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镉胁迫下菜心的转录组分析

摘要第3-5页
Abstract第5-7页
第一章 前言第11-17页
    1.1 重金属镉的毒害第11页
        1.1.1 镉的来源、污染程度第11页
        1.1.2 镉的毒害作用第11页
    1.2 植物吸收以及转运镉的途径第11-13页
    1.3 植物响应镉胁迫途径第13-15页
    1.4 不同品种农作物对重金属的积累能力的差异第15页
    1.5 研究意义第15-17页
第二章 实验材料与方法第17-27页
    2.1 实验材料第17-20页
        2.1.1 菜心品种第17页
        2.1.2 实验仪器设备第17-18页
        2.1.3 实验试剂第18页
        2.1.4 引物第18-20页
    2.2 实验方法第20-27页
        2.2.1 镉处理下各品种菜心种子萌发实验第20页
        2.2.2 镉处理下对菜心幼苗生长的测定第20-21页
        2.2.3 地上部、根部镉含量的测定第21-22页
        2.2.4 菜心转录组的高通量测序第22-23页
        2.2.5 转录组生物信息学分析流程第23-25页
        2.2.6 Nramp家族基因的进化树构建第25-27页
第三章 结果与分析第27-51页
    3.1 镉胁迫下菜心种子萌发、幼苗生长的影响以及镉积累情况第27-33页
        3.1.1 镉胁迫对菜心种子萌发的影响第27-30页
        3.1.2 镉胁迫下菜心幼苗生长以及镉含量第30-33页
    3.2 菜心油青49品种转录组的高通量测序第33-41页
        3.2.1 测序数据质量评估第33-35页
        3.2.2 转录组数据与参考基因组比对第35-37页
        3.2.3 基因表达水平分析、差异表达基因的筛选第37页
        3.2.4 差异表达基因功能注释、分类、富集分析第37-41页
    3.3 菜心镉胁迫响应的相关GO条目第41-46页
    3.4 RT-qPCR验证分析第46-48页
    3.5 Nramp家族基因第48-51页
        3.5.1 Nramp进化树第48-49页
        3.5.2 克隆菜心的Nramp家族基因第49-51页
第四章 讨论第51-56页
    4.1 不同品种菜心镉的耐受性以及积累差异第51-52页
    4.2 Brassicarapa作为菜心的参考基因组第52页
    4.3 响应镉胁迫的GO条目第52-54页
    4.4 响应镉胁迫的KEGG途径第54-55页
    4.5 Nramp基因家族与镉吸收转运相关第55-56页
结论第56-57页
参考文献第57-63页
附录第63-76页
致谢第76页

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