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菜青虫中肠响应CoTI的转录组学分析

摘要第6-8页
Abstract第8页
第1章 绪论第13-18页
    1.1 菜青虫第13-15页
        1.1.1 为害特点第13-14页
        1.1.2 为害发生特点第14页
        1.1.3 防治方法第14-15页
    1.2 胰蛋白酶抑制剂第15-16页
    1.3 转录组测序第16-17页
    1.4 本文研究目的和意义第17-18页
第2章 决明胰蛋白酶抑制剂基因的克隆、表达及纯化第18-27页
    2.1 实验材料第19页
        2.1.1 材料第19页
        2.1.2 试剂第19页
        2.1.3 仪器第19页
        2.1.4 培养基第19页
    2.2 实验方法第19-21页
        2.2.1 引物设计与合成第19-20页
        2.2.2 决明种子总RNA的提取第20页
        2.2.3 决明CoTI基因cDNA的合成第20页
        2.2.4 RT-PCR体外扩增目的片段第20页
        2.2.5 PCR产物的克隆与测序第20页
        2.2.6 CoTI原核表达载体的制备第20-21页
        2.2.7 蛋白纯化第21页
        2.2.8 蛋白浓度的测定第21页
    2.3 结果与讨论第21-26页
        2.3.1 决明总RNA的鉴定第21页
        2.3.2 CoTI基因的克隆第21-24页
        2.3.3 重组质粒的构建与鉴定第24-25页
        2.3.4 蛋白纯化第25页
        2.3.5 CoTI蛋白浓度的测定第25-26页
    2.4 本章小结第26-27页
第3章 菜青虫中肠转录组学分析第27-62页
    3.1 材料与方法第27-30页
        3.1.1 材料第27页
        3.1.2 菜青虫中肠RNA的提取第27-28页
        3.1.3 转录组测序第28页
        3.1.4 测序数据及其质量控制第28-29页
        3.1.5 转录组序列组装第29页
        3.1.6 转录组测序文库质量评估第29-30页
        3.1.7 Unigene功能注释第30页
        3.1.8 Uinigene基因结构分析第30页
    3.2 结果与讨论第30-61页
        3.2.1 菜青虫中肠RNA的提取第30-31页
        3.2.2 测序数据产出统计与质量控制第31页
        3.2.3 转录组测序数据组装结果第31-32页
        3.2.4 Unigene功能注释第32-33页
        3.2.5 Nr注释第33-38页
        3.2.6 Unigene GO功能分类第38-39页
        3.2.7 COG和KOG功能分类第39-41页
        3.2.8 KEGG代谢通路分析第41页
        3.2.9 解毒酶的抑制第41-61页
        3.2.10 SSR第61页
    3.3 本章小结第61-62页
第4章 菜青虫中肠差异表达基因分析第62-73页
    4.1 材料与方法第62-63页
        4.1.1 转录组数据第62页
        4.1.2 Unigene表达量分析第62-63页
        4.1.3 差异表达基因筛选第63页
        4.1.4 差异表达基因分析第63页
    4.2 结果与讨论第63-72页
        4.2.1 菜青虫高表达的差异表达基因分析第63-64页
        4.2.2 差异表达基因(DEG)筛选第64-65页
        4.2.3 差异表达基因功能注释第65-72页
    4.3 本章小结第72-73页
第5章 菜青虫qPCR内参基因的选择第73-82页
    5.1 材料与方法第73-75页
        5.1.1 菜青虫各组织RNA的提取和cDNA的制备第73-74页
        5.1.2 内参引物的设计第74页
        5.1.3 qRT-PCR扩增第74-75页
        5.1.4 菜青虫候选内参基因稳定性分析第75页
    5.2 结果与分析第75-81页
        5.2.1 RNA的提取与cDNA的合成第75-76页
        5.2.2 候选内参基因的选择和引物设计第76-77页
        5.2.3 菜青虫候选内参基因引物特异性分析第77页
        5.2.4 菜青虫候选内参基因的表达谱第77-78页
        5.2.5 菜青虫内参基因筛选第78-81页
    5.3 本章小结第81-82页
结论第82-83页
致谢第83-84页
参考文献第84-88页
攻读硕士学位期间发表的论文及科研成果第88页

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