| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-10页 |
| 第1章 绪论 | 第10-16页 |
| ·引言 | 第10-11页 |
| ·蛋白质机械性能研究的历史和现状 | 第11-14页 |
| ·研究内容和章节安排 | 第14-16页 |
| 第2章 分子动力学模拟的基本理论 | 第16-26页 |
| ·分子动力学模拟的发展及基本思想 | 第16-19页 |
| ·MD模拟软件介绍 | 第19-21页 |
| ·几种常见MD模拟软件介绍 | 第19-20页 |
| ·NAMD以及VMD的发展和介绍 | 第20-21页 |
| ·拉伸分子动力学模拟 | 第21-25页 |
| ·拉伸分子动力学模拟原理 | 第21-23页 |
| ·恒速SMD模拟及参数设置 | 第23-24页 |
| ·恒力SMD模拟及参数设置 | 第24-25页 |
| ·本章小结 | 第25-26页 |
| 第3章 蛋白质空间结构特征及GB1模拟体系的搭建 | 第26-40页 |
| ·蛋白质空间结构特征 | 第26-32页 |
| ·蛋白质结构简介 | 第26-29页 |
| ·蛋白质结构内部相互作用特征 | 第29-32页 |
| ·GB1/GB1-hFc体系搭建 | 第32-34页 |
| ·GB1单体体系搭建 | 第32-34页 |
| ·GB1-hFc体系搭建 | 第34页 |
| ·准平衡模拟 | 第34-38页 |
| ·准平衡模拟的意义及模拟参数设置 | 第35页 |
| ·GB1/GB1-hFc的准平衡模拟及结论分析 | 第35-38页 |
| ·本章小结 | 第38-40页 |
| 第4章 采用拉伸分子动力学模拟方法研究配体结合对GB1力学性能的影响 | 第40-52页 |
| ·拉伸分子动力学(SMD)模拟结果 | 第40-43页 |
| ·恒速拉伸模拟结果 | 第40-42页 |
| ·恒力拉伸模拟结果 | 第42-43页 |
| ·GB1蛋白的抗力部位分析 | 第43-47页 |
| ·恒速拉伸模拟轨迹分析 | 第43-44页 |
| ·β 片之间氢键分析 | 第44-47页 |
| ·配体hFc结合对GB1蛋白机械稳定性调控机制分析 | 第47-50页 |
| ·GB1/GB1-hFc结构对比 | 第47-48页 |
| ·配体结合位点与抗力部位的动力学耦合分析 | 第48-50页 |
| ·配体结合对GB1机械稳定性的调控机制 | 第50页 |
| ·本章小结 | 第50-52页 |
| 结论 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-58页 |
| 攻读硕士学位期间承担的科研任务与主要成果 | 第58-59页 |
| 致谢 | 第59页 |