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秀丽线虫中小RNA介导产生的H3K27me3染色体修饰依赖于Nrde通路

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-9页
第一章 绪论第9-31页
   ·引言第9-11页
   ·秀丽隐杆线虫概述第11-12页
   ·RNA干扰通路第12-22页
     ·RNA干扰概述第12-15页
     ·线虫中的细胞核内RNA干扰通路第15-18页
     ·RNA干扰的遗传第18-20页
     ·piRNA介导的表观修饰遗传第20-22页
   ·组蛋白H3赖氨酸K27的甲基化修饰第22-24页
   ·RNA干扰与组蛋白修饰第24-27页
     ·RNA干扰与组蛋白修饰概况第24-26页
     ·RNA干扰与H3K27me3第26-27页
   ·RNA干扰与组蛋白修饰遗传的相互影响第27-31页
第二章 实验材料与方法第31-57页
   ·实验材料第31-38页
     ·实验所需线虫品系第31页
     ·实验仪器第31-33页
     ·实验常规试剂第33-38页
   ·实验方法第38-57页
     ·线虫生长固体培养基第38页
     ·线虫RNAi固体培养基第38-39页
     ·线虫液体培养第39-40页
     ·线虫基因组DNA提取第40页
     ·线虫冻存和复苏第40-41页
     ·线虫同步化处理第41页
     ·线虫RNA干扰处理第41-43页
     ·线虫显微注射筛选整合品系第43-44页
     ·线虫总RNA提取及反转录合成cDNA第44-46页
     ·质粒构建第46-49页
     ·染色质免疫共沉淀(ChIP)第49-51页
     ·RNA免疫共沉淀(RIP)第51-53页
     ·蛋白质体外结合实验(Pull Down)第53-54页
     ·蛋白质印迹实验(Western Blot)第54-57页
第三章 结果与讨论第57-82页
   ·外源性RNA干扰指导序列特异性的H3K27三甲基化修饰第57-62页
     ·遗传筛选发现细胞核内RNA干扰必须因子mes-2第57-59页
     ·小RNA分子可以指导序列特异性的H3K27me3第59-60页
     ·细胞核内RNA干扰通路对于H3K27的三甲基化是必须的第60-61页
     ·双链RNA可以诱导亚基因水平的染色质修饰第61-62页
   ·Nrde结合的内源性小RNA分子可以指导序列特异性的H3K27三甲基化修饰第62-68页
     ·利用ChIP-seq进一步确定基因组范围内Nrde结合的内源性22G siRNA与H3K27me3表达之间的关系第64-65页
     ·piRNA和WAGO-1结合的22G内源性siRNA可以诱导H3K27的三甲基化修饰第65-67页
     ·CSR-1内源性靶标位置可以产生外源性RNAi介导产生的依赖于Nrde通路的H3K27三甲基化修饰第67-68页
   ·RNA干扰诱导产生的H3K27me3可以多代遗传第68-69页
   ·小RNA诱导的H3K9me3和H3K27me3需要不同的遗传因子第69-71页
     ·set-25和met-2对于H3K9me3表达是必须的,mes-2对于H3K27me3表达是必须的第69-70页
     ·mes-4和mes-6对于H3K27me3表达也有影响第70-71页
   ·H3K27的三甲基化修饰对于细胞核内RNA干扰是必须的第71-73页
   ·MES-2被Nrde通路募集到靶标位置完成染色质修饰的具体分子机制还不清楚第73-77页
   ·结果分析与讨论第77-82页
参考文献第82-88页
附录实时荧光定量PCR引物第88-97页
致谢第97-98页
在读期间发表的学术论文第98页

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