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稻瘟病菌Rab5互作蛋白研究

摘要第1-12页
Abstract第12-14页
1 前言第14-36页
   ·小G 蛋白的结构第14页
   ·小G 蛋白的功能第14-16页
   ·Rab 蛋白家族第16-23页
     ·Rab家族蛋白的结构第17-18页
     ·Rab蛋白的定位第18页
     ·Rab 白的功能第18-20页
     ·Rab5蛋白及其效应因子第20-23页
       ·Rab5蛋白的分布第21页
       ·Rab5a的效应因子第21页
       ·Rab5蛋白的功能第21-23页
   ·蛋白质间的相互作用及研究方法第23-34页
     ·酵母双杂交系统第24-28页
       ·酵母双杂交原理第24-25页
       ·酵母双杂交系统的应用第25-26页
       ·酵母双杂交系体系的局限性及扩展第26-28页
     ·免疫共沉淀技术第28-29页
       ·免疫共沉淀的原理第28-29页
       ·免疫共沉淀的应用及局限性第29页
     ·Pull-down技术第29-30页
       ·Pull-down技术的原理第30页
       ·Pull-down技术的应用及其局限性第30页
     ·串联亲和纯化技术第30-34页
       ·串联亲和纯化技术的原理第31-32页
       ·串联亲和纯化技术的应用及其局限性第32-34页
   ·本课题的研究意义第34-36页
     ·稻瘟病菌中的Rab蛋白第34-35页
     ·MoRab5效应因子第35-36页
2 材料与方法第36-65页
   ·材料第36-42页
     ·主要化学试剂及实验材料第36页
     ·各种酶、分子量标准及试剂盒第36页
     ·供试菌株及质粒第36-41页
     ·培养基第41-42页
   ·方法第42-65页
     ·载体构建第42-47页
       ·E.coli DH5α感受态细胞的制备第42页
       ·质粒DNA 的提取第42-43页
       ·PCR第43页
       ·PCR 产物回收、酶切和连接第43-44页
       ·质粒酶切与连接第44页
       ·感受态细胞的转化第44-45页
       ·稻瘟病菌或稻瘟病菌侵染后的水稻叶片RNA 的提取第45-46页
       ·RT-PCR第46-47页
     ·稻瘟病菌菌丝cDNA 文库的筛选第47-53页
       ·酵母菌株Y187感受态细胞的制备第47页
       ·酵母小量转化第47-48页
       ·酵母质粒提取第48页
       ·重组质粒的分子验证第48-49页
       ·重组质粒对Y187细胞毒性检测第49页
       ·重组质粒的自激活活性检测第49页
       ·酵母交配第49-50页
       ·酵母双倍体的筛选第50页
       ·互作阳性克隆子的验证第50-51页
       ·互作克隆子的回复杂交验证第51-52页
       ·互作克隆子的双杂交验证第52页
       ·阳性克隆子cDNA 片段的测序第52-53页
     ·互作蛋白的生物信息学分析第53页
       ·蛋白质理化特性分析第53页
       ·蛋白质结构功能域预测第53页
       ·蛋白基序(Motif)的搜索第53页
     ·互作蛋白的筛选及验证第53-59页
       ·蛋白在大肠杆菌内的诱导表达第53-54页
       ·SDS-PAGE检测第54-55页
       ·His pull-down筛选MoRab5的互作蛋白第55-58页
       ·GST融合蛋白的诱导与纯化(微量法)第58-59页
     ·实时定量PCR第59-61页
       ·实时定量 PCR 引物的设计第59页
       ·cDNA 的合成第59-60页
       ·最佳退火温度的确定第60-61页
     ·MoRab5可能互作蛋白的功能研究第61-65页
       ·敲除载体的构建第61页
       ·稻瘟病菌原生质体的制备第61-62页
       ·稻瘟病菌原生质体转化和转化子筛选第62页
       ·稻瘟病菌基因组DNA 的快速提取第62-63页
       ·敲除突变体的表型分析及鉴定第63-65页
3 结果与分析第65-91页
   ·稻瘟病菌MoRab5正显性激活诱饵载体的构建第65-67页
   ·激活型MoRab5-BD诱饵对酵母细胞毒性和自激活活性检测第67-69页
   ·MoRab5的互作蛋白的筛选第69-73页
   ·阳性克隆的测序及分析第73-75页
   ·His pull-down筛选MoRab5 的互作蛋白第75-77页
     ·pET-28a-MoRab5重组质粒的构建第75-76页
     ·pET-28a-MoRab5融合蛋白的诱导表达与纯化第76-77页
     ·Western blot鉴定第77页
     ·His Pull-down第77页
   ·质谱结果第77-88页
   ·互作蛋白的qRT-PCR分析第88-90页
   ·Rab5可能互作蛋白的功能研究第90-91页
4 小结与讨论第91-96页
   ·MoRab5互作蛋白可能是复杂的网络系统第91-93页
   ·酵母双杂交结果分析第93-96页
     ·假阳性和假阴性的产生第93页
     ·X-α-gal检测第93-94页
     ·酵母转化方法以及酵母质粒提取第94页
     ·关于筛库的一些策略及体系评价第94-96页
5 下一步研究工作及展望第96-97页
   ·下一步研究工作第96页
   ·展望第96-97页
参考文献第97-109页
附录1 若干几丁质结合蛋白基因的功能研究第109-115页
附录2 本研究中所用的引物第115-119页
附录3 酵母双杂交测序结果第119-125页
附录4 各种主要试剂与缓冲液的配制第125-138页
附录5 Pull down 结果肽段匹配表第138-142页
附录6 MoRab5 互作蛋白 GO(gene ontology)分类表第142-154页
致谢第154页

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