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Viperin蛋白抑制猪繁殖与呼吸综合征病毒复制及其分子机制

摘要第11-14页
ABSTRACT第14-16页
第一部分 文献综述第17-61页
    第一章 猪繁殖与呼吸综合征病毒的研究进展第17-51页
        1 病毒的发现和流行第17页
        2 病毒特征第17-19页
            2.1 基本特性第17-18页
            2.2 病毒感染和复制第18-19页
            2.3 病毒传播第19页
        3 病毒非结构蛋白第19-22页
        4 病毒结构蛋白第22-27页
            4.1 核衣壳蛋白(N)第22-23页
            4.2 M蛋白第23页
            4.3 主要的糖基化囊膜蛋白GP5第23-25页
            4.4 糖基化蛋白GP2a第25页
            4.5 E蛋白第25-26页
            4.6 病毒糖基化囊膜蛋白GP3蛋白第26-27页
            4.7 小的糖基化病毒蛋白GP4第27页
        5 获得性免疫第27-28页
            5.1 体液免疫第27-28页
            5.2 细胞免疫第28页
        6 先天性免疫应答第28-35页
            6.1 PRRSV抑制猪体和培养细胞干扰素的产生第28-30页
            6.2 影响干扰素表达的PRRSV蛋白第30-31页
            6.3 不同毒株对干扰素表达的影响第31-32页
            6.4 PRRSV复制干扰了IFN激活的JAK/STAT信号通路第32-33页
            6.5 PRRSV对干扰素刺激基因功能的影响第33-35页
        参考文献第35-51页
    第二章 Viperin蛋白的抗病毒作用第51-61页
        1 Viperin蛋白的基本结构特征和生物学特性第51页
        2 Viperin蛋白的表达调控第51-52页
            2.1 干扰素依赖的Viperin的表达第51-52页
            2.2 干扰素不依赖的Viperin的表达第52页
        3 Viperin在细胞内的定位第52-53页
        4 Viperin蛋白的抗病毒作用第53-55页
        5 Viperin在先天性免疫中的作用第55-56页
            5.1 Viperin对病毒诱导干扰素的表达的影响第55页
            5.2 Viperin对Th1和Th2的分化和成熟具有促进作用第55-56页
        6 结语第56-57页
        参考文献第57-61页
第二部分 实验部分第61-159页
    第三章 Viperin基因的克隆及其在大肠杆菌中的表达与抗体的制备第61-85页
        1 材料与方法第62-72页
            1.1 菌株、细胞与载体第62页
            1.2 试剂第62-63页
            1.3 Viperin基因的克隆第63-67页
                1.3.1 引物设计合成第63页
                1.3.2 IFN-α处理Marc-145、PK细胞第63页
                1.3.3 细胞总RNA的提取第63-64页
                1.3.4 猪、猴cDNA的合成第64页
                1.3.5 猪、猴Viperin基因的纯化并与克隆载体连接第64-65页
                1.3.6 连接产物转化Trans 1-T1感受态细胞第65页
                1.3.7 重组质粒鉴定第65-66页
                1.3.8 重组质粒提取第66页
                1.3.9 测序分析第66-67页
            1.4 猪Viperin基因表达载体的构建及多克隆抗体制备第67-72页
                1.4.1 引物的设计与合成第67页
                1.4.2 PCR扩增第67页
                1.4.3 目的片段与pET-28a+原核表达载体的连接第67-68页
                1.4.4 感受态的制备和转化第68页
                1.4.5 重组质粒的鉴定第68-69页
                1.4.6 猪Viperin蛋白在大肠杆菌中的诱导表达第69-70页
                1.4.7 包涵体的纯化第70页
                1.4.8 Viperin多克隆抗体的制备第70-71页
                1.4.9 Western-blot检测抗体特异性第71页
                1.4.10 IFA检测抗体特异性第71-72页
        2 结果第72-80页
            2.1 PCR扩增结果第72-73页
            2.2 pEASY-MV、SV重组质粒菌液PCR鉴定第73-74页
            2.3 猪和猴Viperin基因的序列测定与同源性分析第74-76页
            2.4 Viperin蛋白表达载体的构建与蛋白表达第76-78页
                2.4.1 猪Viperin氨基酸的抗原性分析第76-77页
                2.4.2 RT-PCR结果第77-78页
                2.4.3 原核表达载体pET-sVIP酶切鉴定第78页
            2.5 猪Viperin蛋白后半段191-362位氨基酸在大肠杆菌的表达第78-79页
