| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-13页 |
| 第一章 研究背景介绍 | 第13-51页 |
| ·布氏锥虫简介 | 第13-15页 |
| ·布氏锥虫基因组 | 第15-17页 |
| ·布氏锥虫核基因组 | 第15-17页 |
| ·布氏锥虫线粒体基因组 | 第17页 |
| ·布氏锥虫转录 | 第17-18页 |
| ·布氏锥虫RNA聚合酶 | 第18-22页 |
| ·RNA聚合酶Ⅰ | 第19-21页 |
| ·RNA聚合酶Ⅱ | 第21页 |
| ·RNA聚合酶Ⅲ | 第21-22页 |
| ·布氏锥虫启动子区域 | 第22-26页 |
| ·RNA聚合酶Ⅰ的转录起始 | 第22-24页 |
| ·RNA聚合酶Ⅱ的转录起始 | 第24-25页 |
| ·RNA聚合酶Ⅲ的转录起始 | 第25-26页 |
| ·布氏锥虫其他转录因子 | 第26-38页 |
| ·TFIIH | 第26-27页 |
| ·TFIID | 第27页 |
| ·SNAPc | 第27-28页 |
| ·TFIIA和TFIIB | 第28页 |
| ·TFIIS | 第28-31页 |
| ·PAF1复合体 | 第31-38页 |
| ·布氏锥虫组蛋白修饰及其在转录过程中的作用 | 第38-44页 |
| ·布氏锥虫组蛋白修饰相关蛋白 | 第38-41页 |
| ·布氏锥虫组蛋白修饰 | 第41-43页 |
| ·布氏锥虫PWWP结构域 | 第43-44页 |
| ·布氏锥虫VSG的表达及调控 | 第44-51页 |
| 第二章 实验材料与方法 | 第51-73页 |
| ·布氏锥虫TFIIS PWWP结构域蛋白的克隆、表达和纯化 | 第51-54页 |
| ·布氏锥虫TFIIS PWWP及TFIIS2-2 LW结构域蛋白的克隆 | 第51页 |
| ·布氏锥虫TFIIS2-2 PWWP结构域蛋白点突变表达质粒的构建 | 第51-52页 |
| ·布氏锥虫TFIIS PWWP结构域蛋白的表达及纯化 | 第52-54页 |
| ·布氏锥虫TFIIS PWWP结构域的核磁谱图采集及结构计算 | 第54页 |
| ·小肽和DNA的合成与纯化 | 第54-55页 |
| ·NMR化学位移微扰实验 | 第55-56页 |
| ·等温滴定微量热(ITC) | 第56-57页 |
| ·荧光偏振(FP) | 第57-58页 |
| ·布氏锥虫细胞培养及相关细胞系构建 | 第58-62页 |
| ·干扰细胞系构建、RNA干扰及细胞计数 | 第59-61页 |
| ·过表达细胞系构建 | 第61-62页 |
| ·原位表达细胞系构建 | 第62页 |
| ·GST pull down | 第62-63页 |
| ·免疫印迹 | 第63-64页 |
| ·酵母双杂交 | 第64-66页 |
| ·酵母双杂交相关载体构建 | 第64-65页 |
| ·酵母转化 | 第65-66页 |
| ·串联亲和纯化 | 第66-67页 |
| ·实时荧光定量PCR | 第67-70页 |
| ·RNA抽提 | 第67-68页 |
| ·反转录反应 | 第68页 |
| ·实时荧光定量PCR反应 | 第68-70页 |
| ·转录组测序 | 第70-73页 |
| 第三章 实验结果与讨论 | 第73-115页 |
| ·布氏锥虫转录延伸因子TFIIS PWWP结构域结构与分子作用机制 | 第73-95页 |
| ·TFIIS2-1 PWWP、TFIIS2-2 PWWP和TFIIS2-2 LW结构域的氨基酸归属 | 第73-76页 |
| ·TFIIS2-1 PWWP结构域的溶液结构及其与其他PWWP结构域结构的比较 | 第76-80页 |
| ·TFIIS2-2 PWWP结构域的溶液结构及其与其他PWWP结构域结构的比较 | 第80-83页 |
| ·TFIIS2-1 PWWP和TFIIS2-2 PWWP结构域与DNA的结合 | 第83-85页 |
| ·TFIIS2-1 PWWP和TFIIS2-2 PWWP结构域与甲基化组蛋白的结合 | 第85-89页 |
| ·TFIIS2-2 PWWP结构域特异性结合H4K17me3和H3K32me3 | 第89-94页 |
| ·TFIIS2-2 PWWP结构域结合RNA结合蛋白NRBD1 | 第94-95页 |
| ·TFIIS2-1和TFIIS2-2对细胞的生长是必须的 | 第95-96页 |
| ·TFIIS2-1和TFIIS2-2通过LW结构域结合PAFl复合体中的LE01亚基 | 第96-98页 |
| ·布氏锥虫中存在完整的PAF1复合体 | 第98-102页 |
| ·布氏锥虫PAF1复合体各个亚基的相互作用网络 | 第102-106页 |
| ·布氏锥虫PAF1复合体对细胞生长是必须的 | 第106-107页 |
| ·布氏锥虫PAF1复合体参与VSG ES沉默的调控 | 第107-111页 |
| ·布氏锥虫PAF1复合体通过ISWI调控VSG ES沉默 | 第111-113页 |
| ·总结 | 第113-115页 |
| 参考文献 | 第115-137页 |
| 附录 | 第137-193页 |
| 致谢 | 第193-195页 |
| 在读期间发表的学术论文与取得的其他研究成果 | 第195页 |
