| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-14页 |
| 第一章 前言 | 第14-33页 |
| 1 蚌科研究概况 | 第14-20页 |
| ·蚌科动物的生活习性与生态功能 | 第14-17页 |
| ·栖息地与食性 | 第14-15页 |
| ·生活史和繁殖生物学 | 第15页 |
| ·生态学功能和经济学意义 | 第15-17页 |
| ·蚌科系统学研究 | 第17-19页 |
| ·全球蚌科各亚科之间的关系 | 第17-18页 |
| ·中国蚌科动物各亚科之间的关系 | 第18-19页 |
| ·蛏蚌属的分类及存在的问题 | 第19-20页 |
| 2 分子系统学与遗传多样性研究 | 第20-27页 |
| ·分子标记及其在蚌科系统学和遗传多样性研究中的应用 | 第21-27页 |
| ·DNA序列分析 | 第21-25页 |
| ·基于PCR的分子标记 | 第25-27页 |
| 3 分子系统学、遗传多样性二者与保护生物学之间的关系 | 第27-29页 |
| ·分子系统学与生物保护学之间的关系 | 第27-28页 |
| ·遗传多样性与生物保护学之间的关系 | 第28-29页 |
| 4 系统发育树的构建方法 | 第29-31页 |
| ·最小进化(Minimum-Evolution,ME)法 | 第29-30页 |
| ·邻接法(Neighbor-JoiningMethod,NJ) | 第30页 |
| ·最大简约法(Maximum Parsimony,MP) | 第30页 |
| ·最大似然法(Maximum Likelihood,ML) | 第30页 |
| ·构建分子系统树的软件 | 第30-31页 |
| 5 本研究的目的与意义 | 第31-33页 |
| 第二章 基于线粒体基因序列的蚌科系统学与遗传多样性研究 | 第33-65页 |
| 1 基于线粒体基因CO1序列的蚌科系统学与遗传多样性研究 | 第34-52页 |
| ·材料和方法 | 第34-40页 |
| ·材料 | 第34-37页 |
| ·方法 | 第37-40页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第37-39页 |
| ·PCR扩增 | 第39页 |
| ·PCR产物序列测定 | 第39-40页 |
| ·数据分析 | 第40页 |
| ·结果分析 | 第40-49页 |
| ·基因组DNA提取结果 | 第40-41页 |
| ·PCR扩增 | 第41-42页 |
| ·测序结果 | 第42页 |
| ·碱基组成及序列变异 | 第42-44页 |
| ·种内与种间遗传距离的分析 | 第44-47页 |
| ·分子系统树分析 | 第47-49页 |
| ·讨论 | 第49-52页 |
| ·CO1序列变异与遗传多样性分析 | 第49-50页 |
| ·各亚科之间的关系 | 第50页 |
| ·各属间的关系 | 第50-51页 |
| ·蛏蚌属的分类地位 | 第51-52页 |
| 2 基于线粒体基因ND1序列的蚌科系统学与遗传多样性研究 | 第52-63页 |
| ·材料和方法 | 第52-53页 |
| ·结果分析 | 第53-61页 |
| ·PCR扩增结果 | 第53页 |
| ·测序结果 | 第53-54页 |
| ·ND1基因的碱基组成及序列变异 | 第54-56页 |
| ·种内与种间遗传距离的分析 | 第56-59页 |
| ·分子系统树分析 | 第59-61页 |
| ·讨论 | 第61-63页 |
| ·ND1序列变异与遗传多样性分析 | 第61-62页 |
| ·各亚科之间的关系 | 第62页 |
| ·各属间的关系 | 第62页 |
| ·蛏蚌属的分类地位 | 第62-63页 |
| 本章小结 | 第63-65页 |
| 第三章 基于核糖体基因内转录间隔区序列的蚌科系统学与遗传多样性研究 | 第65-83页 |
| 1 材料和方法 | 第65-67页 |
| ·材料 | 第65页 |
| ·方法 | 第65-67页 |
| ·基因组DNA的提取及质量检测 | 第65-66页 |
| ·ITS1和ITS2部分序列的PCR扩增和测序 | 第66-67页 |
| ·数据的分析和处理 | 第67页 |
| 2 结果分析 | 第67-80页 |
| ·PCR扩增结果 | 第67-68页 |
| ·测序结果 | 第68页 |
| ·ITS1基因的碱基组成及序列变异 | 第68-69页 |
| ·ITS2基因的碱基组成及序列变异 | 第69-71页 |
| ·ITS1基因的种群间的遗传距离及遗传多样性分析 | 第71-74页 |
| ·ITS2基因的种群间的遗传距离及遗传多样性分析 | 第74-77页 |
| ·分子系统树分析 | 第77-80页 |
| 3 讨论 | 第80-82页 |
| ·序列变异与遗传多样性分析 | 第80页 |
| ·亚科与属间关系的分析 | 第80-81页 |
| ·蛏蚌属的分类地位 | 第81-82页 |
| 4 小结 | 第82-83页 |
| 第四章 基于微卫星标记的蚌科遗传多样性和系统学分析 | 第83-94页 |
| 1 材料和方法 | 第83-88页 |
| ·材料 | 第83-88页 |
| ·基因组DNA的提取与检测 | 第84页 |
| ·PCR扩增 | 第84-85页 |
| ·聚丙烯酞胺凝胶电泳 | 第85-87页 |
| ·电泳结果检测 | 第87-88页 |
| ·数据的统计分析 | 第88页 |
| 2 结果和分析 | 第88-92页 |
| ·PCR扩增结果 | 第88页 |
| ·遗传多样性分析 | 第88-90页 |
| ·遗传距离与聚类分析 | 第90-92页 |
| 3 讨论 | 第92-93页 |
| ·蚌的群体遗传多样性 | 第92页 |
| ·各种蚌的系统发育关系 | 第92-93页 |
| 4 小结 | 第93-94页 |
| 第五章 总结 | 第94-97页 |
| 1 中国蚌科的系统发育关系 | 第94页 |
| 2 中国蚌科的遗传多样性特征 | 第94-95页 |
| 3 蛏蚌属的种间关系 | 第95页 |
| 4 不同基因序列研究结果的比较 | 第95页 |
| 5 进一步研究的方向 | 第95-97页 |
| 参考文献 | 第97-110页 |
| 图版1 蚌科各物种外形图 | 第110-113页 |
| 附录1 部分物种测序结果的截图 | 第113-115页 |
| 致谢 | 第115-116页 |
| 攻读学位期间的研究成果 | 第116页 |
