| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-19页 |
| 1. 基因家族的进化 | 第11-13页 |
| 1.1 基因家族概述 | 第11页 |
| 1.2 基因家族在染色体的分布类型 | 第11-12页 |
| 1.3 基因家族形成的分子机制 | 第12-13页 |
| 2. DUF1313基因家族和C2H2锌指转录因子家族的研究进展 | 第13-16页 |
| 2.1. DUF1313基因家族的概况与研究进展 | 第14页 |
| 2.2. C2H2锌指转录因子家族的概况与研究进展 | 第14-16页 |
| 3. 关联分析在基因家族研究中的应用 | 第16-18页 |
| 3.1 关联分析的概述 | 第16-17页 |
| 3.2 利用关联分析发掘基因家族中的重要目标基因 | 第17-18页 |
| 4. 本研究的目的意义 | 第18-19页 |
| 第二章 DUF1313基因家族在植物中的进化及与玉米成株期农艺性状的关联 | 第19-68页 |
| 1 材料与方法 | 第20-26页 |
| 1.1 实验材料及表型鉴定 | 第20页 |
| 1.2 DUF1313基因家族在植物中的鉴定与系统发育分析 | 第20-21页 |
| 1.3 DUF1313基因在禾本科植物中的选择压和oN：dS比率估计 | 第21-22页 |
| 1.4 玉米DUF1313基因家族基因与玉米成株期农艺性状的关联 | 第22-23页 |
| 1.5 在25个RIL群体中验证玉米DUF1313家族基因的优异等位变异 | 第23页 |
| 1.6 ELF4-like4基因在玉米及其近缘物种中的克隆 | 第23-25页 |
| 1.7 ELF4-like4基因在玉米及其近缘物种中的多态性、LD及系统发育分析 | 第25-26页 |
| 2 结果与分析 | 第26-66页 |
| 2.1 植物DUF1313基因系统发育分析 | 第26-42页 |
| 2.2 禾本科植物DUF1313基因的选择压分析 | 第42-46页 |
| 2.3 玉米DUF1313家族基因与玉米农艺性状的关联分析 | 第46-47页 |
| 2.4 在RIL群体中发掘玉米DUF1313家族基因与农艺性状关联的有利等位变异 | 第47-61页 |
| 2.5 ELF4-like4基因在玉米及其近缘种中的多态性、中性检验和LD分析 | 第61-63页 |
| 2.6 ELF4-like4基因在玉米及其近缘物种中的系统发育 | 第63-66页 |
| 3 讨论 | 第66-68页 |
| 第三章 玉米C2H2转录因子家族的系统发育及其与玉米成株期农艺性状的关联 | 第68-121页 |
| 1 材料与方法 | 第69-72页 |
| 1.1 实验材料及表型鉴定 | 第69页 |
| 1.2 玉米C2H2锌指基因及保守结构域的鉴定 | 第69页 |
| 1.3 玉米C2H2锌指基因的复制以及在染色体的分布 | 第69-70页 |
| 1.4 玉米C2H2锌指基因及锌指结构域的系统发育分析 | 第70页 |
| 1.5 玉米C2H2锌指基因结构分析 | 第70-71页 |
| 1.6 玉米C2H2锌指基因的表达分析 | 第71页 |
| 1.7 玉米C2H2锌指基因与玉米农艺性状关联分析 | 第71页 |
| 1.8 ZMF155(WREBP-2)基因克隆与有利等位变异发掘 | 第71-72页 |
| 2 结果与分析 | 第72-118页 |
| 2.1 玉米C2H2锌指基因及其保守结构域的鉴定 | 第72-87页 |
| 2.2 玉米C2H2锌指基因分布和基因复制 | 第87-99页 |
| 2.3 玉米C2H2锌指基因的系统发育、基因结构和保守结构域分析. | 第99-102页 |
| 2.4 玉米C2H2锌指结构域类型及其系统发育关系 | 第102-106页 |
| 2.5 C2H2锌指基因在玉米不同生长发育阶段各组织中的表达模式 | 第106-114页 |
| 2.6 玉米C2H2锌指基因与玉米农艺性状的关联分析 | 第114-115页 |
| 2.7 ZMF155(WREBP-2)基因有利等位变异的发掘 | 第115-118页 |
| 3 讨论 | 第118-121页 |
| 参考文献 | 第121-129页 |
| 附录 | 第129-178页 |
| 附图 | 第178-180页 |
| 作者简历 | 第180-181页 |
| 致谢 | 第181页 |
