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水稻组蛋白去甲基化酶基因JMJ705的功能研究

中文摘要第1-9页
Abstract第9-11页
缩略词表第11-12页
1 前言第12-34页
   ·表观遗传学概述第12-13页
   ·表观遗传调控的分子机制第13-26页
     ·真核生物染色质的结构第13-14页
     ·DNA甲基化第14-16页
     ·组蛋白修饰第16-18页
     ·组蛋白甲基化第18-23页
     ·非编码RNA第23-25页
     ·表观基因组的重编程第25-26页
   ·组蛋白去甲基化酶第26-30页
     ·LSD1类组蛋白去甲基化酶第26页
     ·JmjC类去甲基化酶第26-30页
   ·表观调控在植物逆境响应中的作用第30-33页
     ·非生物胁迫中的表观调控第30-31页
     ·生物胁迫中的表观调控第31-33页
   ·本研究的目的与意义第33-34页
2 实验材料和方法第34-46页
   ·实验材料第34-36页
     ·本研究涉及的基因第34页
     ·本研究所用植物材料第34页
     ·载体和菌株第34-35页
     ·抗体第35页
     ·实验试剂第35-36页
   ·实验方法第36-46页
     ·JMJ705基因序列的分析第36页
     ·载体构建第36-37页
     ·农杆菌介导的遗传转化第37页
     ·转基因材料的基因型鉴定以及拷贝数检测第37-38页
     ·转基因材料中目的基因RNA水平检测第38页
     ·转基因材料中目标基因蛋白水平检测第38-39页
     ·转基因材料中组蛋白修饰检测第39页
     ·染色质免疫共沉淀第39-40页
     ·细胞核荧光免疫染色(Immuno-staining)第40-41页
     ·组蛋白去甲基化体外酶活分析第41页
     ·水稻全基因组芯片分析第41-42页
     ·白叶枯病菌接种、病情和细菌生长分析第42页
     ·水稻茉莉酸甲酯诱导实验第42-43页
     ·水稻原生质体瞬时表达第43页
     ·本研究所用到的引物第43-46页
3 结果与分析第46-80页
   ·JMJ705是一个H3K27去甲基化酶第46-52页
     ·JMJ705的表达模式第46-48页
     ·JMJ705的亚细胞定位第48-49页
     ·与JMJ705同源的基因结构及序列分析第49-50页
     ·JMJ705的去甲基酶活性分析第50-52页
   ·JMJ705介导水稻抗性相关基因的表达和对白叶枯病的抗性第52-63页
     ·超量表达JMJ705的水稻植株呈现类病斑的表型第52-53页
     ·超量表达JMJ705降低水稻中H3K27me2/3修饰水平第53-54页
     ·超量表达JMJ705提高水稻体内抗性相关基因的本底表达第54-55页
     ·超表达JMJ705提高水稻对白叶枯病抗性第55-57页
     ·JMJ705 RNAi材料的构建第57-58页
     ·JMJ705突变体材料的鉴定第58-62页
     ·突变JMJ705增加水稻对白叶枯病菌PXO99的易感性第62-63页
   ·JMJ705优先激活具有H3K27me3修饰的逆境响应基因第63-76页
     ·转基因材料表达谱芯片数据分析第63-70页
     ·转基因材料芯片差异表达基因的组蛋白修饰富集分析第70-71页
     ·超表达差异基因ChIP-seq读长强度(read intensity)分析第71-72页
     ·芯片中超表达上升基因表达验证以及组蛋白修饰分析第72-76页
   ·JMJ705参与JA介导的基因诱导表达过程第76-80页
     ·增加JMJ705的表达量可以提高受JA诱导基因的表达水平第76-78页
     ·JMJ705参与JA诱导响应基因组蛋白H3K27me3修饰的去除第78-80页
4 讨论第80-84页
   ·JMJ705是一个受逆境响应的H3K27me2/3去甲基化酶第80页
   ·JMJ705参与逆境应答基因的激活过程第80-81页
   ·JMJ705参与水稻的生长发育调控第81-82页
   ·植物抗病过程中的组蛋白甲基化第82-84页
参考文献第84-104页
附录第104-117页
作者简介第117页
已发表的论文第117页
已申请的专利第117页
会议摘要第117-118页
致谢第118页

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