            2.6 蛋白的纯化第79页
            2.7 猪Viperin蛋白多克隆抗体制备及抗体的鉴定第79-80页
                2.7.1 间接免疫荧光实验(IFA)第79-80页
                2.7.2 Western-blot第80页
        3 讨论第80-82页
        参考文献第82-85页
    第四章 猴Viperin抑制PRRSV复制及其分子机制第85-123页
        1 材料与方法第87-96页
            1.1 质粒、菌株、病毒、试剂第87页
            1.2 引物设计与合成第87-89页
            1.3 RNA提取与cDNA合成第89页
            1.4 PCR扩增目的片段第89页
            1.5 真核表达载体pVAX-mVIP、5'△8、5'△10、5'△12、5'△17、 5'△33、3'△143的构建与表达第89-91页
                1.5.1 目的片段、载体的酶切与回收第89-90页
                1.5.2 连接真核表达载体pVAX-1第90页
                1.5.3 转化第90-91页
                1.5.4 酶切鉴定第91页
            1.6 转染第91页
            1.7 病毒的增殖与滴度测定第91-92页
            1.8 间接免疫荧光(IFA)[41]第92页
            1.9 mViperin、IRF-1基因SYBR Green I实时PCR监测方法的建立第92-93页
                1.9.1 引物的设计合成第92页
                1.9.2 荧光定量PCR方法的建立第92-93页
            1.10 mViperin干扰片段的设计、合成及其干扰效果第93-94页
                1.10.1 干扰片段的设计合成第93页
                1.10.2 干扰效果的检测第93-94页
            1.11 Western-bolting第94页
                1.11.1 BCA方法测定蛋白浓度第94页
                1.11.2 SDS-PAGE第94页
                1.11.3 转印第94页
                1.11.4 Western-bolt第94页
            1.12 激光共聚焦检测mViperin与GP5、N、Calnexin蛋白的共定位第94-95页
            1.13 免疫共沉淀试验检测mViperin与PRRSV GP5、N蛋白的相互作用第95页
            1.14 Marc-145细胞上过表达mViperin对PRRSV入胞的影响[42]第95-96页
            1.15 Marc-145细胞上过表达mViperin对PRRSV装配与释放的影响[43]第96页
            1.16 Marc-145细胞上过表达mViperin对PRRSV基因组复制、转录和翻译的影响第96页
        2 结果第96-113页
            2.1 目的片段PCR扩增第96-97页
            2.2 表达载体pVAX-mVIP、5'△8、5'△10、5'△12,、5'△17、5'△33、3'△143的鉴定第97页
            2.3 mViperin基因SYBR GreenI实时PCR检测方法的建立第97-100页
                2.3.1 PCR扩增体系的优化第97页
                2.3.2 引物扩增的特异性和敏感性第97-99页
                2.3.3 重复性试验第99-100页
            2.4 IFN-α诱导mViperin基因在Marc-145细胞的上调及其抗病毒作用第100-101页
            2.5 PRRSV诱导IRF-1和mViperin基因在Marc-145细胞的上调第101-103页
            2.6 过表达mViperin以剂量依赖方式抑制PRRSV在Marc-145细胞的复制第103-104页
            2.7 特异性siRNA干扰mViperin破坏了IFN-α对PRRSV的抑制作用第104-105页
            2.8 过表达mViperin抑制PRRSV的入胞第105-106页
            2.9 过表达mViperin对PRRSV的装配与释放无抑制作用第106-107页
            2.10 过表达mViperin对PRRSV基因的复制、转录、翻译的影响第107-108页
            2.11 mViperin与PRRSV GP5和N蛋白在Marc-145细胞存在共定位第108-110页
            2.12 mViperin定位于内质网第110页
            2.13 mViperin与PRRSV N蛋白在Marc-145细胞上存在相互作用,但与GP5蛋白无直接相互作用第110-111页
            2.14 mViperin抑制PRRSV复制作用的活性区段定位第111-112页
            2.15 mViperin及其突变体在Marc-145细胞内的分布第112-113页
        3 讨论第113-116页
        参考文献第116-123页
    第五章 猪Viperin重组腺病毒的构建与鉴定第123-139页
        1 材料与方法第124-130页
            1.1 质粒、菌株、细胞第124页
            1.2 主要试剂第124页
            1.3 引物设计与PCR扩增第124页
