| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-8页 |
| 1 前言 | 第8-27页 |
| ·基因组学 | 第8页 |
| ·基因芯片(Micro-Array)技术 | 第8-11页 |
| ·基因芯片技术概述 | 第8-10页 |
| ·基因芯片技术的实际应用 | 第10-11页 |
| ·基因网络技术 | 第11-17页 |
| ·基因网络技术的概念 | 第11页 |
| ·基因网络技术的原理 | 第11-12页 |
| ·基因调控网络 | 第12-13页 |
| ·酵母基因网络的主要调控模式 | 第13-14页 |
| ·调控网络的主要模型 | 第14-16页 |
| ·基因网络的研究现状与发展 | 第16-17页 |
| ·生物信息学 | 第17-22页 |
| ·生物信息学的发展阶段和研究方向 | 第18页 |
| ·生物信息学的研究现状 | 第18-19页 |
| ·生物信息学的研究内容 | 第19页 |
| ·生物信息学的发展趋势 | 第19-22页 |
| ·酿酒酵母的基因组信息 | 第22-24页 |
| ·酿酒酵母的基因组研究现状 | 第22页 |
| ·Tup1基因的基本生物学信息 | 第22-24页 |
| ·Tup1局部基因网络(LGN)及其非线性(Nonlinear) | 第24页 |
| ·课题的研究背景 | 第24-25页 |
| ·课题的研究目的和意义 | 第25-27页 |
| ·课题研究的目的 | 第25-26页 |
| ·课题的研究意义 | 第26-27页 |
| 2 材料与方法 | 第27-38页 |
| ·实验材料 | 第28-33页 |
| ·突变芯片实验数据 | 第28页 |
| ·PC计算机 | 第28页 |
| ·课题用到的软件 | 第28-32页 |
| ·相关生物信息学数据库 | 第32-33页 |
| ·实验方法与步骤(图2-7) | 第33-38页 |
| ·确定酵母蛋白互相作用(Physical Interaction)来源数据库 | 第34页 |
| ·从源数据库检索查找到与Tup1相关的蛋白作用基因 | 第34-36页 |
| ·Tup1中心的局部网络建立 | 第36页 |
| ·利用Osprey软件可视化展示局部蛋白作用网络的结构层次 | 第36-37页 |
| ·芯片数据对局部基因网络的赋值 | 第37页 |
| ·节点基因的生物学信息收集 | 第37页 |
| ·网络结构与及节点表达状况分析 | 第37页 |
| ·建立课题芯片数据库 | 第37页 |
| ·结构验证和模型检验改进 | 第37-38页 |
| 3 结果与讨论 | 第38-57页 |
| ·基因转录抑制网络 | 第38页 |
| ·Tup1局部基因网络的建立和结构 | 第38-40页 |
| ·局部网络基因的表达表达变化 | 第40-48页 |
| ·突变芯片的数据表达状况 | 第40-44页 |
| ·芯片中表达明显变化基因的表达变化和聚类分析 | 第44-48页 |
| ·突变芯片中，局部网络基因表达变化的非线性变化 | 第48-57页 |
| ·必需基因与非必需基因的表达变化差异 | 第48-50页 |
| ·局部基因网络中不同网络层次基因的表达变化 | 第50-52页 |
| ·节点数高低与基因表达变化幅度之间的关系 | 第52-53页 |
| ·Tup1突变引起染色体水平上的表达变化差异 | 第53-57页 |
| 4 结论 | 第57-58页 |
| 5 展望 | 第58-59页 |
| 6 参考文献 | 第59-63页 |
| 7 攻读硕士学位期间发表论文情况 | 第63-64页 |
| 8 致谢 | 第64-65页 |
| 9 附录 | 第65-68页 |
