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植物PG基因进化的研究与白菜雄蕊发育相关的两个PG基因的表达分析和功能鉴定

致谢第6-12页
缩略词第12-16页
摘要第16-18页
Abstract第18-19页
前言第20-22页
1 文献综述:植物雄蕊发育与PG基因的研究进展第22-38页
    1.1 雄蕊的发育与调控第22-25页
        1.1.1 雄蕊的结构及发育第22-24页
            1.1.1.1 雄蕊的结构第22-23页
            1.1.1.2 雄蕊的发育过程第23-24页
        1.1.2 雄蕊发育调控的研究第24-25页
            1.1.2.1 雄蕊发育调控研究的策略和相关基因的鉴定第24页
            1.1.2.2 植物激素对雄蕊发育的调控第24-25页
    1.2 植物细胞壁果胶的研究进展第25-30页
        1.2.1 果胶的结构和作用第25-26页
        1.2.2 细胞壁果胶的含量与分布第26-27页
            1.2.2.1 禾本科与双子叶植物细胞壁果胶含量的差异第26-27页
            1.2.2.2 果胶在花粉内壁和花粉管壁的分布第27页
        1.2.3 果胶代谢的研究第27-30页
            1.2.3.1 果胶合成代谢第27-28页
            1.2.3.2 果胶降解代谢第28-30页
    1.3 植物多聚半乳糖醛酸酶的研究进展第30-38页
        1.3.1 PG的序列和结构特征第30-31页
        1.3.2 PG的调控第31-32页
            1.3.2.1 PG的生化活性调控第31页
            1.3.2.2 PG基因的表达调控第31-32页
        1.3.3 PG的生物学功能第32-36页
            1.3.3.1 PG与营养生长第32-35页
            1.3.3.2 PG与花粉发育和授粉受精第35页
            1.3.3.3 PG与果实发育第35-36页
            1.3.3.4 PG与器官的脱落和开裂第36页
            1.3.3.5 PG与胁迫响应第36页
        1.3.4 PG基因家族的进化第36-38页
2 白菜多聚半乳糖醛酸酶基因家族成员的分子进化第38-52页
    2.1 材料与方法第38-40页
        2.1.1 白菜PG基因的系统发生分析与命名第38-39页
        2.1.2 白菜PG基因的特征性鉴定第39页
        2.1.3 基因编码序列的进化分析第39页
        2.1.4 启动子序列的变异分析第39页
        2.1.5 PG家族成员的表达分析第39-40页
            2.1.5.1 植物材料第39-40页
            2.1.5.2 主要试剂第40页
            2.1.5.3 植物总RNA的提取和cDNA合成第40页
        2.1.6 荧光实时定量PCR分析第40页
    2.2 结果第40-47页
        2.2.1 白菜PG家族成员的系统发生分析与命名第40-41页
        2.2.2 白菜PG的序列特征第41-42页
        2.2.3 白菜PG基因编码序列和启动子的进化分析第42-45页
        2.2.4 白菜PG家族成员的表达分析第45-47页
    2.3 讨论第47-52页
        2.3.1 植物PG基因的科学分类和复杂的分子进化第47-49页
        2.3.2 白菜PG基因启动子的变异与编码序列的进化密切相关第49-50页
        2.3.3 白菜不同类别PG基因的表达具有偏向性第50页
        2.3.4 剂量效应促进了白菜重复PG基因的保留第50-52页
3 禾本科与双子叶植物PG基因进化的比较分析第52-80页
    3.1 材料与方法第53-54页
        3.1.1 PG基因的鉴定、系统发生和分布统计分析第53页
        3.1.2 PG基因的重复和丢失估算第53-54页
        3.1.3 PG基因的选择压分析第54页
        3.1.4 PG基因的表达分析第54页
        3.1.5 顺式调控元件分析第54页
    3.2 结果第54-76页
        3.2.1 禾本科和双子叶植物PG基因的鉴定、系统发生和分布第54页
