| 摘要 | 第9-11页 |
| Abstract | 第11-12页 |
| 缩略表 (Abbreviation) | 第13-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-32页 |
| 1.1 红斑丹毒丝菌研究进展 | 第15-28页 |
| 1.1.1 病原学 | 第15页 |
| 1.1.2 命名和分类 | 第15-16页 |
| 1.1.3 血清分型 | 第16-17页 |
| 1.1.4 流行病学 | 第17页 |
| 1.1.5 临床症状 | 第17-19页 |
| 1.1.6 红斑丹毒丝菌毒力因子 | 第19-23页 |
| 1.1.7 红斑丹毒丝菌胞内存活机制 | 第23-25页 |
| 1.1.8 红斑丹毒丝菌耐药情况 | 第25-26页 |
| 1.1.9 猪丹毒的治疗和预防 | 第26-28页 |
| 1.2 蛋白质组学技术及应用 | 第28-32页 |
| 1.2.1 蛋白质组学简介 | 第28-29页 |
| 1.2.2 病原微生物蛋白质组学研究 | 第29-32页 |
| 第二章 红斑丹毒丝菌比较蛋白质组学研究 | 第32-56页 |
| 2.1 前言 | 第32页 |
| 2.2 材料与方法 | 第32-43页 |
| 2.2.1 菌株及培养条件 | 第32-33页 |
| 2.2.2 仪器设备 | 第33页 |
| 2.2.3 主要化学试剂 | 第33-34页 |
| 2.2.4 培养基配制 | 第34页 |
| 2.2.5 SDS-PAGE和Western Blotting相关试剂 | 第34-35页 |
| 2.2.6 实验动物 | 第35页 |
| 2.2.7 菌株致病力检测 | 第35-36页 |
| 2.2.8 菌株的多位点序列分型 | 第36页 |
| 2.2.9 细胞壁相关蛋白的制备 | 第36页 |
| 2.2.10 SDS-PAGE电泳 | 第36-37页 |
| 2.2.11 酶解和肽段定量 | 第37-38页 |
| 2.2.12 肽段标记 | 第38页 |
| 2.2.13 质谱分析 | 第38-39页 |
| 2.2.14 数据分析 | 第39页 |
| 2.2.15 定量分析 | 第39-40页 |
| 2.2.16 原核表达差异蛋白并制备多克隆抗体 | 第40-42页 |
| 2.2.17 Western blot验证差异表达蛋白 | 第42-43页 |
| 2.2.18 数据分析 | 第43页 |
| 2.3 结果 | 第43-51页 |
| 2.3.1 菌株致病力检测 | 第43-44页 |
| 2.3.2 菌株MLST分析 | 第44页 |
| 2.3.3 细胞壁蛋白SDS-PAGE电泳 | 第44-45页 |
| 2.3.4 酶解肽段浓度测定 | 第45页 |
| 2.3.5 序列信息提取 | 第45页 |
| 2.3.6 Gene Ontology (GO) 功能注释 | 第45-46页 |
| 2.3.7 iTRAQ鉴定结果 | 第46-47页 |
| 2.3.8 强弱毒菌株中差异表达蛋白 | 第47-48页 |
| 2.3.9 聚类分析 | 第48-50页 |
| 2.3.10 差异蛋白的表达纯化与Western blot验证 | 第50页 |
| 2.3.11 Western blot验证差异表达蛋白 | 第50-51页 |
| 2.4 讨论 | 第51-54页 |
| 2.5 结论 | 第54-56页 |
| 第三章 鉴定红斑丹毒丝菌新型毒力相关因子Sbp | 第56-81页 |
| 3.1 前言 | 第56页 |
| 3.2 材料与方法 | 第56-68页 |
| 3.2.1 菌株、培养条件与质粒 | 第56-57页 |
| 3.2.2 引物设计及合成 | 第57页 |
| 3.2.3 主要试剂与工具酶 | 第57页 |
| 3.2.4 ELISA相关试剂 | 第57-58页 |
| 3.2.5 基因缺失载体的构建 | 第58-63页 |
| 3.2.6 生长曲线的测定 | 第63页 |
| 3.2.7 细菌形态学观察 | 第63-64页 |
| 3.2.8 全血存活试验 | 第64页 |
| 3.2.9 粘附与侵入试验 | 第64-65页 |
| 3.2.10 吞噬细胞介导的杀菌试验 | 第65页 |
| 3.2.11 对仔猪致病力检测 | 第65-66页 |
| 3.2.12 评价Sbp蛋白对仔猪的免疫保护效果 | 第66-68页 |
| 3.3 结果 | 第68-78页 |
| 3.3.1 基因缺失菌株的构建 | 第68-69页 |
| 3.3.2 生长曲线的测定 | 第69-70页 |
| 3.3.3 细菌形态学观察 | 第70-71页 |
| 3.3.4 粘附和侵入试验 | 第71页 |
| 3.3.5 全血杀伤试验 | 第71-72页 |
| 3.3.6 吞噬细胞介导的杀菌实验 | 第72页 |
| 3.3.7 对仔猪致病力检测 | 第72-75页 |
| 3.3.8 评价sbp蛋白对仔猪的免疫保护效果 | 第75-78页 |
| 3.4 讨论 | 第78-80页 |
| 3.5 结论 | 第80-81页 |
| 第四章 临床分离的红斑丹毒丝菌耐药性分析及其耐喹诺酮类药物的分子机制初探 | 第81-95页 |
| 4.1 前言 | 第81页 |
| 4.2 材料与方法 | 第81-85页 |
| 4.2.1 菌株 | 第81页 |
| 4.2.2 主要试剂 | 第81-82页 |
| 4.2.3 主要缓冲液以及培养基的配制 | 第82页 |
| 4.2.4 主要仪器设备 | 第82页 |
| 4.2.5 红斑丹毒丝菌临床分离株的耐药性分析 | 第82-83页 |
| 4.2.6 E-test药敏纸条检测红斑丹毒丝菌环丙沙星和左旋氧氟沙星MIC值 | 第83页 |
| 4.2.7 引物设计与合成 | 第83-84页 |
| 4.2.8 目的基因的PCR扩增 | 第84页 |
| 4.2.9 构建点突变载体 | 第84页 |
| 4.2.10 检测含有定向点突变基因菌株的MIC值 | 第84-85页 |
| 4.3 结果 | 第85-92页 |
| 4.3.1 红斑丹毒丝菌耐药谱分析 | 第85-90页 |
| 4.3.2 红斑丹毒丝菌对环丙沙星和左旋氧氟沙星的耐药性检测与分析 | 第90页 |
| 4.3.3 扩增喹诺酮耐药相关基因并测序分析 | 第90-91页 |
| 4.3.4 GyrA、ParC定向点突变质粒构建 | 第91-92页 |
| 4.3.5 GyrA、ParC定向点突变对细菌耐药性的影响 | 第92页 |
| 4.4 讨论 | 第92-94页 |
| 4.5 结论 | 第94-95页 |
| 第五章 总结 | 第95-97页 |
| 参考文献 | 第97-108页 |
| 附录Ⅰ | 第108-110页 |
| 附录Ⅱ | 第110-114页 |
| 附录Ⅲ | 第114-115页 |
| 致谢 | 第115-116页 |
