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扬子鳄饲养种群交配体系及对种群遗传多样性的影响

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
第一章 绪论第12-26页
    1 爬行动物多父性现象及形成机制第12-20页
        1.1 爬行动物多父性现象第12-14页
        1.2 爬行动物精子储存与多父性第14-15页
        1.3 MHC与性选择第15-17页
        1.4 交配体系对种群遗传多样性的影响第17-20页
    2 交配体系研究手段第20-24页
        2.1 用于亲子鉴定的遗传标记第20-21页
        2.2 微卫星DNA的获得及应用第21-22页
        2.3 第二代测序技术在动物保护中的应用第22-24页
    3 本研究目的与意义第24-26页
        3.1 研究目的第24-25页
        3.2 研究意义第25-26页
第二章 基于微卫星分子标记的扬子鳄交配体系研究第26-42页
    1 前言第26-27页
    2 材料与方法第27-33页
        2.1 实验材料第27-29页
        2.2 实验方法第29-33页
    3 实验结果第33-38页
        3.1 基因分型第33-36页
        3.2 亲权分析第36-38页
        3.3 窝仔数与父亲个数第38页
    4 讨论第38-42页
        4.1 非损伤性取样方法的应用第38-40页
        4.2 多父性繁殖策略第40-42页
第三章 多父性——扬子鳄遗传多样性的维持机制第42-58页
    1 前言第42-43页
    2 材料与方法第43-44页
        2.1 实验材料第43页
        2.2 实验方法第43-44页
    3 实验结果第44-55页
        3.1 不同交配体系等位基因及频率第44-46页
        3.2 遗传变异、遗传分化和遗传多样性分析第46-47页
        3.3 配偶关系及近交系数分析第47-55页
        3.4 父权分析第55页
    4 讨论第55-58页
        4.1 多父性对种群遗传多样性的维持第55-56页
        4.2 父权不均等与精子竞争第56页
        4.3 饲养鳄繁殖管理和保护策略第56-58页
第四章 基于全基因组重测序的扬子鳄的遗传变异研究第58-72页
    1 前言第58-59页
    2 材料与方法第59-64页
        2.1 实验材料第59页
        2.2 实验方法第59-64页
    3 实验结果第64-70页
        3.1 原始测序数据reads统计及质控第64-65页
        3.2 测序数据统计结果第65-68页
        3.3 主成分分析第68-69页
        3.4 遗传进化树第69-70页
    4. 讨论第70-72页
第五章 不同交配体系下扬子鳄后代的遗传差异分析第72-83页
    1 前言第72-73页
    2 材料与方法第73-74页
        2.1 实验材料第73页
        2.2 实验方法第73-74页
    3 实验结果第74-79页
        3.1 遗传指标统计第74-75页
        3.2 基于不同交配体系的全基因组候选差异基因第75-78页
        3.3 不同交配体系MHC区域的差异基因第78-79页
    4 讨论第79-83页
        4.1 不同交配体系的扬子鳄差异基因第79-81页
        4.2 交配体系与杂合子优势第81-83页
第六章 主要结论与展望第83-85页
    1 主要结论第83-84页
    2 研究展望第84-85页
附件第85-125页
    附件1 多父性后代基因分型结果第85-107页
    附件2 单父性后代基因分型结果第107-121页
    附件3 长乐保护点野生鳄94第121-122页
    附件4 F2代基因分型结果第122-125页
参考文献第125-139页
博士在读期间发表学术论文与获奖情况第139-140页
后记第140页

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