        3.2.2 禾本科和双子叶植物PG基因的重复和丢失模式第54-68页
        3.2.3 禾本科和双子叶植物PG基因的选择压分析第68-70页
        3.2.4 禾本科和双子叶植物PG基因的表达模式分析第70页
        3.2.5 Clade C和Clade F类PG基因的顺式调控元件分析第70-76页
    3.3 讨论第76-80页
        3.3.1 禾本科和双子叶植物间PG基因进化的差异性和相似性与细胞壁果胶的类型有关第76-77页
        3.3.2 保守而多样的PG基因功能及其与禾本科和双子叶植物器官差异的联系第77-78页
        3.3.3 对特定诱因的响应能力促进了PG基因的扩张和保留第78-80页
4 拟南芥雄蕊发育相关PG基因的表达动态及其受植物激素的影响第80-106页
    4.1 材料与方法第81-86页
        4.1.1 拟南芥雄蕊发育相关PG基因的筛选和系统发生分析第81页
        4.1.2 植物材料与主要试剂第81页
        4.1.3 拟南芥基因组DNA的提取第81-82页
        4.1.4 启动子序列的克隆第82-83页
        4.1.5 启动子激素响应相关元件的分析第83页
        4.1.6 启动子-GUS融合表达载体的构建和农杆菌转化第83-84页
            4.1.6.1 入门载体的构建第83页
            4.1.6.2 LR反应连接至目标载体第83-84页
            4.1.6.3 启动子表达载体质粒转化农杆菌GV3101第84页
        4.1.7 启动子表达载体的拟南芥转化第84-85页
        4.1.8 拟南芥阳性转化植株的筛选第85-86页
            4.1.8.1 Basta筛选第85页
            4.1.8.2 抗性株的PCR验证第85-86页
        4.1.9 组织化学染色观察第86页
        4.1.10 激素处理第86页
    4.2 结果第86-101页
        4.2.1 雄蕊发育相关PG基因的筛选和系统发生分析第86-89页
        4.2.2 14个拟南芥雄蕊发育相关PG基因启动子中包含生长素和赤霉素响应的元件第89页
        4.2.3 获得的雄蕊发育相关PG基因的启动子均能启动GUS基因在拟南芥转化株中表达第89-97页
            4.2.3.1 12个PG基因的启动子均能启动GUS基因在雄蕊的花药中表达第89-93页
            4.2.3.2 绝大多数雄蕊PG基因的启动子能启动GUS基因在花药绒毡层和成熟花粉粒中表达第93-96页
            4.2.3.3 雄蕊发育相关PG基因的启动子还能启动GUS基因在花药以外的其他组织部位中表达第96-97页
        4.2.4 外施生长素和GA能够影响拟南芥雄蕊发育相关PG基因在幼苗中的表达第97-101页
    4.3 讨论第101-106页
        4.3.1 雄蕊发育受到了主要来自Clade D成员的不同类别PG基因的作用第101-103页
        4.3.2 PG不仅间接影响花粉发育而且直接影响成熟花粉粒内壁的成层第103-104页
        4.3.3 生长素和GA可通过调控PG的表达而影响雄蕊发育第104页
        4.3.4 至少部分参与雄蕊发育的PG基因也在其他植物生长发育过程起作用第104-106页
5 白菜雄蕊发育相关PG基因BrPG22-1和BrPG22-2的表达分析与功能鉴定第106-127页
    5.1 材料与方法第106-114页
        5.1.1 植物材料与主要试剂第106-107页
        5.1.2 白菜核不育两用系‘Bcajh97-01A/B’的人工授粉第107页
        5.1.3 DNA、总RNA的提取与cDNA的合成第107页
        5.1.4 基因序列、过表达片段及启动子序列的克隆第107-108页
        5.1.5 核苷酸序列分析第108页
        5.1.6 基因的时空表达分析第108页
        5.1.7 BrPG22-1和BrPG22-2启动子融合表达载体的构建和农杆菌转化第108-109页
            5.1.7.1 BrPG22-1-和BrPG22-2启动子表达载体的构建第108-109页
            5.1.7.2 BrPG22-1和BrPG22-2启动子表达载体的瞬时表达第109页
