| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-21页 |
| 1. 土壤抑菌作用研究进展 | 第11-20页 |
| 1.1 土壤抑菌作用的定义及其演变 | 第11-12页 |
| 1.2 土壤抑菌作用的研究方法 | 第12-14页 |
| 1.3 土壤抑真菌作用的基本特征 | 第14-15页 |
| 1.4 土壤抑真菌作用的机制 | 第15-17页 |
| 1.5 土壤抑真菌作用的解除 | 第17-18页 |
| 1.6 土壤抑菌作用亟待研究的科学问题 | 第18-20页 |
| 2. 本文的研究内容、目的和意义 | 第20-21页 |
| 第二章 土壤抑细菌作用检测方法的构建及抑菌作用检测 | 第21-33页 |
| 1. 实验材料 | 第21-23页 |
| 1.1 菌株及质粒 | 第21-22页 |
| 1.2 试剂及培养基配制 | 第22-23页 |
| 1.3 主要仪器 | 第23页 |
| 2. 实验方法 | 第23-27页 |
| 2.1 B.amyloliquefaciens ZY-9-13菌株的荧光蛋白基因标记 | 第23-24页 |
| 2.2 B.amyloliquefaciens ZY-9-13-gfp菌株的遗传稳定性 | 第24页 |
| 2.3 B.amyloliquefaciens ZY-9-13-gfp菌株的抑菌活性及杀线虫活性检测 | 第24-25页 |
| 2.4 植烟土壤对B.amyloliquefaciens ZY-9-13-gfp抑菌作用的检测 | 第25-27页 |
| 3. 结果与分析 | 第27-32页 |
| 3.1 B.amyloliquefaciens ZY-9-13菌株的荧光蛋白基因标记及其稳定性 | 第27页 |
| 3.2 B.amyloliquefaciens ZY-9-13及B.amyloliquefaciens ZY-9-13-gfp菌株的抑菌活性及杀线虫活性比较 | 第27-28页 |
| 3.3 植烟土壤对B.amyloliquefaciens ZY-9-13-gfp抑菌作用 | 第28-32页 |
| 4. 讨论 | 第32-33页 |
| 第三章 Arthrobotrys oligospora ATCC24927应答土壤抑菌作用的转录组学分析 | 第33-72页 |
| 1. A. oligospora ATCC24927分生孢子RNA关联样本的制备 | 第33-39页 |
| 1.1 实验材料 | 第33-35页 |
| 1.2 实验方法 | 第35-37页 |
| 1.3 实验结果 | 第37-39页 |
| 2. 关联样本Total RNA的转录组测序及差异基因筛选 | 第39-43页 |
| 2.1 实验材料 | 第39页 |
| 2.2 实验方法 | 第39-40页 |
| 2.3 实验结果 | 第40-43页 |
| 3. 氨气处理组的差异表达基因信息学分析 | 第43-55页 |
| 3.1 分析方法 | 第43页 |
| 3.2 结果与分析 | 第43-50页 |
| 3.3 讨论 | 第50-54页 |
| 3.4 小结 | 第54-55页 |
| 4. 苯甲醛处理组的差异表达基因信息学分析 | 第55-68页 |
| 4.1 分析方法 | 第55页 |
| 4.2 结果与分析 | 第55-62页 |
| 4.3 讨论 | 第62-67页 |
| 4.4 小结 | 第67-68页 |
| 5. 苯甲醛处理组与氨气处理组独有差异表达基因的比较分析 | 第68-72页 |
| 5.1 共有的差异表达基因 | 第68-69页 |
| 5.2 独有的差异表达基因 | 第69-70页 |
| 5.3 GO和Kegg Pathway的富集分析 | 第70-71页 |
| 5.4 小结 | 第71-72页 |
| 第四章 解除土壤抑制A.oligospora ATCC24927的转录组学分析 | 第72-85页 |
| 1. 材料与方法 | 第72-74页 |
| 1.1 菌株及土样采集 | 第72页 |
| 1.2 土壤浸提悬浊液的制备 | 第72-73页 |
| 1.3 透析袋的预处理 | 第73页 |
| 1.4 土壤悬浊液抑制下不萌发孢子样本的制备 | 第73页 |
| 1.5 葡萄糖解除抑制的孢子样本制备 | 第73-74页 |
| 1.6 孢子样本的Total RNA提取及测序 | 第74页 |
| 1.7 差异表达基因信息学分析方法 | 第74页 |
| 2. 结果与分析 | 第74-83页 |
| 2.1 抑制解除前后孢子关联样本的制备 | 第74-75页 |
| 2.2 关联样本Total RNA的检测 | 第75-76页 |
| 2.3 样品间差异表达基因的筛选和统计 | 第76-77页 |
| 2.4 两处理组间差异表达基因比较 | 第77-78页 |
| 2.5 差异表达基因的GO富集分析 | 第78-81页 |
| 2.6 差异表达基因的Kegg Pathway富集分析 | 第81-83页 |
| 3. 讨论 | 第83-84页 |
| 4. 小结 | 第84-85页 |
| 参考文献 | 第85-92页 |
| 附录 | 第92-101页 |
| 致谢 | 第101页 |
