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甲基胞嘧啶加双氧酶3(TET3)在红系终末分化中的作用及机制研究

中文摘要第4-9页
Abstract第9-14页
第一章 概述第19-38页
    1.1 文献综述第19-28页
        1.1.1 前言第19-20页
        1.1.2 TET家族的特征第20-22页
        1.1.3 5-m C与 5-hm C的关系:第22-23页
        1.1.4 TETs介导的DNA去甲基化的潜在机制第23-24页
        1.1.5 5-m C、5-hm C和TET家族在人血液恶性肿瘤中的研究第24-27页
        1.1.6 血液恶性肿瘤的DNA甲基化修饰第27页
        1.1.7 结论和展望第27-28页
    1.2 研究目的与意义第28-29页
    1.3 研究内容第29-31页
    参考文献第31-38页
第二章 人类红系终末分化中基因甲基化水平的动态变化第38-52页
    2.1 前言第38-41页
        2.1.1 红系分化进程中的调控机制第38-39页
        2.1.2 基因甲基化的检测方法第39-40页
        2.1.3 本研究的成果及意义第40-41页
    2.2 材料与方法第41-46页
        2.2.1 实验材料第41-43页
        2.2.2 实验方法第43-46页
    2.3 实验结果第46-50页
        2.3.1 人类红系终末分化过程中细胞内基因呈现累积性去甲基化变化第46-47页
        2.3.2 红系终末分化进程中特定分化阶段细胞基因甲基化的动态变化第47-48页
        2.3.3 人类红系终末分化特定阶段基因甲基化改变发生位置分析第48-49页
        2.3.4 红系终末分化进程中发生甲基化改变的基因的分析第49-50页
    2.4 讨论第50-52页
第三章 TET3在人类红系分化中的功能研究第52-80页
    3.1 前言第52-54页
        3.1.1 基因甲基化状态的调节机制第52-53页
        3.1.2 基因甲基化对细胞发育的研究进展第53-54页
        3.1.3 本研究的成果及意义第54页
    3.2 材料与方法第54-67页
        3.2.1 实验材料第54-57页
        3.2.2 实验方法第57-67页
    3.3 实验结果第67-76页
        3.3.1 TET家族在人类红系分化进程中的表达第67-68页
        3.3.2 用携带sh RNA的慢病毒进行TET3敲低实验第68-69页
        3.3.3 TET3敲低对红系早期分化无明显影响第69-71页
        3.3.4 TET3敲低使人类红系终末分化延迟第71-72页
        3.3.5 TET3敲低使红系分化至脱核阶段脱核减少第72-73页
        3.3.6 TET3敲低后双核或多核细胞出现增多第73-74页
        3.3.7 TET3敲低后引起的双核或多核细胞只出现在poly和ortho期第74-75页
        3.3.8 TET3敲低后使增殖减少第75页
        3.3.9 TET3敲低促进人类红系分化进程中出现凋亡第75-76页
    3.4 讨论第76-80页
第四章 TET3在人类红系终末分化中的作用机制探讨第80-127页
    4.1 前言第80-83页
        4.1.1 正常红系终末分化过程中的形态学特征第80页
        4.1.2 细胞核形态改变机制第80-81页
        4.1.3 RNA-seq分析及其意义第81页
        4.1.4 ATAC-seq分析及其意义第81-82页
        4.1.5 本研究的成果及意义第82-83页
    4.2 材料与方法第83-107页
        4.2.1 实验材料第83-86页
        4.2.2 实验方法第86-107页
    4.3 实验结果第107-124页
        4.3.1 分选红系终末分化过程各特定阶段有核红细胞第107-108页
        4.3.2 质谱检测各特定阶段有核红细胞 5-m C和 5-hm C第108-109页
        4.3.3 分选各期有核红细胞提取RNA并进行质量分析第109-110页
        4.3.4 应用生物信息学对转录组变化进行分析的步骤第110-111页
        4.3.5 应用生物信息学对转录组测序结果的一致性进行分析第111页
        4.3.6 TET3敲低主要影响红系终末分化晚期阶段的基因表达第111-112页
        4.3.7 TET3敲低后KLHDC8B的表达下降第112-114页
        4.3.8 构建KLHDC8B sh RNA载体并敲低KLHDC8B表达第114-115页
        4.3.9 KLHDC8B敲低后红系终末分化晚期表型与TET3敲低一致第115-117页
        4.3.10 构建KLHDC8B过表达载体并在TET3敲低后过表达KLHDC8B第117-118页
        4.3.11 过表达KLHDC8B可以补救TET3敲低引起的细胞双核或多核现象第118-120页
        4.3.12 TET3敲低不影响KLHDC8B启动子甲基化状态第120-122页
        4.3.13 TET3敲低后对染色质可接近性的影响第122-124页
    4.4 讨论第124-127页
第五章 Tet3功能的体内验证第127-141页
    5.1 前言第127-128页
        5.1.1 小鼠体内实验及Cre鼠的意义第127页
        5.1.2 Tet3体内功能研究进展第127-128页
        5.1.3 本研究的进展及意义第128页
    5.2 材料与方法第128-131页
        5.2.1 实验材料第128-129页
        5.2.2 实验方法第129-131页
    5.3 实验结果第131-139页
        5.3.1 小鼠体内红系终末分化进程中出现基因去甲基化的变化趋势第131-132页
        5.3.2 小鼠体内调控基因去甲基化的基因的表达第132-133页
        5.3.3 Epor-GFP-Cre Tet3条件性敲除小鼠的建立第133-135页
        5.3.4 Epor-GFP-Cre Tet3条件性敲除小鼠在正常情况下造血不受影响第135-136页
        5.3.5 Tet3 CKO鼠在应激情况下造血恢复减缓第136-137页
        5.3.6 Tet3 CKO鼠在应激情况下脾脏代偿高于WT鼠第137-138页
        5.3.7 Tet3 CKO鼠在应激情况下出现骨髓红系发育异常第138-139页
    5.4 后续实验计划第139-140页
    5.5 讨论第140-141页
第六章全文总结第141-143页
参考文献第143-149页
附录第149-151页
个人简历、在学期间发表的学术论文与研究成果第151-153页
致谢第153页

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