17页 |
| ·系统发育树的构建 | 第17-19页 |
| ·动物线粒体基因组 | 第19-23页 |
| ·线粒体研究历史 | 第19-21页 |
| ·动物线粒体基因组分子结构 | 第21-22页 |
| ·线粒体基因组研究现状 | 第22-23页 |
| ·海底热液口甲壳类动物 | 第23-25页 |
| ·海底热液口概况 | 第23-24页 |
| ·海底热液口甲壳类 | 第24-25页 |
| ·分子生物钟机理 | 第25-29页 |
| ·果蝇的分子生物钟 | 第25-26页 |
| ·脊椎动物的分子生物钟 | 第26-28页 |
| ·甲壳动物亚门生物钟研究现状 | 第28-29页 |
| 2 柯氏绒铠虾(Shinkaia crosnieri)线粒体全基因组解析 | 第29-47页 |
| ·引言 | 第29-30页 |
| ·材料 | 第30-31页 |
| ·实验材料 | 第30页 |
| ·主要试剂 | 第30页 |
| ·主要仪器 | 第30-31页 |
| ·主要软件 | 第31页 |
| ·方法 | 第31-36页 |
| ·基因组DNA提取 | 第31-32页 |
| ·部分线粒体基因片段的扩增 | 第32页 |
| ·线粒体全基因组的获得 | 第32-33页 |
| ·长段基因间序列确定 | 第33页 |
| ·基因组注释及序列分析 | 第33页 |
| ·密码子使用和核苷酸组成 | 第33-34页 |
| ·基因重排分析 | 第34-35页 |
| ·系统进化分析 | 第35-36页 |
| ·结果与讨论 | 第36-47页 |
| ·柯氏绒铠虾线粒体基因组的分子结构 | 第36页 |
| ·蛋白编码基因和rRNA基因 | 第36-39页 |
| ·tRNA基因 | 第39-42页 |
| ·核苷酸组成和密码子使用 | 第42-43页 |
| ·十足目及泛甲壳类线粒体基因组基因顺序 | 第43-44页 |
| ·系统进化分析 | 第44-47页 |
| 3 深海汤花蟹(Austinograea yunohana)线粒体全基因组解析 | 第47-60页 |
| ·引言 | 第47页 |
| ·材料 | 第47-49页 |
| ·实验材料 | 第48页 |
| ·主要试剂 | 第48页 |
| ·主要仪器 | 第48页 |
| ·主要软件 | 第48-49页 |
| ·方法 | 第49-51页 |
| ·基因组DNA提取 | 第49页 |
| ·部分线粒体基因片段的扩增 | 第49-50页 |
| ·线粒体全基因组的获得 | 第50页 |
| ·基因组注释及序列分析 | 第50-51页 |
| ·密码子使用和核苷酸组成 | 第51页 |
| ·系统进化分析 | 第51页 |
| ·结果与讨论 | 第51-60页 |
| ·深海汤花蟹线粒体基因组的分子结构 | 第51-52页 |
| ·蛋白编码基因和rRNA基因 | 第52-55页 |
| ·tRNA基因 | 第55-56页 |
| ·核苷酸组成和密码子使用 | 第56-57页 |
| ·系统进化分析 | 第57-60页 |
| 4 罗氏沼虾Clock基因(Mar-Clock)的分子解析及表达分析 | 第60-76页 |
| ·引言 | 第60-61页 |
| ·材料 | 第61-63页 |
| ·实验材料 | 第61页 |
| ·主要试剂 | 第61-62页 |
| ·主要仪器 | 第62页 |
| ·主要软件 | 第62-63页 |
| ·方法 | 第63-67页 |
| ·总RNA提取及单链cDNA合成 | 第63页 |
| ·Mar-Clock部分基因片段的获得 | 第63-64页 |
| ·全长cDNA的获得 | 第64-65页 |
| ·RT-PCR组织表达分析 | 第65-66页 |
| ·半定量RT-PCR分析 | 第66页 |
| ·序列比较与进化分析 | 第66-67页 |
| ·结果与讨论 | 第67-76页 |
| ·Ear-Clock基因的分子结构 | 第67-71页 |
| ·Ear-Clock在不同组织间的表达 | 第71-72页 |
| ·摘除眼柄(EA)、常光(LL)及常暗(DD)对Mar-Clock表达的影响 | 第72-74页 |
| ·由Mar-CLOCK反映的进化关系 | 第74-76页 |
| 5 结论与展望 | 第76-78页 |
| ·结论 | 第76-77页 |
| ·有待开展的工作 | 第77-78页 |
| 参考文献 | 第78-83页 |
| 主要创新点 | 第83-84页 |
| 附录1 柯氏绒铠虾(Shinkaia crosnieri)线粒体基因组全序列 | 第84-92页 |
| 附录2 深海汤花蟹(Austinograea yunohana)线粒体基因组全序列 | 第92-100页 |
| 附录3 常用试剂配制 | 第100-103页 |
| 作者简历 | 第103页 |
