摘要 | 第3-4页 |
ABSTRACT | 第4-5页 |
第1章 文献综述 | 第9-23页 |
1.1 引言 | 第9页 |
1.2 生物冶金细菌学概述 | 第9-12页 |
1.2.1 冶金微生物研究进展 | 第10-11页 |
1.2.2 冶金微生物基因组学研究进展 | 第11-12页 |
1.3 细胞对重金属离子的抗性机制研究 | 第12-15页 |
1.3.1 重金属的微生物转化 | 第13-14页 |
1.3.2 金属硫蛋白 | 第14页 |
1.3.3 重金属输出系统 | 第14-15页 |
1.4 微生物基因组学 | 第15-20页 |
1.4.1 基因组测序技术的进展 | 第16-19页 |
1.4.2 微生物基因组研究常用数据库 | 第19-20页 |
1.4.3 重金属离子抗性的抗性基因研究 | 第20页 |
1.5 钼的用途 | 第20-21页 |
1.6 钼的微生物浸出 | 第21页 |
1.7 本研究的目的与意义 | 第21-22页 |
1.8 本研究的内容 | 第22-23页 |
第2章 LM4-216S r DNA序列分析与生理生化特性研究 | 第23-35页 |
2.1 引言 | 第23页 |
2.2 材料与方法 | 第23-29页 |
2.2.1 培养基 | 第23页 |
2.2.2 实验试剂 | 第23-24页 |
2.2.3 实验仪器 | 第24-25页 |
2.2.4 样品和来源 | 第25页 |
2.2.5 菌种分离纯化 | 第25页 |
2.2.6 菌种 16S rDNA扩增,克隆,测序 | 第25-29页 |
2.2.7 最适pH值的测定 | 第29页 |
2.2.8 钼酸钠对菌株生长的影响 | 第29页 |
2.2.9 加钼和不加钼生长曲线的测定 | 第29页 |
2.3 结果与分析 | 第29-34页 |
2.3.1 菌落形态特征 | 第29-30页 |
2.3.2 16S r DNA电泳检测 | 第30页 |
2.3.3 重组质粒的电泳检测 | 第30-31页 |
2.3.4 基于 16S rDNA序列LM4-2 系统发育分析 | 第31-32页 |
2.3.5 pH对LM4-2 生长的影响 | 第32页 |
2.3.6 温度对LM4-2 生长的影响 | 第32-33页 |
2.3.7 钼酸钠对LM4-2 生长的影响 | 第33页 |
2.3.8 加钼和不加钼LM4-2 生长曲线的测定 | 第33-34页 |
2.4 本章小结 | 第34-35页 |
第3章 Bacillus sp.LM4-2 全基因组序列分析 | 第35-46页 |
3.1 引言 | 第35页 |
3.2 材料与方法 | 第35-36页 |
3.2.1 全基因组测序 | 第35页 |
3.2.2 基因的预测与注释 | 第35页 |
3.2.3 基因组功能分析 | 第35-36页 |
3.3 结果与分析 | 第36-45页 |
3.3.1 LM4-2 基因组DNA电泳检测 | 第36页 |
3.3.2 Bacillus sp.LM4-2 基因组图谱 | 第36-37页 |
3.3.3 基因组特征分析 | 第37-38页 |
3.3.4 编码蛋白亚细胞定位 | 第38-39页 |
3.3.5 COG分类 | 第39-40页 |
3.3.6 Bacillus sp.LM4-2 的KEGG分析 | 第40页 |
3.3.7 代谢途径基因分析 | 第40-42页 |
3.3.8 碳代谢 | 第42页 |
3.3.9 氮和硫代谢 | 第42-43页 |
3.3.10 转运与信号传导 | 第43-44页 |
3.3.11 遗传信息传递 | 第44页 |
3.3.12 鞭毛和趋化性 | 第44页 |
3.3.13 其他代谢分析 | 第44-45页 |
3.4 本章小结 | 第45-46页 |
第4章 结论 | 第46-47页 |
参考文献 | 第47-54页 |
缩略语词汇表 | 第54-55页 |
致谢 | 第55-56页 |
攻读学位期间的研究成果 | 第56页 |