| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 缩略语表 | 第9-10页 |
| 1 前言 | 第10-20页 |
| 1.1 二甲基硫化物(DMS)形成的分子生态学研究 | 第10-17页 |
| 1.1.1 DMS对气候的调节作用 | 第10页 |
| 1.1.2 微生物驱动DMS的形成 | 第10-11页 |
| 1.1.3 产生DMS的相关微生物 | 第11-13页 |
| 1.1.4 产生DMS的相关功能基因 | 第13-15页 |
| 1.1.5 产生DMS微生物的分子生态学研究进展 | 第15-16页 |
| 1.1.6 我国对海洋DMS释放量的研究进展 | 第16-17页 |
| 1.2 红树林生境特点及其相关微生物 | 第17-19页 |
| 1.2.1 红树林生境简介 | 第17-18页 |
| 1.2.2 红树林微生物多样性研究 | 第18-19页 |
| 1.3 研究目的与意义 | 第19-20页 |
| 2 材料与方法 | 第20-31页 |
| 2.1 材料 | 第20-23页 |
| 2.1.1 样品 | 第20页 |
| 2.1.2 主要仪器设备 | 第20页 |
| 2.1.3 主要试剂 | 第20-22页 |
| 2.1.4 菌株与载体 | 第22页 |
| 2.1.5 PCR引物 | 第22页 |
| 2.1.6 分析软件 | 第22-23页 |
| 2.1.7 培养基 | 第23页 |
| 2.2 基本方法 | 第23-31页 |
| 2.2.1 样品的采集和保存 | 第23-24页 |
| 2.2.2 土壤理化性质测定及其分析 | 第24页 |
| 2.2.3 土壤样品总DNA提取及检测 | 第24-25页 |
| 2.2.4 PCR反应 | 第25-26页 |
| 2.2.5 PCR产物的纯化 | 第26-27页 |
| 2.2.6 连接反应 | 第27页 |
| 2.2.7 感受态细胞E. coli DH5α的制备 | 第27页 |
| 2.2.8 转化 | 第27-28页 |
| 2.2.9 菌落PCR | 第28页 |
| 2.2.10 构建克隆文库 | 第28-29页 |
| 2.2.11 DNA测序及序列提交 | 第29页 |
| 2.2.12 数据分析 | 第29-31页 |
| 3 结果和分析 | 第31-56页 |
| 3.1 红树林土壤样品理化性质 | 第31-35页 |
| 3.2 引物设计及其初步应用 | 第35-44页 |
| 3.2.1 红树林土壤总DNA的抽提 | 第35-36页 |
| 3.2.2 dddP基因特异引物的设计和验证 | 第36-37页 |
| 3.2.3 红树林土壤细菌dddP基因克隆文库的构建 | 第37-38页 |
| 3.2.4 红树林土壤细菌dddP基因多样性分析 | 第38-40页 |
| 3.2.5 红树林土壤细菌dddP基因的系统发育分析 | 第40-41页 |
| 3.2.6 土壤理化性质对DddP细菌多样性和分布的影响 | 第41-44页 |
| 3.3 文昌红树林剖面梯度土壤细菌dddP多样性及时空分布研究 | 第44-52页 |
| 3.3.1 文昌红树林剖面梯度土壤细菌dddP克隆文库构建 | 第44-45页 |
| 3.3.2 剖面梯度土壤细菌dddP克隆文库的基本分析 | 第45-47页 |
| 3.3.3 剖面梯度土壤细菌dddP基因系统发育分析 | 第47-48页 |
| 3.3.4 剖面梯度土壤细菌DddP的时空分布 | 第48-52页 |
| 3.4 文昌红树林海水dddP基因多样性及分布研究 | 第52-56页 |
| 3.4.1 文昌红树林海水dddP基因克隆文库的基本分析 | 第52-53页 |
| 3.4.2 文昌红树林海水细菌DddP系统发育分析 | 第53-54页 |
| 3.4.3 文昌红树林海水DddP在不同季节的分布特征 | 第54-56页 |
| 4. 讨论 | 第56-60页 |
| 4.1 红树林中Ddd~+功能基因的多样性和优势类型 | 第56-57页 |
| 4.2 红树林土壤DddP细菌与海洋环境中的差异 | 第57页 |
| 4.3 土壤理化因素对dddP基因多样性和分布的影响 | 第57-58页 |
| 4.4 季节变化对DddP细菌多样性和分布的影响 | 第58-59页 |
| 4.5 展望 | 第59-60页 |
| 参考文献 | 第60-66页 |
| 致谢 | 第66页 |