            5.1.7.3 BrPG22-1和BrPG22-2启动子表达载体质粒转化农杆菌GV3101第109页
        5.1.8 BrPG22-1和BrPG22-2启动子表达载体的拟南芥转化和筛选第109页
        5.1.9 BrPG22-1和BrPG22-2的启动子表达载体的拟南芥表达分析第109-110页
        5.1.10 亚细胞定位分析第110页
            5.1.10.1 亚细胞定位载体的构建第110页
            5.1.10.2 洋葱表皮瞬时表达研究第110页
        5.1.11 反义表达载体的构建第110-111页
            5.1.11.1 反义基因片段的分离第110页
            5.1.11.2 反义表达载体的构建第110-111页
            5.1.11.3 pCA35S::BrPG22A质粒直接转化农杆菌GV3101第111页
        5.1.12 反义表达载体对菜心的遗传转化第111-112页
            5.1.12.1 培养基的配制第111-112页
            5.1.12.2 播种培养第112页
            5.1.12.3 预培养第112页
            5.1.12.4 共培养第112页
            5.1.12.5 分化培养第112页
            5.1.12.6 继代培养及生根培养第112页
            5.1.12.7 移栽第112页
        5.1.13 转反义基因植株的分子检测第112-113页
            5.1.13.1 转反义基因植株基因组DNA、总RNA的提取和cDNA的合成第112-113页
            5.1.13.2 转反义基因植株的PCR检测第113页
            5.1.13.3 转反义基因植株的Real-time RT-PCR检测第113页
        5.1.14 转反义基因植株的形态学与细胞学观察第113-114页
            5.1.14.1 植株的形态学观察第113页
            5.1.14.2 花粉生活力观察第113页
            5.1.14.3 花粉形态扫描电镜观察第113页
            5.1.14.4 花粉体外萌发实验第113-114页
            5.1.14.5 花粉在雌蕊中的生长观察第114页
    5.2 结果第114-125页
        5.2.1 BrPG22-1和BrPG22-2的序列和结构特征第114-115页
        5.2.2 BrPG22-1和BrPG22-2具有部分重叠但明显不同的表达模式第115-120页
            5.2.2.1 BrPG22-1和BrPG22-2都在'Bcajh97-01’的不育和可育株系花粉发育早期的花蕾中表达第115-117页
            5.2.2.2 BrPG22-1和BrPG22-2启动子具有部分重叠但明显不同的时空表达模式第117-120页
        5.2.3 BrPG22-1和BrPG22-2编码的蛋白定位于细胞质和细胞壁第120-121页
        5.2.4 反义BrPG22-1/BrPG22-2表达载体成功导入菜心植株第121-123页
        5.2.5 BrPG22-1/BrPG22-2在brpg22花序中的表达受到抑制第123页
        5.2.6 brpg22的花器官形态、花粉发育和花粉管生长正常第123-125页
            5.2.6.1 brpg22的花器官形态正常第123-124页
            5.2.6.2 brpg22的花粉形态和花粉活力正常第124页
            5.2.6.3 brpg22的花粉萌发和花粉管的生长正常第124-125页
    5.3 讨论第125-127页
        5.3.1 BrPG22-1和BrPG22-2是与早期的雄蕊发育相关的PG基因第125页
        5.3.2 BrPG22-1经历了新功能化从而促进其保留第125-126页
        5.3.3 可能存在其他PG家族成员与BrPG22-1和BrPG22-2功能冗余第126-127页
结论第127-129页
参考文献第129-144页
附表第144-148页
在读期间发表的论文第148页

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