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阿特拉津脱氯水解酶(TrzN)的定向进化

摘要第1-10页
ABSTRACT第10-12页
符号与缩略语说明第12-13页
前言第13-14页
第一章 文献综述第14-32页
 1 阿特拉津的结构及理化性质第14页
 2 除草剂阿特拉津的施用现状第14页
 3 阿特拉津对环境的影响第14-15页
 4 急性毒性和遗传毒性第15-16页
 5 阿特拉津的生物降解第16-17页
 6 阿特拉津脱氯水解酶(TrzN)第17-18页
 7 定向进化第18-23页
   ·体外定向进化的一般过程和要求第18-19页
   ·酶定向进化的策略第19页
   ·构建突变体文库的方法第19-21页
   ·定点突变,饱和突变第21页
   ·PCR介导的定点及饱和突变第21-23页
 8 影响大肠杆菌中外源基因表达的因素第23-25页
   ·表达载体的选择第23页
   ·外源基因中密码子的使用第23-24页
   ·mRNA的一级和二级结构的作用第24页
   ·mRNA稳定性的影响第24-25页
   ·宿主的选择第25页
 9 mRNA的序列、结构以及翻译速率与蛋白质结构的关系第25-26页
 参考文献第26-32页
第二章 突变文库的构建及其方法的选择第32-48页
 1 材料与方法第32-34页
   ·菌株与质粒第32页
   ·培养基第32页
   ·抗生素及使用浓度第32页
   ·试剂和酶第32-33页
   ·分子生物学操作第33-34页
 2 突变文库构建三种方法的比较分析第34-40页
   ·方法一 T7启动子带动trzN的表达,转化E.coli BL21(DE3)第34-36页
   ·方法二 LacZ启动子带动trzN的表达,转化E.coli DH5α第36-39页
   ·方法三 利用pRBB表达载体构建突变文库,转化E.coli DH10B第39-40页
   ·pRBB-trzN(wild)(DH10B)的构建第40页
 3 结果与分析第40-44页
   ·易错PCR条件的摸索第40-41页
   ·自配易错PCR buffer与常规PCR buffer扩增比较第41页
   ·LacZ promoter+trzN的扩增第41-42页
   ·pRBB-trzN(Mus)载体的构建第42-43页
   ·pRBB-trzN(wild)(DH10B)的构建第43-44页
 4 实验中文库构建三种方法的比较第44-45页
 5 本章小节第45-46页
 参考文献第46-48页
第三章 突变文库的筛选及相关突变位点的研究第48-70页
 第一节 突变文库的筛选第48-50页
  1 材料与方法第48页
   ·菌株与质粒第48页
   ·抗生素及使用浓度第48页
   ·试剂和酶第48页
   ·突变文库的筛选第48页
  2 结果与分析第48-49页
   ·几株突变株碱基及氨基酸变化第49页
   ·几株突变株碱基及氨基酸变化第49页
  3 本节小结第49-50页
 第二节 突变体基因的重组表达及相关突变位点的研究第50-69页
  1. 材料与方法第50-58页
   ·菌株与质粒第50页
   ·培养基第50页
   ·抗生素及使用浓度第50页
   ·试剂和酶第50-51页
   ·突变体基因(MuA-32、MuB-12、MuD-46、MuF-212)的重组表达第51-52页
   ·对MuF-212进行回复突变第52-55页
   ·MuA-55、MuE-118的回复、定点及饱和突变第55-56页
   ·SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)分析第56-57页
   ·突变体的比酶活力测定分析第57-58页
  2. 结果与分析第58-67页
   ·突变体(MuA-32、MuB-12、MuD-46、MuF-212)的表达载体的构建第58-59页
   ·MuF-212第377位和第1160位碱基的回复突变第59-61页
   ·MuA-55第568位点的回复及trzN(wild)定点突变第61-63页
   ·MuE-118第568位点的回复突变第63页
   ·蛋白的诱导表达第63-64页
   ·突变体比酶活力的测定第64-66页
   ·MuA-55第568位点的饱和突变第66-67页
  3 本章总结第67-69页
 参考文献第69-70页
第四章 MuA-55、MuE-118、TrzN(wild)酶学性质的初步研究第70-76页
 1 材料与方法第70-71页
   ·菌株和质粒第70页
   ·培养条件第70页
   ·温度和pH值对MuA-55、MuE-118、TrzN(wild)活性及稳定性的影响第70-71页
   ·金属离子对MuA-55活性的影响第71页
 2 结果与分析第71-74页
   ·pH值对MuA-55、MuE-118、TrzN(wild)活性的影响第71页
   ·温度对MuA-55、MuE-118、TrzN(wild)活性的影响第71-72页
   ·MuA-55、MuE-118、TrzN(wild)的pH稳定性测定第72页
   ·MuA-55、MuE-118、TrzN(wild)的热稳定性测定第72-73页
   ·金属离子对MuA-55活性的影响第73-74页
 3 本章总结第74-76页
全文总结与展望第76-78页
主要创新点第78-80页
附录一 文中多用培养基、试剂及相关缓冲液配方第80-83页
 一 培养基第80页
 二 试剂第80-83页
附录二 文中三种文库构建方法的载体构建图第83-86页
致谢第86页

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