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Bacillus sp.LM4-2分离鉴定与全基因组分析

摘要第3-4页
ABSTRACT第4-5页
第1章 文献综述第9-23页
    1.1 引言第9页
    1.2 生物冶金细菌学概述第9-12页
        1.2.1 冶金微生物研究进展第10-11页
        1.2.2 冶金微生物基因组学研究进展第11-12页
    1.3 细胞对重金属离子的抗性机制研究第12-15页
        1.3.1 重金属的微生物转化第13-14页
        1.3.2 金属硫蛋白第14页
        1.3.3 重金属输出系统第14-15页
    1.4 微生物基因组学第15-20页
        1.4.1 基因组测序技术的进展第16-19页
        1.4.2 微生物基因组研究常用数据库第19-20页
        1.4.3 重金属离子抗性的抗性基因研究第20页
    1.5 钼的用途第20-21页
    1.6 钼的微生物浸出第21页
    1.7 本研究的目的与意义第21-22页
    1.8 本研究的内容第22-23页
第2章 LM4-216S r DNA序列分析与生理生化特性研究第23-35页
    2.1 引言第23页
    2.2 材料与方法第23-29页
        2.2.1 培养基第23页
        2.2.2 实验试剂第23-24页
        2.2.3 实验仪器第24-25页
        2.2.4 样品和来源第25页
        2.2.5 菌种分离纯化第25页
        2.2.6 菌种 16S rDNA扩增,克隆,测序第25-29页
        2.2.7 最适pH值的测定第29页
        2.2.8 钼酸钠对菌株生长的影响第29页
        2.2.9 加钼和不加钼生长曲线的测定第29页
    2.3 结果与分析第29-34页
        2.3.1 菌落形态特征第29-30页
        2.3.2 16S r DNA电泳检测第30页
        2.3.3 重组质粒的电泳检测第30-31页
        2.3.4 基于 16S rDNA序列LM4-2 系统发育分析第31-32页
        2.3.5 pH对LM4-2 生长的影响第32页
        2.3.6 温度对LM4-2 生长的影响第32-33页
        2.3.7 钼酸钠对LM4-2 生长的影响第33页
        2.3.8 加钼和不加钼LM4-2 生长曲线的测定第33-34页
    2.4 本章小结第34-35页
第3章 Bacillus sp.LM4-2 全基因组序列分析第35-46页
    3.1 引言第35页
    3.2 材料与方法第35-36页
        3.2.1 全基因组测序第35页
        3.2.2 基因的预测与注释第35页
        3.2.3 基因组功能分析第35-36页
    3.3 结果与分析第36-45页
        3.3.1 LM4-2 基因组DNA电泳检测第36页
        3.3.2 Bacillus sp.LM4-2 基因组图谱第36-37页
        3.3.3 基因组特征分析第37-38页
        3.3.4 编码蛋白亚细胞定位第38-39页
        3.3.5 COG分类第39-40页
        3.3.6 Bacillus sp.LM4-2 的KEGG分析第40页
        3.3.7 代谢途径基因分析第40-42页
        3.3.8 碳代谢第42页
        3.3.9 氮和硫代谢第42-43页
        3.3.10 转运与信号传导第43-44页
        3.3.11 遗传信息传递第44页
        3.3.12 鞭毛和趋化性第44页
        3.3.13 其他代谢分析第44-45页
    3.4 本章小结第45-46页
第4章 结论第46-47页
参考文献第47-54页
缩略语词汇表第54-55页
致谢第55-56页
攻读学位期间的研究成果第56页

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