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草鱼呼肠孤病毒的RT-PCR及RT-LAMP检测方法建立

摘要第1-6页
Abstract第6-11页
1 引言第11-27页
   ·GCRV研究现状第11-18页
     ·GCRV的形态结构第11-12页
     ·GCRV的理化特性第12页
     ·基因及编码蛋白第12-14页
     ·GCRV的致病机制第14-15页
     ·GCRV对宿主细胞生理功能的影响第15页
     ·GCRV病毒检测第15-16页
     ·抗病毒措施第16-18页
   ·LAMP扩增技术第18-25页
     ·LAMP技术原理第18-20页
     ·LAMP技术特点第20-21页
     ·LAMP产物的检测第21页
     ·LAMP技术在水生动物病害中的应用第21-25页
   ·研究目的及意义第25页
   ·研究内容及技术路线第25-27页
     ·研究内容第25-26页
     ·技术路线第26-27页
2 实验材料第27-29页
   ·病料及毒株第27页
   ·实验所需主要试剂第27页
   ·试验所需主要溶液及其配制第27-29页
     ·RNA提取所用溶液第27-28页
     ·琼脂糖凝胶电泳所用溶液第28页
     ·大肠杆菌感受态细胞的制备及转化所用试剂第28-29页
   ·主要仪器第29页
3 方法第29-40页
   ·RT-PCR检测方法建立第29-36页
     ·引物设计第29-30页
     ·病料处理第30页
     ·总RNA的提取第30页
     ·反转录合成cDNA第30-31页
     ·PCR扩增第31页
     ·PCR产物的凝胶回收纯化第31-32页
     ·PCR产物的克隆与序列测定第32-35页
     ·RT-PCR反应条件优化第35-36页
     ·特异性检测第36页
     ·敏感性检测第36页
   ·RT-LAMP快速检测方法的建立第36-39页
     ·引物设计方法第36-37页
     ·RT-LAMP扩增反应第37-38页
     ·RT-LAMP扩增产物的纯化及酶切鉴定第38页
     ·RT-LAMP扩增反应体系及条件的优化第38-39页
     ·RT-LAMP扩增方法敏感性的检测第39页
     ·RT-LAMP扩增方法特异性检测第39页
   ·实验样品检验第39-40页
4 结果第40-52页
   ·RT-PCR产物的克隆与序列测定第40页
   ·RT-PCR扩增反应体系和条件优化结果第40-44页
     ·RT-PCR反应体系中Tm的优化第40-41页
     ·RT-PCR反应体系中Mg~(2+)的优化第41页
     ·RT-PCR反应体系中dNTPs的优化第41-42页
     ·RT-PCR反应体系中引物浓度的优化第42-43页
     ·RT-PCR反应体系中Taq DNA聚合酶的优化第43页
     ·优化反应条件和反应体系后建立的RT-PCR检测方法第43-44页
   ·CGRV RT-LAMP检测方法建立及反应条件优化结果第44-50页
     ·RT-LAMP反应体系中反应时间的优化第44-45页
     ·RT-LAMP反应体系中反应温度的优化第45-46页
     ·RT-LAMP反应体系中Mg~(2+)浓度的优化第46页
     ·RT-LAMP反应体系中dNTPs浓度的优化第46-47页
     ·RT-LAMP反应体系中内外引物浓度和比例的优化第47-48页
     ·RT-LAMP反应体系中Bst DNA聚合酶浓度的优化第48-49页
     ·优化反应条件和反应体系后建立的LAMP检测方法第49-50页
   ·RT-LAMP与RT-PCR方法检测CGRV特异性比较第50-51页
   ·RT-PCR和RT-LAMP检测CGRV敏感性比较第51-52页
   ·试验样品检验结果第52页
5 讨论第52-57页
   ·RNA提取第52-53页
   ·RT-LAMP反应体系的分析第53-55页
     ·LAMP引物的确定第53-54页
     ·Bst DNA聚合酶对LAMP反应的影响第54页
     ·Mg~(2+)浓度对LAMP反应的影响第54-55页
     ·温度对LAMP反应的影响第55页
   ·关于试验样品处理结果第55页
   ·RT-PCR和RT-LAMP检测方法建立比较第55-57页
参考文献第57-63页
致谢第63页

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