草原湿地土壤细菌和氨氧化细菌群落结构分析
| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-12页 |
| 一 引言 | 第12-24页 |
| ·湿地的生态功能与效益 | 第12-14页 |
| ·湿地的生态功能 | 第12-14页 |
| ·湿地的水文功能 | 第12页 |
| ·湿地的生物地球化学功能 | 第12-13页 |
| ·湿地有丰富的生物多样性 | 第13-14页 |
| ·湿地的生态效益和经济效益 | 第14页 |
| ·湿地的生态效益 | 第14页 |
| ·湿地的经济效益 | 第14页 |
| ·湿地氮素循环及氮素微生物研究现状 | 第14-16页 |
| ·湿地氮素循环 | 第14-15页 |
| ·氮素微生物研究现状 | 第15-16页 |
| ·锡林郭勒草原湿地的特点 | 第16-17页 |
| ·土壤微生物多态性的研究手段 | 第17-24页 |
| ·磷脂脂肪酸分析方法 | 第18-19页 |
| ·变性梯度凝胶电泳技术(DGGE) | 第19-20页 |
| ·末端限制性片段长度多态性(T-RFLP) | 第20页 |
| ·扩增性rDNA限制性酶切片段 | 第20-21页 |
| ·限制性片段长度多态性 | 第21页 |
| ·随机引物扩增多态性 | 第21页 |
| ·单链构象多态性 | 第21-22页 |
| ·PhyloChip~(TM)芯片 | 第22页 |
| ·Geochip~(TM)芯片 | 第22-24页 |
| 二 研究材料及研究方法 | 第24-34页 |
| ·研究材料 | 第24-28页 |
| ·供试样品及其理化性质 | 第24-25页 |
| ·主要药品和试剂 | 第25-27页 |
| ·DNA提取所需试剂 | 第25-26页 |
| ·琼脂糖凝胶电泳所需试剂 | 第26页 |
| ·PCR用药品 | 第26页 |
| ·DGGE用药品 | 第26-27页 |
| ·培养基 | 第27页 |
| ·试剂盒 | 第27页 |
| ·主要实验仪器 | 第27-28页 |
| ·研究方法 | 第28-34页 |
| ·湿地土壤DNA提取 | 第28-29页 |
| ·DGGE测定方法 | 第29-31页 |
| ·准备试剂 | 第29页 |
| ·准备胶板 | 第29-30页 |
| ·灌胶 | 第30页 |
| ·装配电泳槽架 | 第30-31页 |
| ·电泳 | 第31页 |
| ·染色以及照胶 | 第31页 |
| ·Quantity One软件使用 | 第31页 |
| ·克隆测序 | 第31-34页 |
| ·PCR扩增目的片段 | 第31-32页 |
| ·琼脂糖凝胶电泳中回收目的片段 | 第32页 |
| ·目的片段与载体连接 | 第32页 |
| ·转化 | 第32页 |
| ·测序 | 第32-34页 |
| 三 湿地土壤细菌群落结构分析 | 第34-40页 |
| ·细菌菌群的16S RRNA基因的PCR扩增 | 第34-35页 |
| ·PCR反应体系 | 第34页 |
| ·PCR反应条件 | 第34-35页 |
| ·湿地细菌16SRDNA-DGGE | 第35-36页 |
| ·DGGE | 第35页 |
| ·DGGE图谱分析 | 第35-36页 |
| ·主要结果 | 第36-38页 |
| ·DGGE图谱 | 第36页 |
| ·DGGE多样性指数 | 第36-37页 |
| ·DGGE条带的聚类分析 | 第37-38页 |
| ·讨论 | 第38-40页 |
| 四 湿地土壤AOB群落结构分析 | 第40-46页 |
| ·对湿地AOB的16S RRNA基因的PCR扩增 | 第40-41页 |
| ·PCR反应体系 | 第40页 |
| ·PCR反应条件 | 第40-41页 |
| ·湿地AOB的16S RDNA-DGGE | 第41-42页 |
| ·DGGE | 第41页 |
| ·DGGE图谱分析 | 第41-42页 |
| ·主要结果 | 第42-44页 |
| ·DGGE图谱 | 第42页 |
| ·DGGE多样性指数 | 第42-43页 |
| ·DGGE条带的聚类分析 | 第43-44页 |
| ·讨论 | 第44-46页 |
| 五 湿地土壤AOB的系统发育分析 | 第46-50页 |
| ·切胶、构建系统发育树 | 第46页 |
| ·核苷酸NCBI登录号 | 第46-47页 |
| ·主要结果 | 第47-49页 |
| ·测序结果 | 第47-48页 |
| ·构建的AOB系统发育树图谱 | 第48-49页 |
| ·讨论 | 第49-50页 |
| 六 结论与展望 | 第50-52页 |
| ·结论 | 第50-51页 |
| ·展望 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-59页 |
| 攻读硕士期间发表的学术论文 | 第59-60页 |
| 致谢 | 第60页 |
