| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第1章 绪论 | 第9-17页 |
| 1.1 对古鲸目化石及形态学揭示鲸类食性转变过程 | 第9-10页 |
| 1.2 现生鲸类食物组成分析 | 第10页 |
| 1.3 其他食性转变动物中相关消化酶的研究进展 | 第10-12页 |
| 1.4 消化酶相关基因及RNase1基因家族简介 | 第12-15页 |
| 1.4.1 PNLIP、LIPC和LIPF基因的结构和功能 | 第12-14页 |
| 1.4.2 CTRC和PGC基因的结构和功能 | 第14页 |
| 1.4.3 AMY2A和MGAM基因的结构和功能 | 第14-15页 |
| 1.4.4 RNase 1基因家族 | 第15页 |
| 1.5 研究的目的和意义 | 第15-17页 |
| 第2章 研究材料和方法 | 第17-25页 |
| 2.1 样品采集 | 第17页 |
| 2.2 主要实验方法及操作步骤 | 第17-19页 |
| 2.2.1 基因组DNA的提取、和测序 | 第17-18页 |
| 2.2.2 PCR扩增及测序 | 第18页 |
| 2.2.3 分子克隆 | 第18-19页 |
| 2.3 数据分析 | 第19-20页 |
| 2.4 选择压力分析 | 第20-22页 |
| 2.5 鲸类正选择位点和特异位点在蛋白质三维结构上的分布 | 第22页 |
| 2.6 食肉动物平行氨基酸位点的确定 | 第22-23页 |
| 2.7 核糖核酸酶基因家族的注释及分析研究 | 第23-25页 |
| 2.7.1 RNase1基因的确定 | 第23页 |
| 2.7.2 序列比对和命名 | 第23-24页 |
| 2.7.3 构树分析RNase1的进化历史 | 第24-25页 |
| 第3章 结果 | 第25-46页 |
| 3.1 鲸类消化酶基因序列特征 | 第25页 |
| 3.2 鲸类消化酶基因的正选择作用 | 第25-37页 |
| 3.2.1 位点模型的检测结果 | 第25-35页 |
| 3.2.2 枝位点模型的检测结果 | 第35-37页 |
| 3.2.3 Clade模型的检测结果 | 第37页 |
| 3.3 正选择位点及鲸类特异位点在蛋白质三维结构上的分布 | 第37-41页 |
| 3.4 食肉动物平行和趋同氨基酸位点的检测结果 | 第41页 |
| 3.5 RNase 1基因家族研究结果 | 第41-46页 |
| 3.5.1 基因组扫描 | 第41-43页 |
| 3.5.2 RNase1基因家族的特点 | 第43-46页 |
| 第4章 讨论 | 第46-49页 |
| 4.1 脂肪酶和蛋白酶的正选择作用与鲸类食性转变相关 | 第46页 |
| 4.2 淀粉酶MGAM受到的正选择作用可能与调节血糖功能有关 | 第46-47页 |
| 4.3 代表性消化酶在齿鲸和须鲸中受到不同选择压力与二者捕食物种不同有关 | 第47页 |
| 4.4 鲸类与食肉目动物之间的平行位点与其食性有关 | 第47页 |
| 4.5 鲸类RNase 1家族的收缩与食性转变相关 | 第47-49页 |
| 第5章 总结 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-57页 |
| 在读期间发表的学术论文及研究成果 | 第57-58页 |
| 附录A | 第58-80页 |
| 致谢 | 第80页 |