            1.4 PCR扩增猪Viperin基因第124-125页
            1.5 PCR产物纯化回收第125页
            1.6 穿梭载体pAdTrack-mVIP的构建第125-127页
                1.6.1 PCR产物的酶切与回收第125页
                1.6.2 穿梭载体酶切与回收第125-126页
                1.6.3 连接与转化第126页
                1.6.4 重组质粒的制备第126页
                1.6.5 酶切鉴定第126页
                1.6.6 序列分析第126-127页
            1.7 重组穿梭载体与腺病毒骨架质粒在大肠杆菌BJ5183中的同源重组第127-128页
                1.7.1 重组质粒pAdTrack-sVIP的线性化第127页
                1.7.2 大肠杆菌BJ5183感受态细胞的制备第127页
                1.7.3 电转化第127页
                1.7.4 重组质粒的提取第127-128页
                1.7.5 重组质粒的酶切鉴定第128页
            1.8 重组腺病毒的获得第128-129页
                1.8.1 重组腺病毒质粒rAD-sVIP的线性化第128-129页
                1.8.2 转染与腺病毒的传代收获第129页
            1.9 表达sViperin蛋白的重组腺病毒的鉴定第129-130页
                1.9.1 RT-PCR鉴定腺病毒第129页
                1.9.2 Western-blot鉴定第129-130页
            1.10 重组腺病毒滴度的测定第130页
        2 结果第130-134页
            2.1 猪Viperin基因PCR扩增结果第130-131页
            2.2 腺病毒穿梭载体pAdTrack-sVIP的构建与鉴定第131页
            2.3 测序与分析第131页
            2.4 腺病毒重组质粒pAd-sVIP的鉴定第131-132页
            2.5 重组腺病毒质粒的转染与病毒收获第132-133页
            2.6 重组腺病毒rAd-sVIP的外源基因表达与鉴定第133-134页
                2.6.1 RT-PCR检测目的片段第133-134页
                2.6.2 Western-blot鉴定腺病毒外源基因的表达第134页
            2.7 重组腺病毒的传代与滴度测定第134页
        3 讨论第134-136页
        参考文献第136-139页
    第六章 猪Viperin蛋白抑制PRRSV复制作用第139-159页
        1 材料与方法第140-145页
            1.1 质粒、菌株、病毒、试剂第140页
            1.2 引物设计与合成第140页
            1.3 PCR扩增和回收第140-141页
            1.4 pCI-sVIP表达载体的构建第141-142页
                1.4.1 目的片段和载体酶切第141-142页
                1.4.2 连接与转化第142页
                1.4.3 质粒提取与鉴定第142页
            1.5 病毒的增殖与滴度测定第142页
            1.6 Western-bolting第142-143页
            1.7 激光共聚焦检测sViperin与PRRSV GP5、N、Calnexin在Marc-145细胞内的共定位第143页
            1.8 免疫共沉淀实验检测sViperin与PRRSV GP5、N在Marc-145细胞内的相互作用第143-144页
            1.9 腺病毒表达sViperin对PRRSV的抑制作用第144页
            1.10 在Marc-145细胞上过表达sViperin对PRRSV入胞的影响第144页
            1.11 Marc-145细胞上过表达sViperin对PRRSV装配与释放的影响第144-145页
        2 结果第145-153页
            2.1 PCR扩增第145页
            2.2 pCI-sVIP重组质粒的酶切鉴定第145-146页
            2.3 过表达sViperin以剂量依赖的方式在Marc-145细胞抑制PRRSV复制第146-147页
            2.4 过表达sViperin在Marc-145细胞抑制了PRRSV的入胞第147页
            2.5 过表达sViperin对病毒的装配与释放无抑制作用第147-149页
            2.6 sViperin与PRRSV GP5和N蛋白在Marc-145细胞存在共定位第149-150页
            2.7 sViperin可定位于内质网第150页
            2.8 过表达sViperin与PRRSV N蛋白在Marc-145细胞上存在相互作用,但与GP5蛋白无相互作用第150-151页
            2.9 腺病毒在PAMSs细胞上过表达sViperin对PRRSV抑制作用第151-153页
        3 讨论第153-155页
        参考文献第155-159页
全文总结第159-161页
致谢第161-163页
已发论文第163页

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